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DC.(芸香科)的完整叶绿体基因组及其系统发育分析。

The complete chloroplast genome of DC. (Rutaceae) and its phylogenetic analysis.

作者信息

Li Hai-Ling, Zhou Nong, Guo Dong-Qin

机构信息

College of Biology and Food Engineering, Chongqing Three Gorges University, Chongqing, China.

Engineering Laboratory of Chongqing for Green Planting and Deep Processing of Genuine Medicinal Materials in Three Gorges Reservoir Area, Chongqing Three Gorges University, Chongqing, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Oct 27;5(3):3636-3637. doi: 10.1080/23802359.2020.1823268.

DOI:10.1080/23802359.2020.1823268
PMID:33367039
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7594859/
Abstract

We sequenced the complete chloroplast genome of via high-throughput sequencing technology, and analyzed its structural characteristics and phylogenetic relationships. The chloroplast exhibits a genome length of 158,473 bp, including a pair of inverted repeat regions (IRa and IRb) of 27,369 bp, a small single-copy (SSC) region of 17,629 bp and a large single-copy (LSC) region of 85,570 bp. The annotation analysis identified 112 genes, containing 78 protein-coding genes, 30 tRNA genes and 4 rRNA genes. The phylogenetic analysis showed that was closely related to and .

摘要

我们通过高通量测序技术对[物种名称]的完整叶绿体基因组进行了测序,并分析了其结构特征和系统发育关系。该叶绿体基因组长度为158,473 bp,包括一对长度为27,369 bp的反向重复区域(IRa和IRb)、一个长度为17,629 bp的小单拷贝(SSC)区域和一个长度为85,570 bp的大单拷贝(LSC)区域。注释分析鉴定出112个基因,包括78个蛋白质编码基因、30个tRNA基因和4个rRNA基因。系统发育分析表明,[物种名称]与[物种名称1]和[物种名称2]密切相关。

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