• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

通过成对算法进行多序列比对。

Multiple sequence alignment by a pairwise algorithm.

作者信息

Taylor W R

机构信息

Dept. of Crystallography, Birkbeck College, London, UK.

出版信息

Comput Appl Biosci. 1987 Jun;3(2):81-7. doi: 10.1093/bioinformatics/3.2.81.

DOI:10.1093/bioinformatics/3.2.81
PMID:3453222
Abstract

An algorithm is described that processes the results of a conventional pairwise sequence alignment program to automatically produce an unambiguous multiple alignment of many sequences. Unlike other, more complex, multiple alignment programs, the method described here is fast enough to be used on almost any multiple sequence alignment problem.

摘要

本文描述了一种算法,该算法处理传统的成对序列比对程序的结果,以自动生成多个序列的明确多重比对。与其他更复杂的多重比对程序不同,这里描述的方法速度足够快,几乎可以用于任何多重序列比对问题。

相似文献

1
Multiple sequence alignment by a pairwise algorithm.通过成对算法进行多序列比对。
Comput Appl Biosci. 1987 Jun;3(2):81-7. doi: 10.1093/bioinformatics/3.2.81.
2
Simultaneous comparison of three protein sequences.三种蛋白质序列的同步比较。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1985 May;82(10):3073-7. doi: 10.1073/pnas.82.10.3073.
3
A divide and conquer approach to multiple alignment.
Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol. 1995;3:107-13.
4
A fast and sensitive multiple sequence alignment algorithm.
Comput Appl Biosci. 1989 Apr;5(2):115-21. doi: 10.1093/bioinformatics/5.2.115.
5
On global sequence alignment.关于全局序列比对。
Comput Appl Biosci. 1994 Jun;10(3):227-35. doi: 10.1093/bioinformatics/10.3.227.
6
Pairwise alignment incorporating dipeptide covariation.纳入二肽共变的成对序列比对。
Bioinformatics. 2005 Oct 1;21(19):3704-10. doi: 10.1093/bioinformatics/bti616. Epub 2005 Aug 25.
7
A simple genetic algorithm for multiple sequence alignment.一种用于多序列比对的简单遗传算法。
Genet Mol Res. 2007 Oct 5;6(4):964-82.
8
CLUSTAL: a package for performing multiple sequence alignment on a microcomputer.CLUSTAL:一个用于在微型计算机上进行多序列比对的程序包。
Gene. 1988 Dec 15;73(1):237-44. doi: 10.1016/0378-1119(88)90330-7.
9
MUSTANG: a multiple structural alignment algorithm.MUSTANG:一种多重结构比对算法。
Proteins. 2006 Aug 15;64(3):559-74. doi: 10.1002/prot.20921.
10
Protein multiple sequence alignment.蛋白质多序列比对
Methods Mol Biol. 2008;484:379-413. doi: 10.1007/978-1-59745-398-1_25.

引用本文的文献

1
Reduction, alignment and visualisation of large diverse sequence families.大型多样序列家族的归约、比对与可视化
BMC Bioinformatics. 2016 Aug 2;17(1):300. doi: 10.1186/s12859-016-1059-9.
2
An assessment of substitution scores for protein profile-profile comparison.蛋白质图谱-图谱比较替代评分评估。
Bioinformatics. 2011 Dec 15;27(24):3356-63. doi: 10.1093/bioinformatics/btr565. Epub 2011 Oct 13.
3
Sequence embedding for fast construction of guide trees for multiple sequence alignment.用于快速构建多序列比对引导树的序列嵌入
Algorithms Mol Biol. 2010 May 14;5:21. doi: 10.1186/1748-7188-5-21.
4
Assessing strategies for improved superfamily recognition.评估用于改进超家族识别的策略。
Protein Sci. 2005 Jul;14(7):1800-10. doi: 10.1110/ps.041056105. Epub 2005 Jun 3.
5
A memory-efficient algorithm for multiple sequence alignment with constraints.一种用于带约束条件的多序列比对的内存高效算法。
Bioinformatics. 2005 Jan 1;21(1):20-30. doi: 10.1093/bioinformatics/bth468. Epub 2004 Sep 16.
6
Using 3D Hidden Markov Models that explicitly represent spatial coordinates to model and compare protein structures.使用明确表示空间坐标的3D隐马尔可夫模型来建模和比较蛋白质结构。
BMC Bioinformatics. 2004 Jan 9;5:2. doi: 10.1186/1471-2105-5-2.
7
A multiple sequence comparison method.一种多序列比对方法。
Bull Math Biol. 1993 Mar;55(2):465-86. doi: 10.1007/BF02460892.
8
A flexible method to align large numbers of biological sequences.一种比对大量生物序列的灵活方法。
J Mol Evol. 1988;28(1-2):161-9. doi: 10.1007/BF02143508.
9
A flexible multiple sequence alignment program.一个灵活的多序列比对程序。
Nucleic Acids Res. 1988 Mar 11;16(5):1683-91. doi: 10.1093/nar/16.5.1683.
10
Multiple sequence alignment with hierarchical clustering.采用层次聚类的多序列比对。
Nucleic Acids Res. 1988 Nov 25;16(22):10881-90. doi: 10.1093/nar/16.22.10881.