• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

相似文献

1
Complete Genome Sequence and Methylome Analysis of Deinococcus wulumuqiensis 479.乌鲁木齐嗜辐射球菌479的全基因组序列和甲基化组分析
Microbiol Resour Announc. 2019 Mar 21;8(12):e00066-19. doi: 10.1128/MRA.00066-19.
2
Sequence, structure, and function of the Dps DNA-binding protein from Deinococcus wulumuqiensis R12.来自生沃氏菌 R12 的 Dps DNA 结合蛋白的序列、结构和功能。
Microb Cell Fact. 2022 Jul 2;21(1):132. doi: 10.1186/s12934-022-01857-7.
3
Complete Genome Sequence and Methylome Analysis of 65.65的全基因组序列和甲基化组分析
Genome Announc. 2017 Mar 23;5(12):e00060-17. doi: 10.1128/genomeA.00060-17.
4
Complete genome sequence and methylome analysis of bacillus strain x1.芽孢杆菌X1菌株的全基因组序列及甲基化组分析
Genome Announc. 2015 Feb 19;3(1):e01593-14. doi: 10.1128/genomeA.01593-14.
5
Finished genome sequence and methylome of the cyanide-degrading Pseudomonas pseudoalcaligenes strain CECT5344 as resolved by single-molecule real-time sequencing.通过单分子实时测序解析的氰化物降解假产碱假单胞菌菌株CECT5344的完整基因组序列和甲基化组。
J Biotechnol. 2016 Aug 20;232:61-8. doi: 10.1016/j.jbiotec.2016.04.008. Epub 2016 Apr 6.
6
Genome Sequence of a Gamma- and UV-Ray-Resistant Strain, Deinococcus wulumuqiensis R12.耐γ射线和紫外线的乌鲁木齐嗜皮菌R12菌株的基因组序列
Genome Announc. 2013 May 9;1(3):e00206-13. doi: 10.1128/genomeA.00206-13.
7
Genome-wide lone strand adenine methylation in Deinococcus radiodurans R1: Regulation of gene expression through DR0643-dependent adenine methylation.耐辐射球菌 R1 全基因组单链腺嘌呤甲基化：通过 DR0643 依赖性腺嘌呤甲基化调节基因表达。
Microbiol Res. 2022 Apr;257:126964. doi: 10.1016/j.micres.2022.126964. Epub 2022 Jan 13.
8
Deinococcus wulumuqiensis sp. nov., and Deinococcus xibeiensis sp. nov., isolated from radiation-polluted soil.新发现的土壤辐射污染微生物：沃尔姆氏球菌（Deinococcus wulumuqiensis sp. nov.）和西北氏球菌（Deinococcus xibeiensis sp. nov.）。
Int J Syst Evol Microbiol. 2010 Sep;60(Pt 9):2006-2010. doi: 10.1099/ijs.0.015917-0. Epub 2009 Oct 2.
9
Reclassification of Deinococcus xibeiensis Wang et al. 2010 as a heterotypic synonym of Deinococcus wulumuqiensis Wang et al. 2010.将2010年的西北异常球菌（Deinococcus xibeiensis Wang et al.）重新分类为2010年乌鲁木齐异常球菌（Deinococcus wulumuqiensis Wang et al.）的异名。
Int J Syst Evol Microbiol. 2015 Mar;65(Pt 3):1083-1085. doi: 10.1099/ijs.0.000058. Epub 2015 Jan 8.
10
Potential for efficient microbial remediation of Cr(VI) in wastewater using Deinococcus wulumuqiensis R12.利用 Deinococcus wulumuqiensis R12 实现废水中 Cr(VI)的高效微生物修复的潜力。
J Appl Microbiol. 2023 Jun 1;134(6). doi: 10.1093/jambio/lxad103.

引用本文的文献

1
Complete genome assembly and methylome dissection of PL15/H .PL15/H的全基因组组装与甲基化组剖析
Front Microbiol. 2023 Apr 5;14:1112734. doi: 10.3389/fmicb.2023.1112734. eCollection 2023.
2
Structural and phylogenetic analyses of resistance to next-generation aminoglycosides conferred by AAC(2') enzymes.AAC(2') 酶赋予的对下一代氨基糖苷类药物的耐药性的结构和系统发育分析。
Sci Rep. 2021 Jun 2;11(1):11614. doi: 10.1038/s41598-021-89446-3.
3
Coordination of phage genome degradation versus host genome protection by a bifunctional restriction-modification enzyme visualized by CryoEM.通过 CryoEM 可视化的双功能限制修饰酶对噬菌体基因组降解与宿主基因组保护的协调作用。
Structure. 2021 Jun 3;29(6):521-530.e5. doi: 10.1016/j.str.2021.03.012. Epub 2021 Apr 6.

本文引用的文献

1
RefSeq: an update on prokaryotic genome annotation and curation.RefSeq：原核生物基因组注释和管理的最新进展。
Nucleic Acids Res. 2018 Jan 4;46(D1):D851-D860. doi: 10.1093/nar/gkx1068.
2
NCBI prokaryotic genome annotation pipeline.美国国立生物技术信息中心原核生物基因组注释管道
Nucleic Acids Res. 2016 Aug 19;44(14):6614-24. doi: 10.1093/nar/gkw569. Epub 2016 Jun 24.
3
Complete Genome Sequence of ER2796, a DNA Methyltransferase-Deficient Strain of Escherichia coli K-12.大肠杆菌K-12 DNA甲基转移酶缺陷型菌株ER2796的全基因组序列
PLoS One. 2015 May 26;10(5):e0127446. doi: 10.1371/journal.pone.0127446. eCollection 2015.
4
REBASE--a database for DNA restriction and modification: enzymes, genes and genomes.REBASE——一个关于DNA限制与修饰的数据库：酶、基因与基因组。
Nucleic Acids Res. 2015 Jan;43(Database issue):D298-9. doi: 10.1093/nar/gku1046. Epub 2014 Nov 5.
5
Nonhybrid, finished microbial genome assemblies from long-read SMRT sequencing data.非杂交、基于长读长 SMRT 测序数据的完成微生物基因组组装。
Nat Methods. 2013 Jun;10(6):563-9. doi: 10.1038/nmeth.2474. Epub 2013 May 5.
6
Going beyond five bases in DNA sequencing.超越 DNA 测序的五个碱基。
Curr Opin Struct Biol. 2012 Jun;22(3):251-61. doi: 10.1016/j.sbi.2012.04.002. Epub 2012 May 9.
7
Characterization of DNA methyltransferase specificities using single-molecule, real-time DNA sequencing.利用单分子实时 DNA 测序技术对 DNA 甲基转移酶特异性进行表征。
Nucleic Acids Res. 2012 Feb;40(4):e29. doi: 10.1093/nar/gkr1146. Epub 2011 Dec 7.
8
Direct detection of DNA methylation during single-molecule, real-time sequencing.单分子实时测序中 DNA 甲基化的直接检测。
Nat Methods. 2010 Jun;7(6):461-5. doi: 10.1038/nmeth.1459. Epub 2010 May 9.
9
Reassembly of shattered chromosomes in Deinococcus radiodurans.耐辐射球菌中破碎染色体的重新组装
Nature. 2006 Oct 5;443(7111):569-73. doi: 10.1038/nature05160. Epub 2006 Sep 27.
10
Studies on lysogenesis. I. The mode of phage liberation by lysogenic Escherichia coli.溶源性研究。I. 溶源性大肠杆菌释放噬菌体的方式。
J Bacteriol. 1951 Sep;62(3):293-300. doi: 10.1128/jb.62.3.293-300.1951.

乌鲁木齐嗜辐射球菌479的全基因组序列和甲基化组分析

Complete Genome Sequence and Methylome Analysis of Deinococcus wulumuqiensis 479.

作者信息

Fomenkov Alexey, Luyten Yvette, Vincze Tamas, Anton Brian P, Roberts Richard J, Morgan Richard D

机构信息

New England Biolabs Inc., Ipswich, Massachusetts, USA

New England Biolabs Inc., Ipswich, Massachusetts, USA.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2019 Mar 21;8(12):e00066-19. doi: 10.1128/MRA.00066-19.

DOI:10.1128/MRA.00066-19
PMID:30938698
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC6430315/
Abstract

479 (formerly known as 479) is the original source strain for the restriction enzyme DrdI. Its complete sequence and full methylome were determined using Pacific Biosciences single-molecule real-time (SMRT) sequencing.

摘要

479（以前称为479）是限制性内切酶DrdI的原始来源菌株。使用太平洋生物科学公司的单分子实时（SMRT）测序技术测定了其完整序列和全甲基化组。