• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

从塔吉克斯坦葡萄植株中分离出的放射形土壤杆菌MD22b菌株的基因组序列草图

Draft Genome Sequence of Agrobacterium radiobacter Strain MD22b, Isolated from a Grape Plant in Tajikistan.

作者信息

Dzhuraeva Munavvara, Bobodzhanova Khursheda, Javier-Lopez Rubén, Tediashvili Marina, Jaiani Ekaterine, Birkeland Nils-Kåre

机构信息

Center of Biotechnology of the Tajik National University, Dushanbe, Tajikistan.

G. Eliava Institute of Bacteriophages, Microbiology and Virology, Tbilisi, Georgia.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2023 Apr 18;12(4):e0113122. doi: 10.1128/mra.01131-22. Epub 2023 Mar 20.

DOI:10.1128/mra.01131-22
PMID:36939329
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10112236/
Abstract

Agrobacterium radiobacter strain MD22b was isolated from infected fruit from Vatan Farm, a dekhkan farm in Yangibog (Tursunzade, Tajikistan). The 5.7-Mbp draft genome sequence presented here shares homology with chromosomes 1 and 2, as well as with the Ti plasmid from agrobacteria.

摘要

放射土壤杆菌MD22b菌株是从位于塔吉克斯坦图尔孙扎德扬吉博的一个德坎农场——瓦坦农场受感染的果实中分离出来的。这里呈现的570万碱基对的基因组草图序列与1号和2号染色体以及土壤杆菌的Ti质粒具有同源性。

相似文献

1
Draft Genome Sequence of Agrobacterium radiobacter Strain MD22b, Isolated from a Grape Plant in Tajikistan.从塔吉克斯坦葡萄植株中分离出的放射形土壤杆菌MD22b菌株的基因组序列草图
Microbiol Resour Announc. 2023 Apr 18;12(4):e0113122. doi: 10.1128/mra.01131-22. Epub 2023 Mar 20.
2
Improved genome of type strain provides new taxonomic insight into genomospecies 4.模式菌株基因组的改进为基因组种4提供了新的分类学见解。
PeerJ. 2019 Feb 8;7:e6366. doi: 10.7717/peerj.6366. eCollection 2019.
3
Genomic analysis of Agrobacterium radiobacter DSM 30147(T) and emended description of A. radiobacter (Beijerinck and van Delden 1902) Conn 1942 (Approved Lists 1980) emend. Sawada et al. 1993.放射土壤杆菌DSM 30147(T)的基因组分析及放射土壤杆菌（拜耶林克和范德尔登，1902年）康恩，1942年（1980年《核准名录》）修订版。泽田等人，1993年修订说明
Stand Genomic Sci. 2014 Jan 2;9(3):574-84. doi: 10.4056/sigs.4688352. eCollection 2014 Jun 15.
4
Complete genomic sequence and phylogenomics analysis of Agrobacterium strain AB2/73: a new Rhizobium species with a unique mega-Ti plasmid.完整基因组序列和系统发育基因组学分析的根癌农杆菌菌株 AB2/73：一个新的根瘤菌物种与独特的 mega-Ti 质粒。
BMC Microbiol. 2021 Oct 28;21(1):295. doi: 10.1186/s12866-021-02358-0.
5
Pathogenicity, Phylogenetic relationship and NGS based identification and assembly of tumorigenic Agrobacterium radiabacter plasmidic and chromosomic reads isolated from Prunus duclcis.从李树中分离的致瘤农杆菌放射性根瘤菌质粒和染色体读段的致病性、系统发育关系及基于 NGS 的鉴定和组装。
Genomics. 2019 Dec;111(6):1423-1430. doi: 10.1016/j.ygeno.2018.09.015. Epub 2018 Oct 1.
6
Plasmids in avirulent strains of Agrobacterium.根癌土壤杆菌无毒菌株中的质粒
J Bacteriol. 1977 Jan;129(1):76-80. doi: 10.1128/jb.129.1.76-80.1977.
7
Behavior of a Virulent Strain Derived from Agrobacterium radiobacter Strain K84 After Spontaneous Ti Plasmid Acquisition.自发获得 Ti 质粒后源自根癌农杆菌 K84 菌株的毒性菌株的行为。
Phytopathology. 1999 Apr;89(4):286-92. doi: 10.1094/PHYTO.1999.89.4.286.
8
Recovery of a strain of Agrobacterium radiobacter with a mucoid phenotype from an immunocompromised child with bacteremia.从一名患有菌血症的免疫功能低下儿童中分离出一株具有黏液样表型的放射形土壤杆菌。
J Clin Microbiol. 1993 Sep;31(9):2541-3. doi: 10.1128/jcm.31.9.2541-2543.1993.
9
Draft Genome Sequence of Escherichia coli Strain Tj, Isolated from the Varzob River in Tajikistan.从塔吉克斯坦瓦尔佐布河分离出的大肠杆菌菌株Tj的基因组序列草图
Microbiol Resour Announc. 2020 Oct 8;9(41):e00867-20. doi: 10.1128/MRA.00867-20.
10
Attachment of agrobacteria to grape cells.农杆菌附着在葡萄细胞上。
Appl Environ Microbiol. 1993 Aug;59(8):2572-7. doi: 10.1128/aem.59.8.2572-2577.1993.

本文引用的文献

1
TYGS and LPSN: a database tandem for fast and reliable genome-based classification and nomenclature of prokaryotes.TYGS 和 LPSN：用于快速可靠的基于基因组的原核生物分类和命名的数据库串联。
Nucleic Acids Res. 2022 Jan 7;50(D1):D801-D807. doi: 10.1093/nar/gkab902.
2
Draft Genome Sequence of Escherichia coli Strain Tj, Isolated from the Varzob River in Tajikistan.从塔吉克斯坦瓦尔佐布河分离出的大肠杆菌菌株Tj的基因组序列草图
Microbiol Resour Announc. 2020 Oct 8;9(41):e00867-20. doi: 10.1128/MRA.00867-20.
3
CheckM: assessing the quality of microbial genomes recovered from isolates, single cells, and metagenomes.
CheckM：评估从分离株、单细胞和宏基因组中获得的微生物基因组质量。
Genome Res. 2015 Jul;25(7):1043-55. doi: 10.1101/gr.186072.114. Epub 2015 May 14.
4
Genomic analysis of Agrobacterium radiobacter DSM 30147(T) and emended description of A. radiobacter (Beijerinck and van Delden 1902) Conn 1942 (Approved Lists 1980) emend. Sawada et al. 1993.放射土壤杆菌DSM 30147(T)的基因组分析及放射土壤杆菌（拜耶林克和范德尔登，1902年）康恩，1942年（1980年《核准名录》）修订版。泽田等人，1993年修订说明
Stand Genomic Sci. 2014 Jan 2;9(3):574-84. doi: 10.4056/sigs.4688352. eCollection 2014 Jun 15.
5
Historical account on gaining insights on the mechanism of crown gall tumorigenesis induced by Agrobacterium tumefaciens.有关根癌农杆菌诱导冠瘿瘤发生机制的见解的历史记载。
Front Microbiol. 2014 Aug 7;5:340. doi: 10.3389/fmicb.2014.00340. eCollection 2014.
6
Genome sequence-based species delimitation with confidence intervals and improved distance functions.基于基因组序列的具有置信区间和改进距离函数的物种界定。
BMC Bioinformatics. 2013 Feb 21;14:60. doi: 10.1186/1471-2105-14-60.
7
Long PCR-RFLP of 16S-ITS-23S rRNA genes: a high-resolution molecular tool for bacterial genotyping.16S-ITS-23S rRNA 基因的长 PCR-RFLP：一种用于细菌基因分型的高分辨率分子工具。
J Appl Microbiol. 2013 Feb;114(2):433-47. doi: 10.1111/jam.12057. Epub 2012 Dec 20.
8
BLAST Ring Image Generator (BRIG): simple prokaryote genome comparisons.BLAST 环图像生成器（BRIG）：简单的原核生物基因组比较。
BMC Genomics. 2011 Aug 8;12:402. doi: 10.1186/1471-2164-12-402.
9
DNA-DNA hybridization values and their relationship to whole-genome sequence similarities.DNA-DNA杂交值及其与全基因组序列相似性的关系。
Int J Syst Evol Microbiol. 2007 Jan;57(Pt 1):81-91. doi: 10.1099/ijs.0.64483-0.