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BodyMapR：一个R包和Shiny应用程序，旨在生成癌症病变的解剖可视化图。

BodyMapR: an R package and Shiny application designed to generate anatomical visualizations of cancer lesions.

作者信息

Miller David M, Shalhout Sophia Z

机构信息

Division of Hematology/Oncology, Department of Medicine, Massachusetts General Hospital, Boston, Massachusetts, USA.

Department of Dermatology, Massachusetts General Hospital, Boston, Massachusetts, USA.

出版信息

JAMIA Open. 2022 Mar 4;5(1):ooac013. doi: 10.1093/jamiaopen/ooac013. eCollection 2022 Apr.

DOI:10.1093/jamiaopen/ooac013
PMID:35274087
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8903180/
Abstract

OBJECTIVES

Structured real-world data (RWD), such as those found in cancer registries, provide a rich source of information regarding the natural history of cancer. Interactive data visualizations of cancer lesions can provide insights into certain clinical tumor characteristics (CTC). Software that can be integrated into an oncological data collection effort and generate anatomical data visualizations of CTC are limited.

MATERIALS AND METHODS

We created BodyMapR: an R package and Shiny application that generates anatomical visualizations of cancer lesions from structured data.

RESULTS

BodyMapR is a Shiny application that transposes structured data from REDCap onto an anatomical map to yield an interactive data visualization.

CONCLUSIONS

BodyMapR is freely available under the MIT license and can be obtained from GitHub. BodyMapR is executed in R and deployed as a Shiny application. It can be integrated into an existing cancer research platform and produces an interactive data visualization of CTC.

摘要

目的

结构化的真实世界数据（RWD），如癌症登记处的数据，提供了关于癌症自然史的丰富信息来源。癌症病变的交互式数据可视化可以提供对某些临床肿瘤特征（CTC）的见解。能够集成到肿瘤学数据收集工作中并生成CTC解剖数据可视化的软件有限。

材料与方法

我们创建了BodyMapR：一个R包和Shiny应用程序，可从结构化数据生成癌症病变的解剖可视化。

结果

BodyMapR是一个Shiny应用程序，可将来自REDCap的结构化数据转换到解剖图上，以产生交互式数据可视化。

结论

BodyMapR根据麻省理工学院许可免费提供，可从GitHub获取。BodyMapR在R中执行并作为Shiny应用程序部署。它可以集成到现有的癌症研究平台中，并生成CTC的交互式数据可视化。

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