• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

下一代测序产生了[具体物种]的完整线粒体基因组并进行了系统发育分析。 (注:原文中“of”后面缺少具体物种信息)

Next-generation sequencing yields the complete mitogenome of and phylogenetic analysis.

作者信息

Wang Zhengfei, Wu Qiong, Guo Huayun, Tang Dan, Bai Yuze, Wang Ziqian, Tao Yitao

机构信息

Jiangsu Key Laboratory for Bioresources of Saline Soils, Jiangsu Synthetic Innovation Center for Coastal Bio-agriculture, Jiangsu Provincial Key Laboratory of Coastal Wetland Bioresources and Environmental Protection, School of Ocean and Biological Engineering, Yancheng Teachers University, Yancheng, Jiangsu Province, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2018 Jan 3;3(1):68-70. doi: 10.1080/23802359.2017.1422403.

DOI:10.1080/23802359.2017.1422403
PMID:33474069
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7799520/
Abstract

In this study, the complete mitochondrial genome (mitogenome) of is reported for the first time. These data demonstrate that the mitochondrial genome is a 15,825 bp circular molecule and encodes the typical 37 metazoan mitochondrial genes [13 protein-coding genes (PCGs), 22 transfer RNA genes (tRNAs), two ribosomal RNA genes (rRNAs)] and an A + T-rich control region. The genome composition was highly A + T biased 63.45% and showed negative AT-skew (-0.131) and slightly possitive GC-skew (0.018). The complete mitogenome provides essential and important DNA molecular data for further phylogenetic and evolutionary analysis for shrimps.

摘要

在本研究中,首次报道了[物种名称]的完整线粒体基因组(线粒体基因组)。这些数据表明,该线粒体基因组是一个15,825 bp的环状分子,编码典型的37个后生动物线粒体基因[13个蛋白质编码基因(PCG)、22个转移RNA基因(tRNA)、两个核糖体RNA基因(rRNA)]以及一个富含A+T的控制区。基因组组成具有高度的A+T偏向性,为63.45%,呈现负的AT偏斜(-0.131)和轻微正的GC偏斜(0.018)。完整的线粒体基因组为虾类的进一步系统发育和进化分析提供了重要的DNA分子数据。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b257/7799520/30de8e0c4cf4/TMDN_A_1422403_F0001_C.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b257/7799520/30de8e0c4cf4/TMDN_A_1422403_F0001_C.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/b257/7799520/30de8e0c4cf4/TMDN_A_1422403_F0001_C.jpg

相似文献

1
Next-generation sequencing yields the complete mitogenome of and phylogenetic analysis.下一代测序产生了[具体物种]的完整线粒体基因组并进行了系统发育分析。 (注:原文中“of”后面缺少具体物种信息)
Mitochondrial DNA B Resour. 2018 Jan 3;3(1):68-70. doi: 10.1080/23802359.2017.1422403.
2
The complete mitochondrial genome of Parasesarma pictum (Brachyura: Grapsoidea: Sesarmidae) and comparison with other Brachyuran crabs.拟地鳖(十足目:短尾下目:沙蟹科)的完整线粒体基因组序列及其与其他短尾下目螃蟹的比较。
Genomics. 2019 Jul;111(4):799-807. doi: 10.1016/j.ygeno.2018.05.002. Epub 2018 May 9.
3
Exploring the mitochondrial genome of Caridina pseudogracilirostris: a comparative analysis within the Atyidae Family.探究秀丽白虾线粒体基因组:阿丁蟹科内的比较分析。
Mol Biol Rep. 2023 Oct;50(10):8121-8131. doi: 10.1007/s11033-023-08700-1. Epub 2023 Aug 8.
4
The complete mitochondrial genome of the Cape honey bee, Esch. (Insecta: hymenoptera: apidae).开普敦蜜蜂(学名:Esch.)(昆虫纲:膜翅目:蜜蜂科)的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2016 Nov 12;1(1):817-819. doi: 10.1080/23802359.2016.1241682.
5
Next generation sequencing yields the complete mitogenome of nereid worm, (Annelida: Nereididae).下一代测序技术获得了沙蚕(环节动物门:沙蚕科)的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2016 Feb 1;1(1):103-104. doi: 10.1080/23802359.2015.1137845.
6
Complete mitochondrial genome of the atlas moth, Attacus atlas (Lepidoptera: Saturniidae) and the phylogenetic relationship of Saturniidae species.天蚕蛾属(鳞翅目:天蚕蛾科)的完整线粒体基因组图谱及天蚕蛾科物种的系统发育关系。
Gene. 2014 Jul 15;545(1):95-101. doi: 10.1016/j.gene.2014.05.002. Epub 2014 May 2.
7
The complete mitochondrial genome of Vanessa indica and phylogenetic analyses of the family Nymphalidae.苎麻珍蝶的完整线粒体基因组及蛱蝶科系统发育分析
Genes Genomics. 2018 Oct;40(10):1011-1022. doi: 10.1007/s13258-018-0709-x. Epub 2018 Jun 14.
8
The complete mitochondrial genome of the (Lepidoptera: Pieridae) and its phylogenetic implication.(鳞翅目:粉蝶科)的线粒体全基因组及其系统发育意义。
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jul 28;5(3):3035-3036. doi: 10.1080/23802359.2020.1797565.
9
The complete mitogenome of (Lepidoptera: Hesperiidae).(鳞翅目:弄蝶科)的完整线粒体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2016;1(1):581-583. doi: 10.1080/23802359.2016.1197070. Epub 2016 Aug 30.
10
The complete mitochondrial genome of Thitarodes sejilaensis (Lepidoptera: Hepialidae), a host insect of Ophiocordyceps sinensis and its implication in taxonomic revision of Hepialus adopted in China.中华虫草寄主昆虫色季拉虫草蝠蛾(鳞翅目:蝙蝠蛾科)的线粒体全基因组及其在中国蝙蝠蛾属分类修订中的意义
Gene. 2017 Feb 15;601:44-55. doi: 10.1016/j.gene.2016.11.039. Epub 2016 Dec 3.

引用本文的文献

1
Analysis of the Overlength Main Noncoding Region in (Decapoda: Brachyura) and a Phylogenetic Study of the Cancroidea Species.十足目(短尾亚目)超长主要非编码区分析及黄道蟹总科物种的系统发育研究
Genes (Basel). 2024 Mar 29;15(4):437. doi: 10.3390/genes15040437.

本文引用的文献

1
Digging deeper: new gene order rearrangements and distinct patterns of codons usage in mitochondrial genomes among shrimps from the Axiidea, Gebiidea and Caridea (Crustacea: Decapoda).深入探究:阿西虾属、吉贝虾属和真虾属(甲壳纲:十足目)虾类线粒体基因组中的新基因顺序重排及密码子使用的独特模式
PeerJ. 2017 Mar 1;5:e2982. doi: 10.7717/peerj.2982. eCollection 2017.
2
NOVOPlasty: de novo assembly of organelle genomes from whole genome data.NOVOPlasty:从头组装细胞器基因组的全基因组数据。
Nucleic Acids Res. 2017 Feb 28;45(4):e18. doi: 10.1093/nar/gkw955.
3
Genomic sequence and experimental tractability of a new decapod shrimp model, Neocaridina denticulata.
一种新型十足目虾类模型——锯齿新米虾的基因组序列及实验可操作性
Mar Drugs. 2014 Mar 11;12(3):1419-37. doi: 10.3390/md12031419.
4
Mitogenomic analysis of decapod crustacean phylogeny corroborates traditional views on their relationships.对十足目甲壳动物系统发育的线粒体基因组分析支持了它们之间关系的传统观点。
Mol Phylogenet Evol. 2013 Mar;66(3):776-89. doi: 10.1016/j.ympev.2012.11.002. Epub 2012 Nov 29.
5
Phylogeny of Decapoda using two nuclear protein-coding genes: origin and evolution of the Reptantia.利用两个核蛋白编码基因研究十足目系统发育:爬行亚目的起源与演化
Mol Phylogenet Evol. 2008 Jul;48(1):359-68. doi: 10.1016/j.ympev.2008.04.009. Epub 2008 Apr 14.