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两种肉豆蔻属植物(1891年瓦尔贝命名和1774年霍特命名,肉豆蔻科)的完整叶绿体基因组

Complete chloroplast genome of two nutmeg species, Warb. 1891 and Houtt. 1774 (Myristicaceae).

作者信息

Kusuma Jakty, Couderc Marie, Scarcelli Nora, Duminil Jérôme

机构信息

DIADE, University of Montpellier, IRD, CIRAD, Montpellier, France.

Politeknik Negeri Lampung, Lampung, Indonesia.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2023 Jul 19;8(7):751-755. doi: 10.1080/23802359.2023.2233154. eCollection 2023.

Abstract

Warb. 1891 and Houtt. 1774 are two South-East Asian food tree species. They are harvested from the wild or cultivated for local uses as a condiment (nutmeg and mace), medicine, and source of wood. In this study, we reconstructed the complete chloroplast (cp) genomes of these two species from whole genome sequencing data using the Illumina NovaSeq platform. The genome sizes of and were respectively 155,871 base pairs (bp) and 155,898 bp, including 126 genes and an overall GC content of 39.20% in both species. Our study provides useful resources for future evolutionary research and diversity analysis of species.

摘要

沃伯格(1891年)和霍特(1774年)所描述的是两种东南亚食用树种。它们是从野外采集或人工种植的,用于当地作为调味品(肉豆蔻和肉豆蔻衣)、药材以及木材来源。在本研究中,我们使用Illumina NovaSeq平台,从全基因组测序数据中重建了这两个物种的完整叶绿体(cp)基因组。这两个物种的基因组大小分别为155,871碱基对(bp)和155,898 bp,包含126个基因,两种物种的总体GC含量均为39.20%。我们的研究为该物种未来的进化研究和多样性分析提供了有用的资源。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0462/10361002/f9d631df4af2/TMDN_A_2233154_F0001_C.jpg

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