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使用纳米孔和Illumina平台相结合的方法组装了JM101的完整基因组。

The complete genome of JM101 assembled with a combination of Nanopore and Illumina platforms.

作者信息

Escalante Adelfo, Astudillo Fernando, Larios Violeta, Flores Noemí, Gosset Guillermo, Bolívar Francisco

机构信息

Departamento de Ingeniería Celular y Biocatálisis, Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Morelos, México.

Winter Genomics, Salavery, Ciudad de México, México.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2024 Feb 15;13(2):e0097323. doi: 10.1128/MRA.00973-23. Epub 2024 Jan 16.

DOI:10.1128/MRA.00973-23
PMID:38226818
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10868158/
Abstract

We report the complete genome and the plasmid (F' episome) sequences of JM101 assembled with a combination of Nanopore and Illumina data. The resulting genome is a single contig of 4,524,963 bp, and the plasmid consists of a single contig of 197,186 bp.

摘要

我们报告了结合纳米孔和Illumina数据组装的JM101的完整基因组和质粒（F'附加体）序列。所得基因组为一个4,524,963 bp的单重叠群，质粒由一个197,186 bp的单重叠群组成。