Suppr超能文献

裂殖酵母中通过 Qng1 介导的水解作用将 Queuosine 回收为 Queuine。

Queuosine salvage in fission yeast by Qng1-mediated hydrolysis to queuine.

机构信息

Institut für Biologie, Lebenswissenschaftliche Fakultät, Humboldt-Universität zu Berlin, 10099, Berlin, Germany.

Ludwig-Maximilians-Universität München, Department of Chemistry and Biochemistry, Butenandtstraße 5-13, 81377, München, Germany.

出版信息

Biochem Biophys Res Commun. 2022 Oct 8;624:146-150. doi: 10.1016/j.bbrc.2022.07.104. Epub 2022 Jul 31.

Abstract

Queuosine (Q) is a hypermodified 7-deaza-guanosine nucleoside that is found at position 34, also known as the wobble position, of tRNAs with a GUN anticodon, and Q ensures faithful translation of the respective C- and U-ending codons. While Q is present in tRNAs in most eukaryotes, only bacteria can synthesize it denovo. In contrast, eukaryotes rely on external sources like their food and the gut microbiome in order to Q-modify their tRNAs, and Q therefore can be regarded as a micronutrient. The eukaryotic tRNA guanine transglycosylase (eTGT) uses the base queuine (q) as a substrate to replace G34 by Q in the tRNAs. Eukaryotic cells can uptake both q and Q, raising the question how the Q nucleoside is converted to q for incorporation into the tRNAs. Here, we identified Qng1 (also termed Duf2419) as a queuosine nucleoside glycosylase in Schizosaccharomyces pombe. S. pombe cells with a deletion of qng1 contained Q-modified tRNAs only when cultured in the presence of the nucleobase q, but not with the nucleoside Q, indicating that the cells are proficient at q incorporation, but not in Q hydrolysis. Furthermore, purified recombinant Qng1 hydrolyzed Q to q in vitro. Qng1 displays homology to DNA glycosylases and has orthologs across eukaryotes, including flies, mice and humans. Qng1 therefore plays an essential role in allowing eukaryotic cells to salvage Q from bacterial sources and to recycle Q from endogenous tRNAs.

摘要

Queuosine (Q) 是一种超修饰的 7-脱氮鸟嘌呤核苷,存在于具有 GUN 反密码子的 tRNA 的 34 位,也称为摆动位置,Q 可确保相应的 C 和 U 结尾密码子的忠实翻译。虽然 Q 存在于大多数真核生物的 tRNA 中,但只有细菌能够从头合成它。相比之下,真核生物依赖于外部来源,如食物和肠道微生物组,以对 tRNA 进行 Q 修饰,因此 Q 可以被视为一种微量营养素。真核 tRNA 鸟嘌呤转移酶 (eTGT) 使用碱基 queuine (q) 作为底物,在 tRNA 中将 G34 替换为 Q。真核细胞可以摄取 q 和 Q,这就提出了一个问题,即 Q 核苷如何转化为 q 以掺入 tRNA 中。在这里,我们在酿酒酵母中鉴定出 Qng1(也称为 Duf2419)为 queuosine 核苷糖苷酶。在 qng1 缺失的酿酒酵母细胞中,只有在存在碱基 q 的情况下才能检测到 Q 修饰的 tRNA,但不存在核苷 Q,表明细胞能够有效地掺入 q,但不能水解 Q。此外,纯化的重组 Qng1 在体外将 Q 水解为 q。Qng1 与 DNA 糖苷酶具有同源性,并且在真核生物中具有同源物,包括苍蝇、老鼠和人类。因此,Qng1 在允许真核细胞从细菌来源中回收 Q 和从内源性 tRNA 中循环利用 Q 方面发挥着重要作用。

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