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一种与巨蛤共生的虾(十足目:真虾下目:长臂虾科)线粒体基因组的序列和系统发育分析

Sequence and phylogenetic analysis of the mitochondrial genome for a giant clam commensal shrimp (Decapoda: Caridea: Palaemonidae).

作者信息

Liu Helu

机构信息

Institute of Deep-sea Science and Engineering, Chinese Academy of Sciences, Sanya, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Dec 18;5(1):312-313. doi: 10.1080/23802359.2019.1700839.

DOI:10.1080/23802359.2019.1700839
PMID:33366534
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7748706/
Abstract

The shrimp was a giant clam commensal species. Here, we explored in detail its mitochondrial (mt) genome, which was 15,396 bp in length, containing 13 protein-coding genes, 2 ribosomal RNA genes, 21 transfer RNA genes, and a non-coding control region 429 bp in length. The overall mt genome organization of displayed the typical characters for the pancrustacean ground pattern, with exception of translocation of and , as well as deletion of . Phylogenetic analysis confirmed its evolutionary relatedness to other shrimp of family Palaemonidae within Infraorder Caridea.

摘要

这种虾是一种与巨蛤共生的物种。在此,我们详细探究了其线粒体(mt)基因组,该基因组长度为15396 bp,包含13个蛋白质编码基因、2个核糖体RNA基因、21个转运RNA基因以及一个长度为429 bp的非编码控制区。该线粒体基因组的整体组织呈现出泛甲壳动物基本模式的典型特征,但存在 和 的易位以及 的缺失。系统发育分析证实了它与真虾下目长臂虾科其他虾类在进化上的相关性。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a234/7748706/33bf2eec2f64/TMDN_A_1700839_F0001_B.jpg
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