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亲水三苯甲基基团标记破解抗性蛋白可用于距离测量。

Cleavage-Resistant Protein Labeling With Hydrophilic Trityl Enables Distance Measurements .

机构信息

Department of Chemistry, University of Pittsburgh, Pittsburgh, Pennsylvania 15260, United States.

Department of Pharmaceutical Sciences, School of Pharmacy & In Vivo Multifunctional Magnetic Resonance (IMMR) Center, Health Sciences Center, West Virginia University, Morgantown, West Virginia 26506, United States.

出版信息

J Phys Chem B. 2021 May 27;125(20):5265-5274. doi: 10.1021/acs.jpcb.1c02371. Epub 2021 May 13.

DOI:10.1021/acs.jpcb.1c02371
PMID:33983738
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8819876/
Abstract

Sensitive distance measurements in proteins using pulsed-electron spin resonance (ESR) require reduction-resistant and cleavage-resistant spin labels. Among the reduction-resistant moieties, the hydrophilic trityl core known as OX063 is promising due to its long phase-memory relaxation time (). This property leads to a sufficiently intense ESR signal for reliable distance measurements. Furthermore, the of OX063 remains sufficiently long at higher temperatures, opening the possibility for measurements at temperatures above 50 K. In this work, we synthesized deuterated OX063 with a maleimide linker (mOX063-d). We show that the combination of the hydrophilicity of the label and the maleimide linker enables high protein labeling that is cleavage-resistant . Distance measurements performed at 150 K using this label are more sensitive than the measurements at 80 K. The sensitivity gain is due to the significantly short longitudinal relaxation time () at higher temperatures, which enables more data collection per unit of time. In addition to experiments, we perform distance measurements in oocytes. Interestingly, the of mOX063-d is sufficiently long even in the crowded environment of the cell, leading to signals of appreciable intensity. Overall, mOX063-d provides highly sensitive distance measurements both and .

摘要

使用脉冲电子顺磁共振(ESR)进行敏感的蛋白质距离测量需要还原抗性和切割抗性的自旋标记物。在还原抗性部分中,亲水性三苯甲基核心被称为 OX063,由于其长的相记忆弛豫时间(),因此很有前途。该特性为可靠的距离测量提供了足够强的 ESR 信号。此外,OX063 的在较高温度下保持足够长的,为在 50K 以上的温度下进行测量提供了可能性。在这项工作中,我们合成了带有马来酰亚胺接头的氘代 OX063(mOX063-d)。我们表明,该标签的亲水性和马来酰亚胺接头的组合可实现高的蛋白质标记,且具有切割抗性。使用此标签在 150K 下进行的距离测量比在 80K 下的测量更灵敏。灵敏度的提高是由于在较高温度下纵向弛豫时间()明显缩短,这使得在单位时间内可以收集更多的数据。除了弛豫实验外,我们还在卵母细胞中进行了距离测量。有趣的是,即使在细胞拥挤的环境中,mOX063-d 的也足够长,导致信号强度可观。总体而言,mOX063-d 在和都提供了高灵敏度的距离测量。

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