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一种小肽通过介导自噬降解 SGS3/RDR6 体来抑制植物中 siRNA 的扩增。

A small peptide inhibits siRNA amplification in plants by mediating autophagic degradation of SGS3/RDR6 bodies.

机构信息

State Key Laboratory of Agro-Biotechnology, College of Biological Sciences, China Agricultural University, Beijing, China.

College of Plant Protection, China Agricultural University, Beijing, China.

出版信息

EMBO J. 2021 Aug 2;40(15):e108050. doi: 10.15252/embj.2021108050. Epub 2021 Jun 22.

DOI:10.15252/embj.2021108050
PMID:34155657
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8327956/
Abstract

Selective autophagy mediates specific degradation of unwanted cytoplasmic components to maintain cellular homeostasis. The suppressor of gene silencing 3 (SGS3) and RNA-dependent RNA polymerase 6 (RDR6)-formed bodies (SGS3/RDR6 bodies) are essential for siRNA amplification in planta. However, whether autophagy receptors regulate selective turnover of SGS3/RDR6 bodies is unknown. By analyzing the transcriptomic response to virus infection in Arabidopsis, we identified a virus-induced small peptide 1 (VISP1) composed of 71 amino acids, which harbor a ubiquitin-interacting motif that mediates interaction with autophagy-related protein 8. Overexpression of VISP1 induced selective autophagy and compromised antiviral immunity by inhibiting SGS3/RDR6-dependent viral siRNA amplification, whereas visp1 mutants exhibited opposite effects. Biochemistry assays demonstrate that VISP1 interacted with SGS3 and mediated autophagic degradation of SGS3/RDR6 bodies. Further analyses revealed that overexpression of VISP1, mimicking the sgs3 mutant, impaired biogenesis of endogenous trans-acting siRNAs and up-regulated their targets. Collectively, we propose that VISP1 is a small peptide receptor functioning in the crosstalk between selective autophagy and RNA silencing.

摘要

选择性自噬介导对细胞质内不需要的成分进行特异性降解,以维持细胞内稳态。基因沉默抑制子 3(SGS3)和 RNA 依赖性 RNA 聚合酶 6(RDR6)形成的小体(SGS3/RDR6 小体)对于植物体内 siRNA 的扩增是必需的。然而,自噬受体是否调节 SGS3/RDR6 小体的选择性周转尚不清楚。通过分析拟南芥对病毒感染的转录组响应,我们鉴定了一种由 71 个氨基酸组成的病毒诱导小肽 1(VISP1),其含有一个泛素相互作用基序,介导与自噬相关蛋白 8 的相互作用。VISP1 的过表达诱导了选择性自噬,并通过抑制 SGS3/RDR6 依赖性病毒 siRNA 扩增来破坏抗病毒免疫,而 visp1 突变体则表现出相反的效果。生化分析表明,VISP1 与 SGS3 相互作用,并介导 SGS3/RDR6 小体的自噬降解。进一步的分析表明,过表达 VISP1,模拟 sgs3 突变体,损害了内源性反式作用 siRNA 的生物发生,并上调了它们的靶标。总的来说,我们提出 VISP1 是一种小肽受体,在选择性自噬和 RNA 沉默的串扰中发挥作用。

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