• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

六种犀金龟诺达病毒分离株的全基因组序列

Complete Genome Sequences of Six Isolates of the Oryctes rhinoceros Nudivirus.

作者信息

Weston Mitchell K, Hefer Charles A, Jacobs Jeanne M E, Marshall Sean D G

机构信息

Resilient Agriculture, AgResearch Limited, Lincoln Research Centre, Christchurch, New Zealand.

Digital Agriculture, AgResearch Limited, Lincoln Research Centre, Christchurch, New Zealand.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2023 Aug 22;12(8):e0012623. doi: 10.1128/mra.00126-23. Epub 2023 Jul 5.

DOI:10.1128/mra.00126-23
PMID:37404176
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10443312/
Abstract

Oryctes rhinoceros nudivirus, a double-stranded DNA virus of the family , is an important biocontrol agent of the coconut rhinoceros beetle (Coleoptera: Scarabaeidae). We present the genome sequences of six isolates of Oryctes rhinoceros nudivirus collected from the Philippines, Papua New Guinea, and Tanzania between the years 1977 and 2016.

摘要

椰心叶甲杆状病毒,一种属于杆状病毒科的双链DNA病毒,是椰心叶甲(鞘翅目:金龟子科)的一种重要生物防治剂。我们展示了1977年至2016年间从菲律宾、巴布亚新几内亚和坦桑尼亚收集的6株椰心叶甲杆状病毒分离株的基因组序列。

相似文献

1
Complete Genome Sequences of Six Isolates of the Oryctes rhinoceros Nudivirus.六种犀金龟诺达病毒分离株的全基因组序列
Microbiol Resour Announc. 2023 Aug 22;12(8):e0012623. doi: 10.1128/mra.00126-23. Epub 2023 Jul 5.
2
Transcription Profile and Genomic Variations of Oryctes Rhinoceros Nudivirus in Coconut Rhinoceros Beetles.椰子红胸龟象鼻虫中犀角虹彩病毒的转录谱和基因组变异。
J Virol. 2020 Oct 27;94(22). doi: 10.1128/JVI.01097-20.
3
Diverse Host Immune Responses of Different Geographical Populations of the Coconut Rhinoceros Beetle to Oryctes Rhinoceros Nudivirus (OrNV) Infection.不同地理种群的椰子犀甲蠹对红棕象甲虹彩病毒(OrNV)感染的宿主免疫反应的多样性。
Microbiol Spectr. 2021 Oct 31;9(2):e0068621. doi: 10.1128/Spectrum.00686-21. Epub 2021 Sep 15.
4
Complete genome sequence of Oryctes rhinoceros nudivirus isolated from the coconut rhinoceros beetle in Solomon Islands.从所罗门群岛的椰子犀角甲虫中分离到的犀角金龟子双瓣病毒的全基因组序列。
Virus Res. 2020 Mar;278:197864. doi: 10.1016/j.virusres.2020.197864. Epub 2020 Jan 13.
5
A high-quality de novo genome assembly based on nanopore sequencing of a wild-caught coconut rhinoceros beetle (Oryctes rhinoceros).基于纳米孔测序的野生椰子鳞翅目象鼻虫(Oryctes rhinoceros)高质量从头基因组组装。
BMC Genomics. 2022 Jun 7;23(1):426. doi: 10.1186/s12864-022-08628-z.
6
Genomic identification of Oryctes rhinoceros nudivirus isolates, a biocontrol agent for coconut rhinoceros beetle.鉴定椰心叶甲啮小蜂的共生病毒——红棕象甲虹彩病毒的基因组。
Arch Microbiol. 2024 Sep 26;206(10):417. doi: 10.1007/s00203-024-04116-y.
7
A new haplotype of the coconut rhinoceros beetle, Oryctes rhinoceros, has escaped biological control by Oryctes rhinoceros nudivirus and is invading Pacific Islands.一种新型的椰子独角仙(Oryctes rhinoceros)单倍型已经逃脱了椰子独角仙坏死病毒的生物控制,并正在入侵太平洋岛屿。
J Invertebr Pathol. 2017 Oct;149:127-134. doi: 10.1016/j.jip.2017.07.006. Epub 2017 Jul 22.
8
Confirmation of Oryctes rhinoceros nudivirus infections in G-haplotype coconut rhinoceros beetles (Oryctes rhinoceros) from Palauan PCR-positive populations.确认帕劳 PCR 阳性种群中 G 单倍型椰子鳞翅目象鼻虫(Oryctes rhinoceros)感染了 Oryctes rhinoceros nudivirus。
Sci Rep. 2021 Sep 20;11(1):18820. doi: 10.1038/s41598-021-97426-w.
9
Examination of population genetics of the Coconut Rhinoceros Beetle () and the incidence of its biocontrol agent (Oryctes rhinoceros nudivirus) in the South Pacific Islands.对南太平洋诸岛椰心叶甲的种群遗传学及其生物防治剂(椰心叶甲杆状病毒)的发生率进行研究。
Curr Res Insect Sci. 2021 May 13;1:100015. doi: 10.1016/j.cris.2021.100015. eCollection 2021.
10
Complete genome sequence of an oryctes rhinoceros nudivirus isolated from Korean rhinoceros beetles (Trypoxylus dichotomus) in Korea.从韩国采集的双叉犀金龟(Trypoxylus dichotomus)中分离的一种鳞翅目昆虫虹彩病毒的全基因组序列。
Virus Res. 2023 Oct 2;335:199167. doi: 10.1016/j.virusres.2023.199167. Epub 2023 Aug 23.

引用本文的文献

1
Genomic identification of Oryctes rhinoceros nudivirus isolates, a biocontrol agent for coconut rhinoceros beetle.鉴定椰心叶甲啮小蜂的共生病毒——红棕象甲虹彩病毒的基因组。
Arch Microbiol. 2024 Sep 26;206(10):417. doi: 10.1007/s00203-024-04116-y.

本文引用的文献

1
Confirmation of Oryctes rhinoceros nudivirus infections in G-haplotype coconut rhinoceros beetles (Oryctes rhinoceros) from Palauan PCR-positive populations.确认帕劳 PCR 阳性种群中 G 单倍型椰子鳞翅目象鼻虫(Oryctes rhinoceros)感染了 Oryctes rhinoceros nudivirus。
Sci Rep. 2021 Sep 20;11(1):18820. doi: 10.1038/s41598-021-97426-w.
2
yacrd and fpa: upstream tools for long-read genome assembly.YACRD 和 FPA:用于长读长基因组组装的上游工具。
Bioinformatics. 2020 Jun 1;36(12):3894-3896. doi: 10.1093/bioinformatics/btaa262.
3
Magic-BLAST, an accurate RNA-seq aligner for long and short reads.Magic-BLAST,一款适用于长读长和短读长的精确 RNA-seq 比对工具。
BMC Bioinformatics. 2019 Jul 25;20(1):405. doi: 10.1186/s12859-019-2996-x.
4
Performance of neural network basecalling tools for Oxford Nanopore sequencing.基于神经网络的牛津纳米孔测序碱基调用工具的性能。
Genome Biol. 2019 Jun 24;20(1):129. doi: 10.1186/s13059-019-1727-y.
5
Assembly of long, error-prone reads using repeat graphs.使用重复图组装长的、易错的读取。
Nat Biotechnol. 2019 May;37(5):540-546. doi: 10.1038/s41587-019-0072-8. Epub 2019 Apr 1.
6
NanoPack: visualizing and processing long-read sequencing data.NanoPack:可视化和处理长读测序数据。
Bioinformatics. 2018 Aug 1;34(15):2666-2669. doi: 10.1093/bioinformatics/bty149.
7
A new haplotype of the coconut rhinoceros beetle, Oryctes rhinoceros, has escaped biological control by Oryctes rhinoceros nudivirus and is invading Pacific Islands.一种新型的椰子独角仙(Oryctes rhinoceros)单倍型已经逃脱了椰子独角仙坏死病毒的生物控制,并正在入侵太平洋岛屿。
J Invertebr Pathol. 2017 Oct;149:127-134. doi: 10.1016/j.jip.2017.07.006. Epub 2017 Jul 22.
8
Canu: scalable and accurate long-read assembly via adaptive -mer weighting and repeat separation.Canu:通过自适应k-mer加权和重复序列分离实现可扩展且准确的长读长序列拼接
Genome Res. 2017 May;27(5):722-736. doi: 10.1101/gr.215087.116. Epub 2017 Mar 15.
9
Circlator: automated circularization of genome assemblies using long sequencing reads.Circlator:利用长测序读段实现基因组组装的自动化环化
Genome Biol. 2015 Dec 29;16:294. doi: 10.1186/s13059-015-0849-0.
10
Pilon: an integrated tool for comprehensive microbial variant detection and genome assembly improvement.Pilon:一种用于全面微生物变异检测和基因组组装改进的集成工具。
PLoS One. 2014 Nov 19;9(11):e112963. doi: 10.1371/journal.pone.0112963. eCollection 2014.