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罗克斯伯勒氏(番荔枝科)的完整叶绿体基因组。

The complete chloroplast genome of Roxb. (Annonaceae).

作者信息

Wu Qiaohua, Liu Xiaojuan, Chen Yile, Zhang Deyu, Dai Seping

机构信息

Guangzhou Institute of Forestry and Landscape Architecture, Guangzhou, China.

Landscaping company of Guangzhou, Guangzhou, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Sep 17;4(2):3012-3013. doi: 10.1080/23802359.2019.1659108.

DOI:10.1080/23802359.2019.1659108
PMID:33365833
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7706897/
Abstract

(Annonaceae) is an erect shrub with multiple medicinal properties. In this study, we report the complete chloroplast genome of , assembled from whole-genome high-throughput sequencing reads, as a resource for future studies on the phylogeny and evolution of Annonaceae. The chloroplast genome was 192,782 bp in length, with a large single-copy (LSC) region of 83,581 bp, a small single-copy (SSC) region of 3,741 bp, separated by two inverted repeat (IR) regions of 52,730 bp each. It was predicted to contain 151 genes, with an overall GC content of 38.7%. Phylogenetic analysis of 105 protein-coding sequences of 13 plant plastomes showed that is closest to .

摘要

番荔枝科是一种具有多种药用特性的直立灌木。在本研究中,我们报道了通过全基因组高通量测序读段组装得到的[番荔枝科某植物]的完整叶绿体基因组,作为未来番荔枝科系统发育和进化研究的资源。叶绿体基因组长度为192,782 bp,有一个83,581 bp的大单拷贝(LSC)区域、一个3,741 bp的小单拷贝(SSC)区域,由两个各为52,730 bp的反向重复(IR)区域隔开。预计它包含151个基因,总体GC含量为38.7%。对13个植物质体基因组的105个蛋白质编码序列进行的系统发育分析表明,[番荔枝科某植物]与[另一植物]关系最密切。

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