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植物重复序列数据库(PlantRep)。

PlantRep: a database of plant repetitive elements.

机构信息

Shenzhen Branch, Guangdong Laboratory for Lingnan Modern Agriculture, Genome Analysis Laboratory of the Ministry of Agriculture, Agricultural Genomics Institute at Shenzhen, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Shenzhen, 518124, China.

School of Agriculture, Sun Yat-sen University, Shenzhen, 518107, China.

出版信息

Plant Cell Rep. 2022 Apr;41(4):1163-1166. doi: 10.1007/s00299-021-02817-y. Epub 2022 Jan 3.

Abstract

We re-annotated repeats of 459 plant genomes and released a new database: PlantRep ( http://www.plantrep.cn/ ). PlantRep sheds lights of repeat evolution and provides fundamental data for deep exploration of genome.

摘要

我们重新注释了 459 种植物基因组的重复序列,并发布了一个新的数据库:PlantRep(http://www.plantrep.cn/)。PlantRep 揭示了重复序列的进化,并为深入探索基因组提供了基础数据。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/259c/9035001/312bb10105d2/299_2021_2817_Fig1_HTML.jpg

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