• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

相似文献

1
Complete Genome Sequence of a Novel Hafnia alvei Bacteriophage.新型蜂房哈夫尼亚菌噬菌体的全基因组序列
Microbiol Resour Announc. 2022 Mar 17;11(3):e0004922. doi: 10.1128/mra.00049-22. Epub 2022 Feb 28.
2
Complete genome sequence of a commensal bacterium, CBA7124, isolated from human feces.从人类粪便中分离出的共生细菌CBA7124的全基因组序列。
Gut Pathog. 2017 Jul 27;9:41. doi: 10.1186/s13099-017-0190-0. eCollection 2017.
3
Phenotypic and genotypic properties of the genus Hafnia.哈夫尼亚菌属的表型和基因型特性。
J Med Microbiol. 2002 Jul;51(7):575-622. doi: 10.1099/0022-1317-51-7-575.
4
Hafnia paralvei sp. nov., formerly known as Hafnia alvei hybridization group 2.法夫纳弧菌新种，原名蜂房哈夫尼亚菌 2 杂交群。
Int J Syst Evol Microbiol. 2010 Aug;60(Pt 8):1725-1728. doi: 10.1099/ijs.0.018606-0. Epub 2009 Sep 4.
5
Whole-Genome Sequence of Hafnia alvei HUMV-5920, a Human Isolate.人源分离株蜂房哈夫尼亚菌HUMV-5920的全基因组序列
Genome Announc. 2016 Jun 16;4(3):e00556-16. doi: 10.1128/genomeA.00556-16.
6
Conversion of glycerol to 1,3-propanediol by Citrobacter freundii and Hafnia alvei - newly isolated strains from the Enterobacteriaceae.弗氏柠檬酸杆菌和蜂房哈夫尼亚菌（新分离的肠杆菌科菌株）将甘油转化为1,3 - 丙二醇的过程
N Biotechnol. 2014 Sep 25;31(5):402-10. doi: 10.1016/j.nbt.2014.04.002. Epub 2014 Apr 21.
7
Outbreak of Klebsiella pneumoniae producing transferable AmpC-type beta-lactamase (ACC-1) originating from Hafnia alvei.源自蜂房哈夫尼亚菌的产可转移AmpC型β-内酰胺酶（ACC-1）肺炎克雷伯菌暴发。
FEMS Microbiol Lett. 2000 Jun 1;187(1):35-40. doi: 10.1111/j.1574-6968.2000.tb09133.x.
8
Complete Genome Sequence of a Myoviridae Bacteriophage Infecting Salmonella enterica Serovar Typhimurium.一种感染肠炎沙门氏菌鼠伤寒血清型的肌尾噬菌体科噬菌体的全基因组序列
Genome Announc. 2016 Sep 29;4(5):e00940-16. doi: 10.1128/genomeA.00940-16.
9
Complete Genome Sequence of IME207, a Novel Bacteriophage Which Can Lyse Multidrug-Resistant Klebsiella pneumoniae and Salmonella.IME207的全基因组序列，一种可裂解耐多药肺炎克雷伯菌和沙门氏菌的新型噬菌体
Genome Announc. 2016 Oct 27;4(5):e01015-16. doi: 10.1128/genomeA.01015-16.
10
Complete genome sequence of Salmonella bacteriophage SPN3US.SPN3US 沙门氏菌噬菌体的全基因组序列。
J Virol. 2011 Dec;85(24):13470-1. doi: 10.1128/JVI.06344-11.

引用本文的文献

1
Revisiting host identification of bacteriophage Enc34: from biochemical to molecular.重新审视噬菌体 Enc34 的宿主鉴定：从生化到分子。
J Virol. 2024 Mar 19;98(3):e0173123. doi: 10.1128/jvi.01731-23. Epub 2024 Feb 8.

本文引用的文献

1
pneumonia: a rare cause of infection in the multimorbid or immunocompromised.肺炎：多系统疾病或免疫功能低下患者感染的罕见病因。
BMJ Case Rep. 2020 Dec 31;13(12):e237061. doi: 10.1136/bcr-2020-237061.
2
Evaluation of the genomic diversity of viruses infecting bacteria, archaea and eukaryotes using a common bioinformatic platform: steps towards a unified taxonomy.利用通用生物信息学平台评估感染细菌、古菌和真核生物的病毒的基因组多样性：迈向统一分类法的步骤。
J Gen Virol. 2018 Sep;99(9):1331-1343. doi: 10.1099/jgv.0.001110. Epub 2018 Jul 17.
3
PhageTerm: a tool for fast and accurate determination of phage termini and packaging mechanism using next-generation sequencing data.噬菌体末端和包装机制的快速准确确定工具：基于下一代测序数据的噬菌体末端和包装机制的快速准确确定工具。
Sci Rep. 2017 Aug 15;7(1):8292. doi: 10.1038/s41598-017-07910-5.
4
Canu: scalable and accurate long-read assembly via adaptive -mer weighting and repeat separation.Canu：通过自适应k-mer加权和重复序列分离实现可扩展且准确的长读长序列拼接
Genome Res. 2017 May;27(5):722-736. doi: 10.1101/gr.215087.116. Epub 2017 Mar 15.
5
Prokka: rapid prokaryotic genome annotation.Prokka：快速的原核生物基因组注释。
Bioinformatics. 2014 Jul 15;30(14):2068-9. doi: 10.1093/bioinformatics/btu153. Epub 2014 Mar 18.
6
Bacteriophage enrichment from water and soil.从水和土壤中富集噬菌体。
Methods Mol Biol. 2009;501:15-21. doi: 10.1007/978-1-60327-164-6_2.
7
ARAGORN, a program to detect tRNA genes and tmRNA genes in nucleotide sequences.ARAGORN，一个用于在核苷酸序列中检测tRNA基因和tmRNA基因的程序。
Nucleic Acids Res. 2004 Jan 2;32(1):11-6. doi: 10.1093/nar/gkh152. Print 2004.
8
GeneMarkS: a self-training method for prediction of gene starts in microbial genomes. Implications for finding sequence motifs in regulatory regions.GeneMarkS：一种用于预测微生物基因组中基因起始位点的自训练方法。对在调控区域中寻找序列基序的启示。
Nucleic Acids Res. 2001 Jun 15;29(12):2607-18. doi: 10.1093/nar/29.12.2607.
9
Improved microbial gene identification with GLIMMER.利用GLIMMER改进微生物基因识别。
Nucleic Acids Res. 1999 Dec 1;27(23):4636-41. doi: 10.1093/nar/27.23.4636.
10
Diagnostic value of a Hafnia-specific bacteriophage.一种哈夫尼亚菌特异性噬菌体的诊断价值。
J Bacteriol. 1968 Aug;96(2):564. doi: 10.1128/jb.96.2.564-.1968.

新型蜂房哈夫尼亚菌噬菌体的全基因组序列

Complete Genome Sequence of a Novel Hafnia alvei Bacteriophage.

作者信息

Bullen Alexander, Grahe Alex, Kassolis Penka, Singleton David R

机构信息

York College of Pennsylvania, York, Pennsylvania, USA.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2022 Mar 17;11(3):e0004922. doi: 10.1128/mra.00049-22. Epub 2022 Feb 28.

DOI:10.1128/mra.00049-22
PMID:35225670
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8928762/
Abstract

A bacteriophage that is able to infect Hafnia alvei and can also infect two other hosts, Klebsiella pneumoniae and Salmonella enterica, was isolated from wastewater. The complete genome sequence was determined by long-read PacBio sequencing. Based on sequence similarity, the bacteriophage is assigned to the viral genus within the family .

摘要

从废水中分离出一种能够感染蜂房哈夫尼亚菌，还能感染另外两种宿主——肺炎克雷伯菌和肠炎沙门氏菌的噬菌体。通过长读长PacBio测序确定了其完整的基因组序列。基于序列相似性，该噬菌体被归入该科的病毒属。