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一种在蓝莓植株上发现的具有绿斑驳症状的新葡萄病毒的分子特征。

Molecular characterization of a new vitivirus discovered in a blueberry plant with green mosaic symptoms.

机构信息

Department of Crop Sciences, University of Illinois Urbana-Champaign, Urbana, IL, 61801, USA.

Division of Agriculture, Department of Plant Pathology, University of Arkansas System, Fayetteville, AR, 72701, USA.

出版信息

Arch Virol. 2019 Oct;164(10):2609-2611. doi: 10.1007/s00705-019-04344-4. Epub 2019 Jul 16.

DOI:10.1007/s00705-019-04344-4
PMID:31312966
Abstract

A new virus belonging to the genus Vitivirus in the family Betaflexiviridae was identified by next-generation sequencing of a blueberry plant showing green mosaic symptoms. The genome organization of the virus, which is tentatively named "blueberry green mosaic-associated virus" (BGMaV), is typical of vitiviruses, with five open reading frames (ORFs) and a polyadenylated 3' terminus. The ORFs code for the viral replicase, a 16K protein of unknown function, a movement protein, a coat protein (CP), and a nucleic acid binding protein. Phylogenetic analyses based on the deduced amino acid sequence of the CP and conserved motifs of the RNA-dependent RNA polymerase confirmed the taxonomic placement of BGMaV in the genus Vitivirus.

摘要

通过对表现出绿斑症状的蓝莓植株进行下一代测序,发现了一种属于贝塔柔病毒科葡萄病毒属的新病毒。该病毒的基因组组织,暂命名为“蓝莓绿斑伴随病毒”(BGMaV),是典型的葡萄病毒,具有五个开放阅读框(ORFs)和一个聚腺苷酸化的 3'末端。ORFs 编码病毒复制酶、一个功能未知的 16K 蛋白、运动蛋白、外壳蛋白(CP)和核酸结合蛋白。基于 CP 的推导氨基酸序列和 RNA 依赖的 RNA 聚合酶的保守基序的系统发育分析证实了 BGMaV 在葡萄病毒属中的分类地位。

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