• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

使用GetOrganelle工具包组装列当属(列当科)的完整线粒体基因组。

assembling a complete mitochondrial genome of (Orobanchaceae) using GetOrganelle toolkit.

作者信息

Li Xin, Lin Chun-Yan, Yang Jun-Bo, Yu Wen-Bin

机构信息

Center for Integrative Conservation, Xishuangbanna Tropical Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences, Mengla, Yunnan, China.

University of Chinese Academy of Sciences, Shijingshan District, Beijing, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Feb 3;5(1):1056-1057. doi: 10.1080/23802359.2020.1722038.

DOI:10.1080/23802359.2020.1722038
PMID:33366872
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7748611/
Abstract

We reported the first mitogenome of from (Orobanchaceae), which is endemic to SW China. The complete mitochondrial genome (mitogenome or chondriome) was a single circular chromosome that was 219,859 bp in length. It contains 56 genes, including 34 protein-coding ( and with two copies), 19 transfer RNA (tRNA), and three ribosomal RNA (rRNA) genes. Phylogenetic analysis showed that was closely related to .

摘要

我们报道了来自中国西南部特有的列当科植物的首个线粒体基因组。完整的线粒体基因组(线粒体基因组或线粒体基因组)是一条单环状染色体,长度为219,859 bp。它包含56个基因,包括34个蛋白质编码基因(其中两个基因有两个拷贝)、19个转运RNA(tRNA)和3个核糖体RNA(rRNA)基因。系统发育分析表明,该植物与[另一植物名称]密切相关。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/af66/7748611/5ee25a523439/TMDN_A_1722038_F0001_C.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/af66/7748611/5ee25a523439/TMDN_A_1722038_F0001_C.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/af66/7748611/5ee25a523439/TMDN_A_1722038_F0001_C.jpg

相似文献

1
assembling a complete mitochondrial genome of (Orobanchaceae) using GetOrganelle toolkit.使用GetOrganelle工具包组装列当属(列当科)的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Feb 3;5(1):1056-1057. doi: 10.1080/23802359.2020.1722038.
2
Comprehensive Analysis of the Complete Mitochondrial Genome of : An Autotrophic Species in the Orobanchaceae Family.全面分析列当科的自养物种:的完整线粒体基因组。
Genes (Basel). 2024 Jan 15;15(1):98. doi: 10.3390/genes15010098.
3
Characterization of the complete chloroplast genome of (Orobanchaceae), an endemic species of China.中国特有物种肉苁蓉(列当科)叶绿体全基因组特征分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Jan 24;7(1):251-252. doi: 10.1080/23802359.2022.2025933. eCollection 2022.
4
The complete chloroplast genomes of two species (Orobanchaceae) from Southwest China.来自中国西南部的两种列当科植物的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Jun 10;7(6):971-973. doi: 10.1080/23802359.2022.2080018. eCollection 2022.
5
The complete chloroplast genome of hemi-parasitic (Orobanchaceae).半寄生植物(列当科)的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2018 Feb 12;3(1):235-236. doi: 10.1080/23802359.2018.1437820.
6
The complete mitochondrial genome of the king horseshoe bat (Rhinolophus rex) using next-generation sequencing and Sanger sequencing.利用二代测序和桑格测序技术获得的大足鼠耳蝠(Rhinolophus rex)线粒体全基因组。
Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal. 2016 Nov;27(6):4545-4546. doi: 10.3109/19401736.2015.1101555. Epub 2015 Nov 5.
7
Limited mitogenomic degradation in response to a parasitic lifestyle in Orobanchaceae.对列当科寄生生活方式的有限的线粒体基因组退化。
Sci Rep. 2016 Nov 3;6:36285. doi: 10.1038/srep36285.
8
GetOrganelle: a fast and versatile toolkit for accurate de novo assembly of organelle genomes.GetOrganelle:一个快速且通用的工具包,可用于准确从头组装细胞器基因组。
Genome Biol. 2020 Sep 10;21(1):241. doi: 10.1186/s13059-020-02154-5.
9
Characterization of the complete chloroplast genome of (Rhinantheae).(鼻花族)叶绿体全基因组的特征分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Oct 9;4(2):3439-3440. doi: 10.1080/23802359.2019.1673254.
10
High mountain origin, phylogenetics, evolution, and niche conservatism of arctic lineages in the hemiparasitic genus Pedicularis (Orobanchaceae).半寄生马先蒿属(列当科)北极谱系的高山起源、系统发育、进化及生态位保守性
Mol Phylogenet Evol. 2014 Jul;76:75-92. doi: 10.1016/j.ympev.2014.03.004. Epub 2014 Mar 12.

引用本文的文献

1
Comprehensive analysis of the first complete mitogenome and plastome of a traditional Chinese medicine Viola diffusa.对传统中药白花地丁首个完整线粒体基因组和叶绿体基因组的综合分析。
BMC Genomics. 2024 Dec 2;25(1):1162. doi: 10.1186/s12864-024-11086-4.
2
Characterization of the complete chloroplast genome of (Orobanchaceae), an endemic species of China.中国特有物种肉苁蓉(列当科)叶绿体全基因组特征分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Jan 24;7(1):251-252. doi: 10.1080/23802359.2022.2025933. eCollection 2022.
3
Characterization of the complete mitochondrial genome of Song 1977 (Hirudiniformes, Haemadipsidae) and its phylogenetic analysis.

本文引用的文献

1
GetOrganelle: a fast and versatile toolkit for accurate de novo assembly of organelle genomes.GetOrganelle:一个快速且通用的工具包,可用于准确从头组装细胞器基因组。
Genome Biol. 2020 Sep 10;21(1):241. doi: 10.1186/s13059-020-02154-5.
2
Genome skimming herbarium specimens for DNA barcoding and phylogenomics.利用基因组浅层测序法研究植物标本馆标本进行DNA条形码分析和系统发育基因组学研究
Plant Methods. 2018 Jun 5;14:43. doi: 10.1186/s13007-018-0300-0. eCollection 2018.
3
GeSeq - versatile and accurate annotation of organelle genomes.GeSeq - 细胞器基因组的多功能和准确注释。
1977年宋氏山蛭(蛭形目,山蛭科)线粒体全基因组特征及其系统发育分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Jan 3;7(1):103-105. doi: 10.1080/23802359.2021.2008827. eCollection 2022.
Nucleic Acids Res. 2017 Jul 3;45(W1):W6-W11. doi: 10.1093/nar/gkx391.
4
Towards a comprehensive phylogeny of the large temperate genus Pedicularis (Orobanchaceae), with an emphasis on species from the Himalaya-Hengduan Mountains.构建大型温带马先蒿属(列当科)的综合系统发育树,重点关注喜马拉雅 - 横断山脉的物种。
BMC Plant Biol. 2015 Jul 11;15:176. doi: 10.1186/s12870-015-0547-9.
5
Bandage: interactive visualization of de novo genome assemblies.绷带:从头基因组组装的交互式可视化
Bioinformatics. 2015 Oct 15;31(20):3350-2. doi: 10.1093/bioinformatics/btv383. Epub 2015 Jun 22.
6
MAFFT multiple sequence alignment software version 7: improvements in performance and usability.MAFFT 多序列比对软件版本 7:性能和易用性的改进。
Mol Biol Evol. 2013 Apr;30(4):772-80. doi: 10.1093/molbev/mst010. Epub 2013 Jan 16.
7
A rapid bootstrap algorithm for the RAxML Web servers.一种用于RAxML网络服务器的快速自引导算法。
Syst Biol. 2008 Oct;57(5):758-71. doi: 10.1080/10635150802429642.