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2022 年 1 月在芬兰北部检测到的重组 XJ 谱系 SARS-CoV-2 变异株的基因组和流行病学报告。

Genomic and epidemiological report of the recombinant XJ lineage SARS-CoV-2 variant, detected in northern Finland, January 2022.

机构信息

Department of Health Security, Finnish Institute for Health and Welfare (THL), Helsinki, Finland.

Department of Virology, Faculty of Medicine, University of Helsinki, Helsinki, Finland.

出版信息

Euro Surveill. 2022 Apr;27(16). doi: 10.2807/1560-7917.ES.2022.27.16.2200257.

Abstract

Recombinant sequences of the SARS-CoV-2 Omicron variant were detected in surveillance samples collected in north-western Finland in January 2022. We detected 191 samples with an identical genome arrangement in weeks 3 to 11, indicating sustained community transmission. The recombinant lineage has a 5'-end of BA.1, a recombination breakpoint between and (nucleotide position 13,296-15,240) and a 3'-end of BA.2 including the gene. We describe the available genomic and epidemiological data about this currently circulating recombinant XJ lineage.

摘要

2022 年 1 月,在芬兰西北部的监测样本中检测到了 SARS-CoV-2 奥密克戎变体的重组序列。在第 3 周至第 11 周,我们检测到了 191 个具有相同基因组排列的样本,表明持续的社区传播。该重组谱系具有 BA.1 的 5'-端、和(核苷酸位置 13296-15240)之间的重组断点以及包括基因的 BA.2 的 3'-端。我们描述了关于这种当前循环的重组 XJ 谱系的可用基因组和流行病学数据。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/f82c/9027151/062520ab1dd8/2200257-f1.jpg

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