• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

转录调控及其对基因表达控制的影响

Transcriptional Regulation and Implications for Controlling Gene Expression.

作者信息

Afzal Zainab, Krumlauf Robb

机构信息

Stowers Institute for Medical Research, 1000 E. 50th, Kansas City, MO 64110, USA.

Department of Anatomy and Cell Biology, Kansas University Medical Center, Kansas City, MO 66160, USA.

出版信息

J Dev Biol. 2022 Jan 10;10(1):4. doi: 10.3390/jdb10010004.

DOI:10.3390/jdb10010004
PMID:35076545
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8788451/
Abstract

genes play key roles in axial patterning and regulating the regional identity of cells and tissues in a wide variety of animals from invertebrates to vertebrates. Nested domains of expression generate a combinatorial code that provides a molecular framework for specifying the properties of tissues along the A-P axis. Hence, it is important to understand the regulatory mechanisms that coordinately control the precise patterns of the transcription of clustered genes required for their roles in development. New insights are emerging about the dynamics and molecular mechanisms governing transcriptional regulation, and there is interest in understanding how these may play a role in contributing to the regulation of the expression of the clustered genes. In this review, we summarize some of the recent findings, ideas and emerging mechanisms underlying the regulation of transcription in general and consider how they may be relevant to understanding the transcriptional regulation of genes.

摘要

基因在从无脊椎动物到脊椎动物的多种动物的轴模式形成以及调控细胞和组织的区域特性方面发挥着关键作用。嵌套的表达结构域产生一种组合密码,为沿前后轴指定组织特性提供分子框架。因此,了解协调控制其在发育中发挥作用所需的成簇基因转录精确模式的调控机制非常重要。关于转录调控的动力学和分子机制正在出现新的见解,人们有兴趣了解这些机制如何在成簇基因表达调控中发挥作用。在本综述中,我们总结了一些关于转录调控的最新发现、观点和新兴机制,并考虑它们如何与理解基因的转录调控相关。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a97b/8788451/c01bd8b8ac1a/jdb-10-00004-g003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a97b/8788451/63323516c5be/jdb-10-00004-g001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a97b/8788451/e345020ab870/jdb-10-00004-g002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a97b/8788451/c01bd8b8ac1a/jdb-10-00004-g003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a97b/8788451/63323516c5be/jdb-10-00004-g001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a97b/8788451/e345020ab870/jdb-10-00004-g002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a97b/8788451/c01bd8b8ac1a/jdb-10-00004-g003.jpg

相似文献

1
Transcriptional Regulation and Implications for Controlling Gene Expression.转录调控及其对基因表达控制的影响
J Dev Biol. 2022 Jan 10;10(1):4. doi: 10.3390/jdb10010004.
2
Coupling the roles of Hox genes to regulatory networks patterning cranial neural crest.将Hox基因的作用与构建颅神经嵴模式的调控网络相结合。
Dev Biol. 2018 Dec 1;444 Suppl 1:S67-S78. doi: 10.1016/j.ydbio.2018.03.016. Epub 2018 Mar 20.
3
Evolution of anterior Hox regulatory elements among chordates.脊索动物前 Hox 调控元件的演化。
BMC Evol Biol. 2011 Nov 15;11:330. doi: 10.1186/1471-2148-11-330.
4
An atlas of anterior hox gene expression in the embryonic sea lamprey head: Hox-code evolution in vertebrates.前 HOX 基因在胚胎七鳃鳗头部中的表达图谱:脊椎动物的 HOX 编码进化。
Dev Biol. 2019 Sep 1;453(1):19-33. doi: 10.1016/j.ydbio.2019.05.001. Epub 2019 May 6.
5
The branchial Hox code and its implications for gene regulation, patterning of the nervous system and head evolution.鳃弓Hox编码及其对基因调控、神经系统模式形成和头部进化的影响。
Dev Suppl. 1991;Suppl 2:63-77.
6
Hox genes and segmentation of the vertebrate hindbrain.Hox基因与脊椎动物后脑的分节
Curr Top Dev Biol. 2009;88:103-37. doi: 10.1016/S0070-2153(09)88004-6.
7
Evolution of repeated structures along the body axis of jawed vertebrates, insights from the Scyliorhinus canicula Hox code.有颌脊椎动物体轴上重复结构的演化:来自星鲨 Hox 基因簇的启示。
Evol Dev. 2011 May-Jun;13(3):247-59. doi: 10.1111/j.1525-142X.2011.00477.x.
8
A Hox gene regulatory network for hindbrain segmentation.后脑分节的 Hox 基因调控网络。
Curr Top Dev Biol. 2020;139:169-203. doi: 10.1016/bs.ctdb.2020.03.001. Epub 2020 Apr 9.
9
Hox genes and their candidate downstream targets in the developing central nervous system.发育中的中枢神经系统中的Hox基因及其候选下游靶点。
Cell Mol Neurobiol. 2005 Jun;25(3-4):697-741. doi: 10.1007/s10571-005-3971-9.
10
A Hox regulatory network of hindbrain segmentation is conserved to the base of vertebrates.后脑节段化的Hox调控网络在脊椎动物基部是保守的。
Nature. 2014 Oct 23;514(7523):490-3. doi: 10.1038/nature13723. Epub 2014 Sep 14.

引用本文的文献

1
Genetic variation reveals a homeotic long noncoding RNA that modulates human hematopoietic stem cells.基因变异揭示了一种调控人类造血干细胞的同源异型长链非编码RNA。
bioRxiv. 2025 Jul 16:2025.07.16.664824. doi: 10.1101/2025.07.16.664824.
2
and in Human Endometrial Benign Disorders: Unraveling Molecular Pathways and Their Impact on Reproduction.以及在《人类子宫内膜良性疾病:揭示分子途径及其对生殖的影响》中。
Biomolecules. 2025 Apr 10;15(4):563. doi: 10.3390/biom15040563.
3
A differential requirement for ciliary transition zone proteins in human and mouse neural progenitor fate specification.

本文引用的文献

1
RNA in formation and regulation of transcriptional condensates.RNA 的形成和转录凝聚物的调控。
RNA. 2022 Jan;28(1):52-57. doi: 10.1261/rna.078997.121. Epub 2021 Nov 12.
2
Perfect and imperfect views of ultraconserved sequences.超保守序列的完美和不完美视图。
Nat Rev Genet. 2022 Mar;23(3):182-194. doi: 10.1038/s41576-021-00424-x. Epub 2021 Nov 11.
3
Theory and simulations of condensin mediated loop extrusion in DNA.有丝分裂期染色体的形成依赖于 condensin 介导的 DNA 环挤出的理论和模拟。
人类和小鼠神经祖细胞命运特化过程中纤毛过渡区蛋白的差异需求。
Nat Commun. 2025 Apr 5;16(1):3258. doi: 10.1038/s41467-025-58554-3.
4
Ancient genomic linkage of α-globin and Nprl3 couples metabolism with erythropoiesis.α-珠蛋白与Nprl3的古老基因组连锁将新陈代谢与红细胞生成联系起来。
Nat Commun. 2025 Mar 24;16(1):2749. doi: 10.1038/s41467-025-57683-z.
5
Loss of Hoxa5 function affects Hox gene expression in different biological contexts.Hoxa5功能缺失在不同生物学背景下会影响Hox基因的表达。
Sci Rep. 2024 Dec 28;14(1):30903. doi: 10.1038/s41598-024-81867-0.
6
Recurrent hyper-motif circuits in developmental programs.发育程序中的反复出现的超基序回路。
bioRxiv. 2024 Nov 20:2024.11.20.624466. doi: 10.1101/2024.11.20.624466.
7
Comparative Hox genes expression within the dimorphic annelid Streblospio benedicti reveals patterning variation during development.双态环节动物贝氏斯特雷螺体内Hox基因的比较表达揭示了发育过程中的模式变化。
Evodevo. 2024 Sep 27;15(1):12. doi: 10.1186/s13227-024-00231-5.
8
Role of homeobox genes in cancer: immune system interactions, long non-coding RNAs, and tumor progression.同源盒基因在癌症中的作用:免疫系统相互作用、长非编码 RNA 和肿瘤进展。
Mol Biol Rep. 2024 Sep 6;51(1):964. doi: 10.1007/s11033-024-09857-z.
9
HOXA9 versus HOXB9; particular focus on their controversial role in tumor pathogenesis.HOXA9 与 HOXB9;特别关注它们在肿瘤发病机制中的争议性作用。
J Appl Genet. 2024 Sep;65(3):473-492. doi: 10.1007/s13353-024-00868-x. Epub 2024 May 16.
10
Hox gene-specific cellular targeting using split intein Trojan exons.利用分裂内含肽 Trojan 外显子实现 Hox 基因特异性细胞靶向。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2024 Apr 23;121(17):e2317083121. doi: 10.1073/pnas.2317083121. Epub 2024 Apr 11.
Nat Commun. 2021 Oct 7;12(1):5865. doi: 10.1038/s41467-021-26167-1.
4
Mechanisms of Chromosome Folding and Nuclear Organization: Their Interplay and Open Questions.染色体折叠和核组织的机制:它们的相互作用和未解决的问题。
Cold Spring Harb Perspect Biol. 2022 Jul 1;14(7):a040147. doi: 10.1101/cshperspect.a040147.
5
Systematic evaluation of chromosome conformation capture assays.系统评估染色体构象捕获分析技术。
Nat Methods. 2021 Sep;18(9):1046-1055. doi: 10.1038/s41592-021-01248-7. Epub 2021 Sep 3.
6
Rewiring of human neurodevelopmental gene regulatory programs by human accelerated regions.人类加速区对人类神经发育基因调控程序的重编。
Neuron. 2021 Oct 20;109(20):3239-3251.e7. doi: 10.1016/j.neuron.2021.08.005. Epub 2021 Sep 2.
7
Cell-type-specific Hox regulatory strategies orchestrate tissue identity.细胞类型特异性的 Hox 调控策略协调组织身份。
Curr Biol. 2021 Oct 11;31(19):4246-4255.e4. doi: 10.1016/j.cub.2021.07.030. Epub 2021 Aug 5.
8
Segmentation and patterning of the vertebrate hindbrain.脊椎动物后脑的分割与模式形成。
Development. 2021 Aug 1;148(15). doi: 10.1242/dev.186460. Epub 2021 Jul 29.
9
Hi-CO: 3D genome structure analysis with nucleosome resolution.Hi-CO:具有核小体分辨率的三维基因组结构分析。
Nat Protoc. 2021 Jul;16(7):3439-3469. doi: 10.1038/s41596-021-00543-z. Epub 2021 May 28.
10
Dynamic imaging of nascent RNA reveals general principles of transcription dynamics and stochastic splice site selection.新生 RNA 的动态成像揭示了转录动态和随机剪接位点选择的一般原则。
Cell. 2021 May 27;184(11):2878-2895.e20. doi: 10.1016/j.cell.2021.04.012. Epub 2021 May 11.