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超越大脑:多模态成像数据规范扩展到多种模态和解剖区域。

Beyond the Brain: MIDS Extends BIDS to Multiple Modalities and Anatomical Regions.

作者信息

Saborit-Torres Jose Manuel, Nadal-Almela Silvia, Montell-Serrano Joaquim Angel, Oliver-Garcia Elena, Carceller Hector, Gómez-Ádrian Jon Ander, Caparrós-Redondo Marisa, García-García Francisco, Domenech-Fernández Julio, De La Iglesia-Vayá Maria

机构信息

Unidad Mixta de Imagen Biomédica FISABIO-CIPF. Fundación para el Fomento de la Investigación Sanitaria y Biomédica de la Comunidad Valenciana - València, Spain.

CIBERSAM, ISC III. Av. Blasco Ibáñez 15, 46010 - València, Spain.

出版信息

Stud Health Technol Inform. 2022 May 25;294:413-414. doi: 10.3233/SHTI220488.

DOI:10.3233/SHTI220488
PMID:35612110
Abstract

Brain Imaging Data Structure (BIDS) provides a valuable tool to organise brain imaging data into a clear and easy standard directory structure. Moreover, BIDS is widely supported by the scientific community and has been established as a powerful standard for medical imaging management. Nonetheless, the original BIDS is restricted to magnetic resonance imaging (MRI) of the brain, limiting its implantation to other techniques and anatomical regions. We developed Medical Imaging Data Structure (MIDS), conceived to extend BIDS methodology to other anatomical regions and multiple imaging systems in these areas. The MIDS standard was developed to store and manage medical images as an extension of BIDS. It allows the user to handily save studies of multiple anatomical regions and imaging techniques. Besides, MIDS improves the classification of multiple images within the structure, allowing the possibility to unify them in a single study to apply on them preprocessing or artificial intelligence algorithms. Finally, the results generated are saved in the derivatives folder.

摘要

脑成像数据结构(BIDS)提供了一个有价值的工具,可将脑成像数据组织成清晰、简易的标准目录结构。此外,BIDS得到了科学界的广泛支持,并已成为医学成像管理的强大标准。尽管如此,原始的BIDS仅限于脑部磁共振成像(MRI),限制了其在其他技术和解剖区域的应用。我们开发了医学成像数据结构(MIDS),旨在将BIDS方法扩展到其他解剖区域以及这些区域中的多种成像系统。MIDS标准是作为BIDS的扩展而开发的,用于存储和管理医学图像。它允许用户方便地保存多个解剖区域和成像技术的研究。此外,MIDS改进了结构内多个图像的分类,使得有可能将它们统一在一项研究中,以便对其应用预处理或人工智能算法。最后,生成的结果保存在衍生文件夹中。

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