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《中心硅藻 Conticribra weissflogii(Ochrophyta,Coscinodiscophyceae)的基因组草图》。

The Draft Genome of the Centric Diatom Conticribra weissflogii (Coscinodiscophyceae, Ochrophyta).

机构信息

Department of Biotechnology and Biomedicine, Technical University of Denmark, Søltofts Plads 221, 2800 Kgs. Lyngby, Denmark; State Key Laboratory of Agricultural Genomics, BGI-Shenzhen, Shenzhen 518083, China.

State Key Laboratory of Agricultural Genomics, BGI-Shenzhen, Shenzhen 518083, China; College of Life Sciences, University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China.

出版信息

Protist. 2021 Oct-Dec;172(5-6):125845. doi: 10.1016/j.protis.2021.125845. Epub 2021 Nov 16.

DOI:10.1016/j.protis.2021.125845
PMID:34916152
Abstract

Here, we present a 231 Mb draft genome of the centric diatom Conticribra weissflogii CCMP1336. Comparative genomics of C. weissflogii and other Ochrophyta support the existence of unique carbon-concentrating mechanisms and chitin metabolic processes in diatoms. The whole-genome project is available at CNSA (https://db.cngb.org/search/project/CNP0001903/).

摘要

在这里,我们呈现了中心硅藻 Conticribra weissflogii CCMP1336 的 231Mb 草图基因组。C. weissflogii 与其他 Ochrophyta 的比较基因组学支持了硅藻中独特的碳浓缩机制和几丁质代谢过程的存在。全基因组项目可在 CNSA(https://db.cngb.org/search/project/CNP0001903/)上获得。

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