• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

甲藻转录概述。

An overview of transcription in dinoflagellates.

作者信息

Zaheri Bahareh, Morse David

机构信息

Institut de Recherche en Biologie Végétale, Département de Sciences Biologiques, 4101 Sherbrooke est, Université de Montréal, Montréal H1X 2B2, Canada.

Institut de Recherche en Biologie Végétale, Département de Sciences Biologiques, 4101 Sherbrooke est, Université de Montréal, Montréal H1X 2B2, Canada.

出版信息

Gene. 2022 Jun 30;829:146505. doi: 10.1016/j.gene.2022.146505. Epub 2022 Apr 18.

DOI:10.1016/j.gene.2022.146505
PMID:35447242
Abstract

Dinoflagellates are a vital diverse family of unicellular algae widespread in various aquatic environments. Typically large genomes and permanently condensed chromosomes without histones make these organisms unique among eukaryotes in terms of chromatin structure and gene expression. Genomic and transcriptomic sequencing projects have provided new insight into the genetic foundation of dinoflagellate behaviors. Genes in tandem arrays, trans-splicing of mRNAs and lower levels of transcriptional regulation compared to other eukaryotes all contribute to the differences seen. Here we present a general overview of transcription in dinoflagellates based on previously described work.

摘要

甲藻是单细胞藻类中一个重要且多样的家族,广泛分布于各种水生环境中。典型的大基因组和无组蛋白的永久浓缩染色体,使这些生物在染色质结构和基因表达方面在真核生物中独具特色。基因组和转录组测序项目为甲藻行为的遗传基础提供了新的见解。串联排列的基因、mRNA的反式剪接以及与其他真核生物相比更低水平的转录调控,都导致了所观察到的差异。在此,我们基于先前描述的工作,对甲藻的转录进行一个总体概述。

相似文献

1
An overview of transcription in dinoflagellates.甲藻转录概述。
Gene. 2022 Jun 30;829:146505. doi: 10.1016/j.gene.2022.146505. Epub 2022 Apr 18.
2
Those amazing dinoflagellate chromosomes.那些神奇的甲藻染色体。
Cell Res. 2003 Aug;13(4):215-7. doi: 10.1038/sj.cr.7290166.
3
Dinoflagellate genome evolution.甲藻基因组进化。
Annu Rev Microbiol. 2011;65:369-87. doi: 10.1146/annurev-micro-090110-102841.
4
Diversity and Divergence of Dinoflagellate Histone Proteins.甲藻组蛋白的多样性与分化
G3 (Bethesda). 2015 Dec 8;6(2):397-422. doi: 10.1534/g3.115.023275.
5
Transcription-dependent domain-scale three-dimensional genome organization in the dinoflagellate Breviolum minutum.微小扁藻中转录依赖的结构域尺度三维基因组组织
Nat Genet. 2021 May;53(5):613-617. doi: 10.1038/s41588-021-00848-5. Epub 2021 Apr 29.
6
Global transcriptional profiling of the toxic dinoflagellate Alexandrium fundyense using Massively Parallel Signature Sequencing.利用大规模平行签名测序技术对有毒甲藻亚历山大藻进行全转录组分析。
BMC Genomics. 2006 Apr 25;7:88. doi: 10.1186/1471-2164-7-88.
7
Genome-wide distribution of 5-hydroxymethyluracil and chromatin accessibility in the Breviolum minutum genome.在 Breviolum minutum 基因组中,5-羟甲基尿嘧啶和染色质可及性的全基因组分布。
Genome Biol. 2024 May 6;25(1):115. doi: 10.1186/s13059-024-03261-3.
8
Topology of splicing and snRNP biogenesis in dinoflagellate nuclei.甲藻细胞核中剪接的拓扑结构和小核核糖核蛋白的生物合成
Biol Cell. 2006 Dec;98(12):709-20. doi: 10.1042/BC20050083.
9
Telomere maintenance in liquid crystalline chromosomes of dinoflagellates.甲藻液晶染色体中的端粒维持
Chromosoma. 2010 Oct;119(5):485-93. doi: 10.1007/s00412-010-0272-y. Epub 2010 Apr 6.
10
Symbiodinium transcriptomes: genome insights into the dinoflagellate symbionts of reef-building corals.共生藻转录组:虫黄藻共生体对造礁珊瑚的基因组解析
PLoS One. 2012;7(4):e35269. doi: 10.1371/journal.pone.0035269. Epub 2012 Apr 18.

引用本文的文献

1
BPA: a BERT-based priority annotation strategy for assessing the rationality of aquatic algal protein sequences.BPA:一种基于BERT的用于评估水藻蛋白质序列合理性的优先级注释策略。
Brief Bioinform. 2025 Jul 2;26(4). doi: 10.1093/bib/bbaf401.
2
Proportional relationship between transcript concentrations and carbon biomass for open ocean plankton groups.大洋浮游生物类群中转录本浓度与碳生物量之间的比例关系。
ISME J. 2025 Jan 2;19(1). doi: 10.1093/ismejo/wraf079.
3
Unveiling the functional nature of retrogenes in dinoflagellates.揭示甲藻中反转录基因的功能本质。
Open Biol. 2025 Apr;15(4):240221. doi: 10.1098/rsob.240221. Epub 2025 Apr 23.
4
Characterization of the enzyme for 5-hydroxymethyluridine production and its role in silencing transposable elements in dinoflagellates. characterization of the enzyme for 5-hydroxymethyluridine production and its role in silencing transposable elements in dinoflagellates
Proc Natl Acad Sci U S A. 2024 Nov 12;121(46):e2400906121. doi: 10.1073/pnas.2400906121. Epub 2024 Nov 7.
5
A decade of dinoflagellate genomics illuminating an enigmatic eukaryote cell.十年的甲藻基因组学研究照亮了神秘的真核细胞。
BMC Genomics. 2024 Oct 4;25(1):932. doi: 10.1186/s12864-024-10847-5.
6
Dinoflagellate mRNA is pervasively modified with mA.甲藻的信使核糖核酸普遍被N6-甲基腺嘌呤修饰。
EMBO Rep. 2024 Nov;25(11):4634-4635. doi: 10.1038/s44319-024-00263-x. Epub 2024 Sep 20.
7
Abundant mRNA mA modification in dinoflagellates: a new layer of gene regulation.甲藻中丰富的 mRNA mA 修饰:基因调控的新层次。
EMBO Rep. 2024 Nov;25(11):4655-4673. doi: 10.1038/s44319-024-00234-2. Epub 2024 Sep 2.
8
Membrane association of active genes organizes the chloroplast nucleoid structure.活性基因的膜结合组织叶绿体核区结构。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2024 Jul 9;121(28):e2309244121. doi: 10.1073/pnas.2309244121. Epub 2024 Jul 5.