• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

使用数字 PCR 进行长非编码 RNA 的定量分析。

Quantitation of Long Noncoding RNA Using Digital PCR.

机构信息

Mayo Clinic, Jacksonville, FL, USA.

出版信息

Methods Mol Biol. 2021;2348:113-121. doi: 10.1007/978-1-0716-1581-2_7.

DOI:10.1007/978-1-0716-1581-2_7
PMID:34160802
Abstract

Long noncoding RNAs (lncRNAs) are implicated in many physiological or disease processes and alterations in their expression may contribute to the development of various diseases. Accurate quantitation of lncRNA can be useful in measuring changes in expression in different settings such as in the circulation where the measurement of lncRNA may be useful as a biomarker of disease. However, the low levels of lncRNA expression require the use of highly sensitive detection technologies for accurate quantitation. Digital polymerase chain reaction (dPCR) is a sensitive method for absolute quantification of lncRNA and can be useful for measurement of gene expression when transcript levels are low. By providing a direct measurement without normalization, the use of dPCR may provide advantages for quantitation of low-abundance targets.

摘要

长链非编码 RNA(lncRNA)参与许多生理或疾病过程,其表达的改变可能导致各种疾病的发生。lncRNA 的准确定量在测量不同环境中的表达变化时很有用,例如在循环系统中,lncRNA 的测量可能作为疾病的生物标志物很有用。然而,lncRNA 表达水平低需要使用高度敏感的检测技术进行准确定量。数字聚合酶链反应(dPCR)是一种用于 lncRNA 绝对定量的敏感方法,当转录本水平较低时,它可用于测量基因表达。通过提供无需标准化的直接测量,dPCR 的使用可能为低丰度靶标的定量提供优势。

相似文献

1
Quantitation of Long Noncoding RNA Using Digital PCR.使用数字 PCR 进行长非编码 RNA 的定量分析。
Methods Mol Biol. 2021;2348:113-121. doi: 10.1007/978-1-0716-1581-2_7.
2
Measuring lncRNA Expression by Real-Time PCR.实时 PCR 测定长链非编码 RNA 表达。
Methods Mol Biol. 2021;2348:93-111. doi: 10.1007/978-1-0716-1581-2_6.
3
Extracellular vesicle long noncoding RNA as potential biomarkers of liver cancer.细胞外囊泡长链非编码RNA作为肝癌的潜在生物标志物
Brief Funct Genomics. 2016 May;15(3):249-56. doi: 10.1093/bfgp/elv058. Epub 2015 Dec 3.
4
Aberrantly expressed long noncoding RNAs in recurrent implantation failure: A microarray related study.复发性植入失败中异常表达的长链非编码RNA:一项与微阵列相关的研究。
Syst Biol Reprod Med. 2017 Aug;63(4):269-278. doi: 10.1080/19396368.2017.1310329. Epub 2017 Apr 25.
5
Identification of long noncoding RNAs biomarkers for diagnosis and prognosis in patients with colon adenocarcinoma.鉴定长链非编码 RNA 生物标志物,用于诊断和预测结肠腺癌患者的预后。
J Cell Biochem. 2019 Mar;120(3):4121-4131. doi: 10.1002/jcb.27697. Epub 2018 Sep 30.
6
Aberrant expression of long noncoding RNAs in early diabetic retinopathy.早期糖尿病视网膜病变中长链非编码 RNA 的异常表达。
Invest Ophthalmol Vis Sci. 2014 Feb 18;55(2):941-51. doi: 10.1167/iovs.13-13221.
7
Absolute quantification and analysis of extracellular vesicle lncRNAs from the peripheral blood of patients with lung cancer based on multi-colour fluorescence chip-based digital PCR.基于多色荧光芯片数字 PCR 的肺癌患者外周血外泌体 lncRNAs 的绝对定量分析。
Biosens Bioelectron. 2019 Oct 1;142:111523. doi: 10.1016/j.bios.2019.111523. Epub 2019 Jul 17.
8
Differential Expression of Long Noncoding RNAs During Cardiac Allograft Rejection.心脏同种异体移植排斥反应期间长链非编码RNA的差异表达
Transplantation. 2017 Jan;101(1):83-91. doi: 10.1097/TP.0000000000001463.
9
Detection of Long Noncoding RNA Expression by Real-Time PCR.实时 PCR 检测长非编码 RNA 表达。
Methods Mol Biol. 2021;2372:35-42. doi: 10.1007/978-1-0716-1697-0_5.
10
Key Anti-Fibrosis Associated Long Noncoding RNAs Identified in Human Hepatic Stellate Cell via Transcriptome Sequencing Analysis.通过转录组测序分析鉴定人肝星状细胞中关键的抗纤维化相关长非编码 RNA。
Int J Mol Sci. 2018 Feb 27;19(3):675. doi: 10.3390/ijms19030675.

本文引用的文献

1
Detection of circulating tumor DNA (ctDNA) by digital droplet polymerase chain reaction (dd-PCR) in liquid biopsies.通过数字液滴聚合酶链反应(dd-PCR)在液体活检中检测循环肿瘤DNA(ctDNA)。
Methods Enzymol. 2019;629:1-15. doi: 10.1016/bs.mie.2019.08.002. Epub 2019 Aug 14.
2
Droplet digital PCR improves urinary exosomal miRNA detection compared to real-time PCR.与实时 PCR 相比,液滴数字 PCR 可提高尿外泌体 miRNA 的检测。
Clin Biochem. 2019 May;67:54-59. doi: 10.1016/j.clinbiochem.2019.03.008. Epub 2019 Mar 21.
3
Droplet Digital PCR for Quantitation of Extracellular RNA.
用于定量细胞外RNA的液滴数字PCR
Methods Mol Biol. 2018;1740:155-162. doi: 10.1007/978-1-4939-7652-2_12.
4
Functional Classification and Experimental Dissection of Long Noncoding RNAs.长非编码 RNA 的功能分类与实验解析。
Cell. 2018 Jan 25;172(3):393-407. doi: 10.1016/j.cell.2018.01.011.
5
Extracellular vesicle long noncoding RNA as potential biomarkers of liver cancer.细胞外囊泡长链非编码RNA作为肝癌的潜在生物标志物
Brief Funct Genomics. 2016 May;15(3):249-56. doi: 10.1093/bfgp/elv058. Epub 2015 Dec 3.
6
Absolute quantification of lung cancer related microRNA by droplet digital PCR.通过液滴数字 PCR 对肺癌相关 microRNA 进行绝对定量。
Biosens Bioelectron. 2015 Dec 15;74:836-42. doi: 10.1016/j.bios.2015.07.048. Epub 2015 Jul 22.
7
Considerations for digital PCR as an accurate molecular diagnostic tool.考虑将数字 PCR 作为一种准确的分子诊断工具。
Clin Chem. 2015 Jan;61(1):79-88. doi: 10.1373/clinchem.2014.221366. Epub 2014 Oct 22.
8
Analysis of extracellular RNA by digital PCR.通过数字 PCR 分析细胞外 RNA。
Front Oncol. 2014 Jun 4;4:129. doi: 10.3389/fonc.2014.00129. eCollection 2014.
9
Absolute quantification by droplet digital PCR versus analog real-time PCR.通过液滴数字 PCR 进行绝对定量与模拟实时 PCR。
Nat Methods. 2013 Oct;10(10):1003-5. doi: 10.1038/nmeth.2633. Epub 2013 Sep 1.
10
Digital quantitation of potential therapeutic target RNAs.潜在治疗靶标 RNA 的数字定量。
Nucleic Acid Ther. 2013 Jun;23(3):188-94. doi: 10.1089/nat.2013.0427. Epub 2013 May 8.