• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

中国广西地区家猪乳头瘤病毒 1 型的遗传特征。

Genetic characterization of Sus scrofa papillomavirus type 1 from domestic pigs in Guangxi Province, China.

机构信息

Institute of Virology, Wenzhou University, Wenzhou, 325035, China.

The Second Affiliated Hospital and Yuying Children's Hospital of Wenzhou Medical University, Wenzhou, 325027, China.

出版信息

Braz J Microbiol. 2023 Sep;54(3):2437-2443. doi: 10.1007/s42770-023-01092-1. Epub 2023 Aug 14.

DOI:10.1007/s42770-023-01092-1
PMID:37578737
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10484830/
Abstract

Sus scrofa papillomatosis (SsP) is a tumour caused by Sus scrofa papillomaviruses (SsPVs). To investigate the presence of SsPVs in China, 354 domestic pig skin samples collected from Guangxi Province were examined for SsPV DNA by PCR. Three SsPV1s (GX12, GX14, and GX18) were identified with a prevalence of 0.847% (3/354). Sequence analysis showed that L1 of SsPV1/GX12 and SsPV1/GX14 had 99.7% and 99.6% nucleotide identify with the reference SsPV1a, respectively. Phylogenetic and evolutionary analyses showed that SsPV1/GX12 and SsPV1/14 clustered into SsPV1a and that SsPV1/GX18 clustered into SsPV1b. Compared with other SsPV L1 and L2 proteins, we found that the SsPV1/GX18 and SsPV1b strains shared the same unique substitutions, and SsPV1/GX12, SsPV1/GX14, and SsPV1a shared almost identical amino acid sequences. This study reports the first detection of SsPV DNA in China based on whole genome information and provides a scientific basis for the development of SsPV pathogenic biology, epidemiology, and prevention, as well as control technology research.

摘要

猪乳头状瘤病(SsP)是由猪乳头状瘤病毒(SsPVs)引起的肿瘤。为了调查中国是否存在 SsPVs,本研究采用 PCR 方法对从广西采集的 354 份家猪皮肤样本进行了 SsPV DNA 检测。鉴定出 3 株 SsPV1(GX12、GX14 和 GX18),阳性率为 0.847%(3/354)。序列分析表明,SsPV1/GX12 和 SsPV1/GX14 的 L1 核苷酸与参考 SsPV1a 的同源性分别为 99.7%和 99.6%。系统进化和遗传进化分析表明,SsPV1/GX12 和 SsPV1/GX14 聚类于 SsPV1a 分支,SsPV1/GX18 聚类于 SsPV1b 分支。与其他 SsPV L1 和 L2 蛋白相比,我们发现 SsPV1/GX18 和 SsPV1b 株具有相同的独特取代,而 SsPV1/GX12、SsPV1/GX14 和 SsPV1a 株具有几乎相同的氨基酸序列。本研究基于全基因组信息首次报道了中国 SsPV DNA 的检测,为 SsPV 致病生物学、流行病学和预防以及控制技术研究提供了科学依据。

相似文献

1
Genetic characterization of Sus scrofa papillomavirus type 1 from domestic pigs in Guangxi Province, China.中国广西地区家猪乳头瘤病毒 1 型的遗传特征。
Braz J Microbiol. 2023 Sep;54(3):2437-2443. doi: 10.1007/s42770-023-01092-1. Epub 2023 Aug 14.
2
Isolation and cloning of two variant papillomaviruses from domestic pigs: Sus scrofa papillomaviruses type 1 variants a and b.从家猪中分离和克隆两种变异乳头瘤病毒:猪乳头瘤病毒1型变异体a和b。
J Gen Virol. 2008 Oct;89(Pt 10):2475-2481. doi: 10.1099/vir.0.2008/003186-0.
3
Evidence for swine and human papillomavirus in pig slurry in Italy.意大利猪粪中猪和人乳头瘤病毒的证据。
J Appl Microbiol. 2019 Oct;127(4):1246-1254. doi: 10.1111/jam.14363. Epub 2019 Jul 12.
4
Evolution and genetic diversity of atypical porcine pestivirus (APPV) from piglets with congenital tremor in Guangxi Province, Southern China.中国南方广西省仔猪先天性震颤中异常猪瘟病毒(APPV)的进化和遗传多样性。
Vet Med Sci. 2021 May;7(3):714-723. doi: 10.1002/vms3.407. Epub 2020 Dec 13.
5
Sus scrofa papillomavirus 2 - genetic characterization of a novel suid papillomavirus from wild boar in Germany.猪乳头瘤病毒2型——德国野猪中一种新型猪乳头瘤病毒的基因特征分析
J Gen Virol. 2017 Aug;98(8):2113-2117. doi: 10.1099/jgv.0.000868. Epub 2017 Jul 31.
6
Frequency and characterization of porcine hokovirus (PHoV) in domestic pigs in eastern China.中国东部地区家猪中猪呼肠孤病毒(PHoV)的流行情况及特征分析。
Arch Virol. 2012 Sep;157(9):1785-8. doi: 10.1007/s00705-012-1350-7. Epub 2012 Jun 1.
7
The first complete genome sequence of the African swine fever virus genotype X and serogroup 7 isolated in domestic pigs from the Democratic Republic of Congo.刚果民主共和国家猪中分离的非洲猪瘟病毒基因型 X 和血清群 7 的首个完整基因组序列。
Virol J. 2021 Jan 21;18(1):23. doi: 10.1186/s12985-021-01497-0.
8
First complete genomic sequence analysis of porcine circovirus type 4 (PCV4) in wild boars.首次对野猪中的4型猪圆环病毒(PCV4)进行全基因组序列分析。
Vet Microbiol. 2022 Oct;273:109547. doi: 10.1016/j.vetmic.2022.109547. Epub 2022 Aug 17.
9
First detection of African swine fever (ASF) virus genotype X and serogroup 7 in symptomatic pigs in the Democratic Republic of Congo.首次在刚果民主共和国出现症状性猪中的非洲猪瘟病毒基因型 X 和血清群 7。
Virol J. 2020 Sep 3;17(1):135. doi: 10.1186/s12985-020-01398-8.
10
Morphological and molecular characterizations of Sarcocystis miescheriana and Sarcocystis suihominis in domestic pigs (Sus scrofa) in China.中国家猪(Sus scrofa)中微小肉孢子虫和四川肉孢子虫的形态学和分子特征。
Parasitol Res. 2019 Dec;118(12):3491-3496. doi: 10.1007/s00436-019-06521-5. Epub 2019 Nov 14.

本文引用的文献

1
Genomic Characterization of Canis Familiaris Papillomavirus Type 25, a Novel Papillomavirus Associated with a Viral Plaque from the Pinna of a Dog.犬乳头瘤病毒25型的基因组特征,一种与犬耳廓病毒斑块相关的新型乳头瘤病毒。
Animals (Basel). 2023 Jun 2;13(11):1859. doi: 10.3390/ani13111859.
2
Discovery of novel papillomaviruses in the critically endangered Malayan and Chinese pangolins.在极度濒危的马来亚穿山甲和中华穿山甲中发现新型乳头瘤病毒。
Biol Lett. 2023 Jan;19(1):20220464. doi: 10.1098/rsbl.2022.0464. Epub 2023 Jan 4.
3
The genetic diversity of "papillomavirome" in bovine teat papilloma lesions.牛乳头瘤病变中“乳头瘤病毒组”的遗传多样性。
Anim Microbiome. 2021 Jul 28;3(1):51. doi: 10.1186/s42523-021-00114-3.
4
Papillomaviruses infecting cetaceans exhibit signs of genome adaptation following a recombination event.感染鲸类动物的乳头瘤病毒在一次重组事件后呈现出基因组适应的迹象。
Virus Evol. 2020 Jun 30;6(1):veaa038. doi: 10.1093/ve/veaa038. eCollection 2020 Jan.
5
Evidence for swine and human papillomavirus in pig slurry in Italy.意大利猪粪中猪和人乳头瘤病毒的证据。
J Appl Microbiol. 2019 Oct;127(4):1246-1254. doi: 10.1111/jam.14363. Epub 2019 Jul 12.
6
Sus scrofa papillomavirus 2 - genetic characterization of a novel suid papillomavirus from wild boar in Germany.猪乳头瘤病毒2型——德国野猪中一种新型猪乳头瘤病毒的基因特征分析
J Gen Virol. 2017 Aug;98(8):2113-2117. doi: 10.1099/jgv.0.000868. Epub 2017 Jul 31.
7
Isolation and characterization of a novel putative human polyomavirus.一种新型假定人类多瘤病毒的分离与鉴定
Virology. 2017 Jun;506:45-54. doi: 10.1016/j.virol.2017.03.007. Epub 2017 Mar 22.
8
MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets.MEGA7:适用于更大数据集的分子进化遗传学分析版本7.0
Mol Biol Evol. 2016 Jul;33(7):1870-4. doi: 10.1093/molbev/msw054. Epub 2016 Mar 22.
9
SDT: a virus classification tool based on pairwise sequence alignment and identity calculation.SDT:一种基于成对序列比对和同一性计算的病毒分类工具。
PLoS One. 2014 Sep 26;9(9):e108277. doi: 10.1371/journal.pone.0108277. eCollection 2014.
10
Complete genome sequence of a papillomavirus isolated from the European mole.从欧洲鼹鼠分离出的乳头瘤病毒的全基因组序列
Genome Announc. 2013 Aug 1;1(4):e00530-13. doi: 10.1128/genomeA.00530-13.