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在光学镊子实验中,手柄弹性的不合适方法。

A fit-less approach to the elasticity of the handles in optical tweezers experiments.

机构信息

INFN Firenze, via Sansone 1, 50019, Sesto Fiorentino, Italy.

ISIS "Leonardo da Vinci", via del Terzolle 91, 50127, Florence, Italy.

出版信息

Eur Biophys J. 2022 Jul;51(4-5):413-418. doi: 10.1007/s00249-022-01603-2. Epub 2022 May 23.

DOI:10.1007/s00249-022-01603-2
PMID:35599262
Abstract

The elastic properties of the double-stranded DNA handles used in optical tweezers experiments on biomolecules are customarily modeled by an extensible worm-like chain model. Fitting such a model to experimental data, however, is no trivial task, as the function depends on four parameters in a highly non-linear fashion. We hereby propose a method to bypass the fitting procedure and obtain an empirical force vs. extension curve that accurately reproduces the elasticity of the handles.

摘要

在生物分子的光学镊子实验中,双链 DNA 手柄的弹性特性通常通过可伸缩的蠕虫链模型来模拟。然而,拟合这样的模型并不是一件简单的事情,因为该函数以高度非线性的方式取决于四个参数。在此,我们提出了一种绕过拟合过程的方法,得到了一个经验力与伸长曲线,该曲线可以准确地再现手柄的弹性。

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