• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

一种中国特有的观赏植物——棣棠花(蔷薇科)的完整叶绿体基因组。

The complete chloroplast genome of a Chinese endemic ornamental plant Koehne (Rosaceae).

作者信息

Niu Zhengyang, Xiong Zhongren, Xi Lianlian, Chen Xin

机构信息

Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, College of Biology and the Environment, Nanjing Forestry University, Nanjing, People's Republic of China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Jul 11;4(2):2227-2228. doi: 10.1080/23802359.2019.1624632.

DOI:10.1080/23802359.2019.1624632
PMID:33365486
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7687415/
Abstract

is a pinnate-leaved deciduous shrub growing in mixed forests in Sichuan province, China. It is one of the least known species in the genus with high ornamental value. In this study, we firstly assembled and annotated the complete chloroplast genome of the species using the next-generation sequencing method. The results showed that the chloroplast genome size is 159,900 bp, comprising of a large single-copy (LSC) region of 87,888 bp, a small single-copy (SSC) region of 19,256 bp, and a pair of IR regions of 26,378 bp. The whole cp genome predicted 109 genes in total, including 76 protein-coding genes, 29 tRNAs, and 4 tRNAs. The overall GC content of the chloroplast genome is 36.6%. The phylogenetic relationship exhibited that is closely clustered with in .

摘要

是一种生长在中国四川省混交林中的羽状叶落叶灌木。它是该属中鲜为人知但具有高观赏价值的物种之一。在本研究中,我们首先使用下一代测序方法组装并注释了该物种的完整叶绿体基因组。结果表明,叶绿体基因组大小为159,900 bp,由一个87,888 bp的大单拷贝(LSC)区域、一个19,256 bp的小单拷贝(SSC)区域和一对26,378 bp的IR区域组成。整个叶绿体基因组共预测出109个基因,包括76个蛋白质编码基因、29个tRNA和4个tRNA。叶绿体基因组的总体GC含量为36.6%。系统发育关系表明,在……中,……与……紧密聚类。 (注:原文中部分物种名缺失,翻译时保留原文格式)

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8ff/7687415/4cdf8293012b/TMDN_A_1624632_F0001_C.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8ff/7687415/4cdf8293012b/TMDN_A_1624632_F0001_C.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8ff/7687415/4cdf8293012b/TMDN_A_1624632_F0001_C.jpg

相似文献

1
The complete chloroplast genome of a Chinese endemic ornamental plant Koehne (Rosaceae).一种中国特有的观赏植物——棣棠花(蔷薇科)的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Jul 11;4(2):2227-2228. doi: 10.1080/23802359.2019.1624632.
2
The complete chloroplast genome sequence of (Rosaceae).(蔷薇科)的完整叶绿体基因组序列。
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 May 27;5(3):2184-2185. doi: 10.1080/23802359.2020.1768951. eCollection 2020.
3
The complete genome sequence of (Rosaceae: Amygdaloideae), an epiphytic shrub in this genus.该属一种附生灌木(蔷薇科:桃亚科)的全基因组序列。
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Aug 26;5(3):3239-3240. doi: 10.1080/23802359.2020.1810150.
4
Chloroplast genome features and phylogenomic placement of var. (Rosaceae).(蔷薇科)变种的叶绿体基因组特征及系统发育定位
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Mar 18;6(3):1068-1070. doi: 10.1080/23802359.2021.1899859.
5
The complete chloroplast genome sequence of (Rosaceae).(蔷薇科)的完整叶绿体基因组序列。
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jul 14;5(3):2787-2789. doi: 10.1080/23802359.2020.1780977.
6
Characterization of the complete chloroplast genome of ..的完整叶绿体基因组特征分析。 (你提供的原文不完整,缺少具体物种名称等关键信息,以上是根据现有内容给出的翻译。)
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 May 14;5(3):2051-2053. doi: 10.1080/23802359.2020.1763216.
7
The complete chloroplast genome sequence of from Sichuan province, China, a medicinal plant and phylogenetic analysis.来自中国四川省的一种药用植物的完整叶绿体基因组序列及系统发育分析。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Nov 24;6(12):3466-3467. doi: 10.1080/23802359.2021.2002204. eCollection 2021.
8
The complete chloroplast genome of (Hydrangeaceae).绣球花科(Hydrangeaceae)植物的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Oct 21;5(3):3605-3607. doi: 10.1080/23802359.2020.1828001.
9
The complete chloroplast genome sequence of Maddenia hypoleuca koehne (Prunoideae, Rosaceae).川西稠李(蔷薇科李亚科)的完整叶绿体基因组序列
Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal. 2016 Nov;27(6):4651-4652. doi: 10.3109/19401736.2015.1106486. Epub 2015 Dec 28.
10
Characteristics and phylogenetic analysis of the complete chloroplast genome of (Rosaceae).(蔷薇科)叶绿体全基因组的特征及系统发育分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Sep 2;7(9):1579-1580. doi: 10.1080/23802359.2022.2107457. eCollection 2022.

引用本文的文献

1
The complete chloroplast genome of (Cardot) N.P.Balakr. 1970 (Rosaceae) and its phylogenetic analysis.(卡多特)N.P. 巴拉克尔1970年(蔷薇科)的完整叶绿体基因组及其系统发育分析。
Mitochondrial DNA B Resour. 2025 May 16;10(6):490-494. doi: 10.1080/23802359.2025.2503398. eCollection 2025.
2
The complete chloroplast genome sequence of (Rosaceae).(蔷薇科)的完整叶绿体基因组序列。
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 May 27;5(3):2184-2185. doi: 10.1080/23802359.2020.1768951. eCollection 2020.

本文引用的文献

1
Evolution of Rosaceae Fruit Types Based on Nuclear Phylogeny in the Context of Geological Times and Genome Duplication.基于地质时期和基因组复制背景下核系统发育的蔷薇科果实类型演化
Mol Biol Evol. 2017 Feb 1;34(2):262-281. doi: 10.1093/molbev/msw242.
2
Bandage: interactive visualization of de novo genome assemblies.绷带:从头基因组组装的交互式可视化
Bioinformatics. 2015 Oct 15;31(20):3350-2. doi: 10.1093/bioinformatics/btv383. Epub 2015 Jun 22.
3
RAxML version 8: a tool for phylogenetic analysis and post-analysis of large phylogenies.
RAxML 版本 8:用于系统发育分析和大型系统发育后分析的工具。
Bioinformatics. 2014 May 1;30(9):1312-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btu033. Epub 2014 Jan 21.
4
MAFFT multiple sequence alignment software version 7: improvements in performance and usability.MAFFT 多序列比对软件版本 7:性能和易用性的改进。
Mol Biol Evol. 2013 Apr;30(4):772-80. doi: 10.1093/molbev/mst010. Epub 2013 Jan 16.
5
Geneious Basic: an integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data.Geneious Basic:一个集成和可扩展的桌面软件平台,用于组织和分析序列数据。
Bioinformatics. 2012 Jun 15;28(12):1647-9. doi: 10.1093/bioinformatics/bts199. Epub 2012 Apr 27.
6
MrBayes 3.2: efficient Bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space.MrBayes 3.2:在大型模型空间中进行高效的贝叶斯系统发育推断和模型选择。
Syst Biol. 2012 May;61(3):539-42. doi: 10.1093/sysbio/sys029. Epub 2012 Feb 22.
7
BLAST+: architecture and applications.BLAST+:体系结构与应用。
BMC Bioinformatics. 2009 Dec 15;10:421. doi: 10.1186/1471-2105-10-421.