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R 环作为 DNA 修复的双面调节因子。

R-loops as Janus-faced modulators of DNA repair.

机构信息

Molecular, Cellular and Developmental Biology Department (MCD), Centre de Biologie Integrative (CBI), University of Toulouse, CNRS, UPS, Toulouse, France.

出版信息

Nat Cell Biol. 2021 Apr;23(4):305-313. doi: 10.1038/s41556-021-00663-4. Epub 2021 Apr 9.

DOI:10.1038/s41556-021-00663-4
PMID:33837288
Abstract

R-loops are non-B DNA structures with intriguing dual consequences for gene expression and genome stability. In addition to their recognized roles in triggering DNA double-strand breaks (DSBs), R-loops have recently been demonstrated to accumulate in cis to DSBs, especially those induced in transcriptionally active loci. In this Review, we discuss whether R-loops actively participate in DSB repair or are detrimental by-products that must be removed to avoid genome instability.

摘要

R 环是具有有趣的双重影响的非 B 型 DNA 结构,对基因表达和基因组稳定性都有影响。除了它们在触发 DNA 双链断裂 (DSB) 方面的公认作用外,最近还证明 R 环会在 cis 中积累到 DSB,尤其是在转录活跃的基因座中诱导产生的 DSB。在这篇综述中,我们讨论了 R 环是否积极参与 DSB 修复,或者它们是否是有害的副产物,必须清除这些副产物以避免基因组不稳定。

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Mol Cell. 2022 Jun 16;82(12):2267-2297. doi: 10.1016/j.molcel.2022.04.014. Epub 2022 May 3.
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Curr Genet. 2018 Aug;64(4):789-794. doi: 10.1007/s00294-018-0806-z. Epub 2018 Jan 11.
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DNA Repair (Amst). 2014 Jul;19:84-94. doi: 10.1016/j.dnarep.2014.03.023. Epub 2014 Apr 18.

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Nat Commun. 2025 Aug 23;16(1):7882. doi: 10.1038/s41467-025-63220-9.
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iScience. 2025 Jul 30;28(9):113235. doi: 10.1016/j.isci.2025.113235. eCollection 2025 Sep 19.
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