• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

山茶属植物的完整叶绿体基因组序列()。 (原文括号部分内容缺失,可能影响完整理解)

The complete chloroplast genome sequence of Camellias ().

作者信息

Liu Yuan, Han Yan

机构信息

Plant Germplasm and Genomics Center, Germplasm Bank of Wild Species in Southwest China, Kunming Institute of Botany, The Chinese Academy of Sciences, Kunming, China.

Faculty of Life Science and Technology, Kunming University of Science and Technology, Kunming, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2017 Dec 21;3(1):34-35. doi: 10.1080/23802359.2017.1419086.

DOI:10.1080/23802359.2017.1419086
PMID:33474056
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7799474/
Abstract

is endemic to Fangcheng, Guangxi Province, China, and its populations have been shrinking. In the present study, we report the complete chloroplast genome of using HiSeq 2500 sequencing technology. The complete chloroplast genome length is 157,095 bp. The chloroplast genome has 43 tRNA genes, six rRNA genes, and 97 protein-coding genes. Moreover, 18 genes have multiple copies in the chloroplast genome. A total of 146 genes are present in the chloroplast genome. Maximum likelihood phylogenetic tree based on 11 complete chloroplast genomes revealed that is closely related to . The complete chloroplast genome of would help to conserving the precious natural populations.

摘要

它原产于中国广西省防城,其种群数量一直在减少。在本研究中,我们报告了使用HiSeq 2500测序技术获得的[物种名称]的完整叶绿体基因组。完整的叶绿体基因组长度为157,095 bp。叶绿体基因组有43个tRNA基因、6个rRNA基因和97个蛋白质编码基因。此外,18个基因在叶绿体基因组中有多个拷贝。叶绿体基因组中共有146个基因。基于11个完整叶绿体基因组构建的最大似然系统发育树表明,[物种名称]与[另一物种名称]密切相关。[物种名称]的完整叶绿体基因组将有助于保护珍贵的自然种群。

需注意,原文中部分关键物种名称缺失,我用[物种名称]进行了替代,你可根据实际情况补充完整准确的信息。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/1c68/7799474/0daec4c46edd/TMDN_A_1419086_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/1c68/7799474/0daec4c46edd/TMDN_A_1419086_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/1c68/7799474/0daec4c46edd/TMDN_A_1419086_F0001_B.jpg

相似文献

1
The complete chloroplast genome sequence of Camellias ().山茶属植物的完整叶绿体基因组序列()。 (原文括号部分内容缺失,可能影响完整理解)
Mitochondrial DNA B Resour. 2017 Dec 21;3(1):34-35. doi: 10.1080/23802359.2017.1419086.
2
Characterization of the complete chloroplast genome of the , an endangered and medicinally important tree species endemic to Southwest China.对中国西南地区特有的一种濒危且具有重要药用价值的树种的完整叶绿体基因组进行表征。
Mitochondrial DNA B Resour. 2018 Aug 27;3(2):884-885. doi: 10.1080/23802359.2018.1501304.
3
The complete chloroplast genome of (Theaceae).(山茶科)的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 May 28;5(3):2228-2230. doi: 10.1080/23802359.2020.1768957. eCollection 2020.
4
Complete chloroplast genome of : a species endemic to Guizhou, China.中国贵州特有物种的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Aug 9;6(9):2596-2598. doi: 10.1080/23802359.2021.1961625. eCollection 2021.
5
Characterization of the complete chloroplast genome sequence of in Hainan, China.中国海南[物种名称]叶绿体全基因组序列特征分析 (注:原文中“in Hainan, China”前缺少具体物种名称)
Mitochondrial DNA B Resour. 2017 Nov 26;2(2):843-844. doi: 10.1080/23802359.2017.1407687.
6
The complete chloroplast genome sequence of S. X. Yang & S. F. Chai (Theaceae), a critically endangered yellow camellia from southwest China.中国西南地区极度濒危的黄色山茶花——杨世雄和柴胜丰(山茶科)的叶绿体全基因组序列
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Jul 19;6(8):2427-2429. doi: 10.1080/23802359.2021.1955028. eCollection 2021.
7
The complete chloroplast genome sequence of rare and endangered Y. Wan & S. Z. Huang (Theaceae) of South China.中国南方珍稀濒危植物圆籽荷(山茶科)的完整叶绿体基因组序列。(注:原文中“Y. Wan & S. Z. Huang”可能有误,圆籽荷的学名是Apterosperma oblata)
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Sep 13;6(10):2893-2895. doi: 10.1080/23802359.2021.1915207. eCollection 2021.
8
Complete chloroplast genomes of Y. Wan et S. Z. Huang and R. C. Hu et Y. Q. Liufu.万玉玲和黄圣忠以及胡瑞成和刘富钰的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Jul 14;6(8):2381-2382. doi: 10.1080/23802359.2021.1937360. eCollection 2021.
9
The complete chloroplast genome of , a rare and endangered species endemic to China.中国特有的一种珍稀濒危物种的完整叶绿体基因组。 (你提供的原文似乎不完整,缺少具体物种名称)
Mitochondrial DNA B Resour. 2017 Dec 7;2(2):913-914. doi: 10.1080/23802359.2017.1413315.
10
The complete chloroplast genome sequence of the Japanese Camellia ( L.).日本山茶(L.)的完整叶绿体基因组序列
Mitochondrial DNA B Resour. 2017 Aug 30;2(2):583-584. doi: 10.1080/23802359.2017.1372719.

引用本文的文献

1
Tea plant genomics: achievements, challenges and perspectives.茶树基因组学:成就、挑战与展望
Hortic Res. 2020 Jan 1;7:7. doi: 10.1038/s41438-019-0225-4. eCollection 2020.
2
Deciphering tea tree chloroplast and mitochondrial genomes of Camellia sinensis var. assamica.破译阿萨姆种茶树的叶绿体和线粒体基因组。
Sci Data. 2019 Oct 17;6(1):209. doi: 10.1038/s41597-019-0201-8.
3
Complete chloroplast genome of Camellia japonica genome structures, comparative and phylogenetic analysis.完成了山茶属植物基因组结构的完整叶绿体基因组、比较和系统发育分析。

本文引用的文献

1
MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets.MEGA7:适用于更大数据集的分子进化遗传学分析版本7.0
Mol Biol Evol. 2016 Jul;33(7):1870-4. doi: 10.1093/molbev/msw054. Epub 2016 Mar 22.
2
Thirteen Camellia chloroplast genome sequences determined by high-throughput sequencing: genome structure and phylogenetic relationships.通过高通量测序确定的 13 个山茶花叶绿体基因组序列:基因组结构和系统发育关系。
BMC Evol Biol. 2014 Jul 7;14:151. doi: 10.1186/1471-2148-14-151.
3
Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data.
PLoS One. 2019 May 9;14(5):e0216645. doi: 10.1371/journal.pone.0216645. eCollection 2019.
Trimmomatic:一款适用于 Illumina 测序数据的灵活修剪工具。
Bioinformatics. 2014 Aug 1;30(15):2114-20. doi: 10.1093/bioinformatics/btu170. Epub 2014 Apr 1.
4
From algae to angiosperms-inferring the phylogeny of green plants (Viridiplantae) from 360 plastid genomes.从藻类到被子植物——从 360 个质体基因组推断绿色植物(Viridiplantae)的系统发育。
BMC Evol Biol. 2014 Feb 17;14:23. doi: 10.1186/1471-2148-14-23.
5
Comparative chloroplast genomes of camellia species.山茶属植物叶绿体基因组比较。
PLoS One. 2013 Aug 23;8(8):e73053. doi: 10.1371/journal.pone.0073053. eCollection 2013.
6
OrganellarGenomeDRAW--a suite of tools for generating physical maps of plastid and mitochondrial genomes and visualizing expression data sets.细胞器基因组绘图软件--一套用于生成质体和线粒体基因组物理图谱以及可视化表达数据集的工具。
Nucleic Acids Res. 2013 Jul;41(Web Server issue):W575-81. doi: 10.1093/nar/gkt289. Epub 2013 Apr 22.
7
SOAPdenovo2: an empirically improved memory-efficient short-read de novo assembler.SOAPdenovo2:一种经验丰富的、内存效率高的短读长从头组装器。
Gigascience. 2012 Dec 27;1(1):18. doi: 10.1186/2047-217X-1-18.
8
Contradiction between plastid gene transcription and function due to complex posttranscriptional splicing: an exemplary study of ycf15 function and evolution in angiosperms.由于复杂的转录后剪接导致质体基因转录和功能之间的矛盾:被子植物 ycf15 功能和进化的典范研究。
PLoS One. 2013;8(3):e59620. doi: 10.1371/journal.pone.0059620. Epub 2013 Mar 18.
9
GapFiller: a de novo assembly approach to fill the gap within paired reads.GapFiller:一种从头开始的组装方法,用于填补配对读取中的缺口。
BMC Bioinformatics. 2012;13 Suppl 14(Suppl 14):S8. doi: 10.1186/1471-2105-13-S14-S8. Epub 2012 Sep 7.
10
Ultra-barcoding in cacao (Theobroma spp.; Malvaceae) using whole chloroplast genomes and nuclear ribosomal DNA.利用叶绿体全基因组和核核糖体 DNA 对可可(Theobroma spp.;锦葵科)进行超条形码分析。
Am J Bot. 2012 Feb;99(2):320-9. doi: 10.3732/ajb.1100570. Epub 2012 Feb 1.