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来自肯尼亚基利菲的2型登革病毒株的全基因组序列

Complete Genome Sequences of Dengue Virus Type 2 Strains from Kilifi, Kenya.

作者信息

Kamau Everlyn, Agoti Charles N, Ngoi Joyce M, de Laurent Zaydah R, Gitonga John, Cotten Matthew, Phan My V T, Nokes D James, Delwart Eric, Sanders Eduard, Warimwe George M

机构信息

KEMRI-Wellcome Trust Research Programme, Kilifi, Kenya.

Department of Viroscience, Erasmus MC, Rotterdam, The Netherlands.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2019 Jan 24;8(4). doi: 10.1128/MRA.01566-18. eCollection 2019 Jan.

DOI:10.1128/MRA.01566-18
PMID:30701251
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC6346200/
Abstract

Dengue infection remains poorly characterized in Africa and little is known regarding its associated viral genetic diversity. Here, we report dengue virus type 2 (DENV-2) sequence data from 10 clinical samples, including 5 complete genome sequences of the cosmopolitan genotype, obtained from febrile adults seeking outpatient care in coastal Kenya.

摘要

在非洲，登革热感染的特征仍不清楚，关于其相关病毒基因多样性的了解也很少。在此，我们报告了来自10份临床样本的登革热2型（DENV-2）序列数据，其中包括从肯尼亚沿海寻求门诊治疗的发热成人中获得的5个泛在基因型的完整基因组序列。