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系统测序输入病例导致在越南北中部检测到 SARS-CoV-2 B.1.1.529(奥密克戎)变异株。

Systematic sequencing of imported cases leads to detection of SARS-CoV-2 B.1.1.529 (Omicron) variant in central Viet Nam.

机构信息

Pasteur Institute in Nha Trang, Nha Trang, Viet Nam.

U.S. Centers for Disease Control and Prevention, Hanoi, Viet Nam.

出版信息

Western Pac Surveill Response J. 2022 Nov 23;13(4):1-4. doi: 10.5365/wpsar.2022.13.4.977. eCollection 2022 Oct-Dec.

DOI:10.5365/wpsar.2022.13.4.977
PMID:36817495
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9912268/
Abstract

As authorities braced for the arrival of the Omicron variant of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), infrastructure investments and government directives prompted action in central Viet Nam to establish capacity for genomic surveillance sequencing. From 17 November 2021 to 7 January 2022, the Pasteur Institute in Nha Trang sequenced 162 specimens from 98 150 confirmed SARS-CoV-2 cases in the region collected from 8 November to 31 December 2021. Of these, all 127 domestic cases were identified as the B.1.617.2 (Delta) variant, whereas 92% (32/35) of imported cases were identified as the B.1.1.529 (Omicron) variant, all among international flight passengers. Patients were successfully isolated, enabling health-care workers to prepare for additional cases. Most (78%) of the 32 Omicron cases were fully vaccinated, suggesting continued importance of public health and social measures to control the spread of new variants.

摘要

随着当局为严重急性呼吸综合征冠状病毒 2(SARS-CoV-2)的奥密克戎变体的到来做准备,基础设施投资和政府指令促使越南中部采取行动,建立基因组监测测序能力。从 2021 年 11 月 17 日至 2022 年 1 月 7 日,芽庄巴斯德研究所对 2021 年 11 月 8 日至 12 月 31 日期间从该地区 98150 例确诊的 SARS-CoV-2 病例中采集的 162 个样本进行了测序。其中,所有 127 例国内病例均被鉴定为 B.1.617.2(德尔塔)变体,而 92%(32/35)的输入性病例被鉴定为 B.1.1.529(奥密克戎)变体,均为国际航班旅客。患者被成功隔离,使医护人员能够为更多病例做好准备。32 例奥密克戎病例中,大多数(78%)完全接种了疫苗,这表明继续采取公共卫生和社会措施控制新变体的传播仍然很重要。

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