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(1833年,耶格)的完整线粒体基因组。

The complete mitochondrial genome of (Jaeger,1833).

作者信息

Sun Yi, Ding Beichen, Guo Chao, Han Rui, Li Junhao, Rong Feixiang, Ding Jun

机构信息

Key Laboratory of Mariculture and Stock Enhancement in North China's Sea, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Dalian Ocean University, Dalian, 116023, P. R. China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Dec 9;5(1):33-34. doi: 10.1080/23802359.2019.1691950.

DOI:10.1080/23802359.2019.1691950
PMID:33366409
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7720973/
Abstract

In this study, the complete mitochondrial genome of was sequenced on an Illumina platform and assembled using NovoPlasty v. 2.7.1. It was submitted to NCBI GenBank and is available with accession number MN542416. The genome was 15,827 bp in size and contains 22 tRNA genes, 12 protein-coding genes, and 2 rRNA genes. The composition of A + T in mtDNA was 60.30%. Except ND6 and 5 tRNAs, the others are not on the H-strand. The phylogenetic relationship of 13 species of sea cucumber were analyzed using the neighbor-joining method by software MEGA5.0. was most closely related to .

摘要

在本研究中,在Illumina平台上对[物种名称未给出]的完整线粒体基因组进行了测序,并使用NovoPlasty v. 2.7.1进行组装。它已提交至NCBI GenBank,登录号为MN542416。该基因组大小为15,827 bp,包含22个tRNA基因、12个蛋白质编码基因和2个rRNA基因。[物种名称未给出]线粒体DNA中A+T的组成比例为60.30%。除了ND6和5个tRNA外,其他基因不在重链上。使用软件MEGA5.0通过邻接法分析了13种海参的系统发育关系。[物种名称未给出]与[物种名称未给出]关系最为密切。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/095e/7720973/f966aa25e9b0/TMDN_A_1691950_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/095e/7720973/f966aa25e9b0/TMDN_A_1691950_F0001_B.jpg
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