• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

来自中国广西的(Willd.)普雷恩(豆科)的完整叶绿体基因组。

The complete chloroplast genome of (Willd.) Prain (Fabaceae) from Guangxi, China.

作者信息

Qin Xin-Mei, Li Hong, Cui Nan, Jiang Shui-Yuan, Liang Yan-Ni, Wang Man-Lian, Huang Xi-Yang

机构信息

Guangxi Key Laboratory of Functional Phytochemicals Research and Utilization, Guangxi Institute of Botany, Guangxi Zhuang Autonomous Region and Chinese Academy of Sciences, Guilin, China.

Wuzhou University, College of Chemical Engineering and Resource Reuse, Wuzhou, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Nov 10;6(12):3378-3380. doi: 10.1080/23802359.2021.1997124. eCollection 2021.

DOI:10.1080/23802359.2021.1997124
PMID:34778558
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8583843/
Abstract

(Willd.) Prain is an ethnomedicinal plant with high nutritional and medicinal values. In this study, we report the complete chloroplast genome of . The chloroplast genome has a typical quadripartite structure with a genome size of 152,988 bp, including a large single-copy (LSC) of 83,634 bp, a small single-copy (SSC) of 17,774 bp and two inverted repeats (IRs) of 25,790 bp. The genome contains 129 genes, including 84 protein-coding, 37 tRNA and 8 rRNA genes. The overall GC content is 35.1%. Phylogenetic analysis showed that grouped with a clade containing the genera of , , , and in Fabaceae. This study provides essential data and insight for understanding the phylogenetic placement of .

摘要

(威尔德)普拉因是一种具有高营养价值和药用价值的民族药用植物。在本研究中,我们报道了……的完整叶绿体基因组。叶绿体基因组具有典型的四分体结构,基因组大小为152,988 bp,包括一个83,634 bp的大单拷贝(LSC)、一个17,774 bp的小单拷贝(SSC)和两个25,790 bp的反向重复序列(IR)。该基因组包含129个基因,包括84个蛋白质编码基因、37个tRNA基因和8个rRNA基因。总体GC含量为35.1%。系统发育分析表明,……与豆科中包含……属、……属、……属、……属和……属的一个分支聚在一起。本研究为理解……的系统发育位置提供了重要数据和见解。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/1e30/8583843/f840b31ccf5d/TMDN_A_1997124_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/1e30/8583843/f840b31ccf5d/TMDN_A_1997124_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/1e30/8583843/f840b31ccf5d/TMDN_A_1997124_F0001_B.jpg

相似文献

1
The complete chloroplast genome of (Willd.) Prain (Fabaceae) from Guangxi, China.来自中国广西的(Willd.)普雷恩(豆科)的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Nov 10;6(12):3378-3380. doi: 10.1080/23802359.2021.1997124. eCollection 2021.
2
The complete chloroplast genome of Vahl.瓦尔(Vahl.)的完整叶绿体基因组
Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Oct 21;7(10):1845-1847. doi: 10.1080/23802359.2022.2134749. eCollection 2022.
3
The complete chloroplast genome of ..的完整叶绿体基因组
Mitochondrial DNA B Resour. 2017 Jul 11;2(2):395-396. doi: 10.1080/23802359.2017.1347831.
4
The complete chloroplast genome of , a rare and endemic herb in Guangxi, China.中国广西一种珍稀特有草本植物的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jun 5;5(3):2324-2325. doi: 10.1080/23802359.2020.1773336.
5
The complete chloroplast genome of Roxb. ex Ait. 1812 (Phaseoleae, Fabaceae).罗克斯伯(Roxb.)于1812年(豆科菜豆族)发表的植物的完整叶绿体基因组。 (注:这里的Roxb. ex Ait. 1812表述不太完整清晰,推测可能是指某种植物最初由Roxb.发现,后由Ait. 1812年正式发表等情况,但按要求未添加解释。)
Mitochondrial DNA B Resour. 2024 Aug 6;9(8):1000-1004. doi: 10.1080/23802359.2024.2387251. eCollection 2024.
6
Complete chloroplast genome data of (Engkabang): Structural features, comparative and phylogenetic analysis.(Engkabang)的完整叶绿体基因组数据:结构特征、比较与系统发育分析。
Data Brief. 2023 Mar 4;47:109029. doi: 10.1016/j.dib.2023.109029. eCollection 2023 Apr.
7
The complete chloroplast genome of , an edible and medicinal dual-purpose wild plant.一种可食用且具有药用双重用途的野生植物的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Jan 24;7(1):228-230. doi: 10.1080/23802359.2021.2013740. eCollection 2022.
8
The complete chloroplast genome of (Fabaceae), a traditional Chinese medicinal plant.豆科一种传统中药材的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Mar 9;7(3):474-475. doi: 10.1080/23802359.2022.2050472. eCollection 2022.
9
The complete chloroplast genome sequence of Kom. (Aristolochiaceae).马兜铃科北马兜铃的完整叶绿体基因组序列
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Oct 11;4(2):3515-3516. doi: 10.1080/23802359.2019.1675484.
10
The complete chloroplast genome of Roxb. (Annonaceae).罗克斯伯勒氏(番荔枝科)的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Sep 17;4(2):3012-3013. doi: 10.1080/23802359.2019.1659108.

引用本文的文献

1
High-quality assembly of the chromosomal genome for Flemingia macrophylla reveals genomic structural characteristics.大叶千斤拔染色体基因组的高质量组装揭示了基因组结构特征。
BMC Genomics. 2025 May 26;26(1):535. doi: 10.1186/s12864-025-11705-8.
2
The complete chloroplast genome of Roxb. ex Ait. 1812 (Phaseoleae, Fabaceae).罗克斯伯(Roxb.)于1812年(豆科菜豆族)发表的植物的完整叶绿体基因组。 (注:这里的Roxb. ex Ait. 1812表述不太完整清晰,推测可能是指某种植物最初由Roxb.发现,后由Ait. 1812年正式发表等情况,但按要求未添加解释。)
Mitochondrial DNA B Resour. 2024 Aug 6;9(8):1000-1004. doi: 10.1080/23802359.2024.2387251. eCollection 2024.

本文引用的文献

1
Nuclear phylotranscriptomics and phylogenomics support numerous polyploidization events and hypotheses for the evolution of rhizobial nitrogen-fixing symbiosis in Fabaceae.核种系转录组学和种系基因组学支持豆科植物根瘤菌固氮共生进化的多个多倍体化事件和假说。
Mol Plant. 2021 May 3;14(5):748-773. doi: 10.1016/j.molp.2021.02.006. Epub 2021 Feb 22.
2
Twelve years of SAMtools and BCFtools.SAMtools 和 BCFtools 十二年。
Gigascience. 2021 Feb 16;10(2). doi: 10.1093/gigascience/giab008.
3
Plastid genomics of (Solanaceae): insights into molecular evolution, positive selection and the origin of the maternal genome of Aztec tobacco ().
茄科植物的质体基因组学:对分子进化、正选择以及阿兹特克烟草母本基因组起源的见解
PeerJ. 2020 Jul 23;8:e9552. doi: 10.7717/peerj.9552. eCollection 2020.
4
Comparative Plastomics of Ashwagandha (, Solanaceae) and Identification of Mutational Hotspots for Barcoding Medicinal Plants.印度人参(茄科)的比较质体基因组学及药用植物条形码突变热点的鉴定
Plants (Basel). 2020 Jun 15;9(6):752. doi: 10.3390/plants9060752.
5
Complete chloroplast genome of (Papilionoideae): molecular structures, comparative genome analysis and phylogenetic analysis.(蝶形花亚科)的完整叶绿体基因组:分子结构、比较基因组分析和系统发育分析。
J Genet. 2020;99.
6
PGA: a software package for rapid, accurate, and flexible batch annotation of plastomes.PGA:一个用于叶绿体基因组快速、准确且灵活批量注释的软件包。
Plant Methods. 2019 May 21;15:50. doi: 10.1186/s13007-019-0435-7. eCollection 2019.
7
fastp: an ultra-fast all-in-one FASTQ preprocessor.fastp:一个超快速的一体化 FASTQ 预处理程序。
Bioinformatics. 2018 Sep 1;34(17):i884-i890. doi: 10.1093/bioinformatics/bty560.
8
IRscope: an online program to visualize the junction sites of chloroplast genomes.IRscope:一个可视化叶绿体基因组连接点的在线程序。
Bioinformatics. 2018 Sep 1;34(17):3030-3031. doi: 10.1093/bioinformatics/bty220.
9
RAxML version 8: a tool for phylogenetic analysis and post-analysis of large phylogenies.RAxML 版本 8:用于系统发育分析和大型系统发育后分析的工具。
Bioinformatics. 2014 May 1;30(9):1312-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btu033. Epub 2014 Jan 21.
10
SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing.SPAdes:一种新的基因组组装算法及其在单细胞测序中的应用
J Comput Biol. 2012 May;19(5):455-77. doi: 10.1089/cmb.2012.0021. Epub 2012 Apr 16.