• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

法属圭亚那的蚂蚁:16S rRNA序列数据集。

Ants of French Guiana: 16S rRNA sequence dataset.

作者信息

Rongier Gaëtan, Sagne Audrey, Etienne Sandrine, Petitclerc Frederic, Jaouen Gaelle, Murienne Jerome, Orivel Jerome

机构信息

UMR Écologie des Forêts de Guyane (AgroParisTech, CIRAD, CNRS, INRAE, Université de Guyane, Université des Antilles), Kourou, French Guiana UMR Écologie des Forêts de Guyane (AgroParisTech, CIRAD, CNRS, INRAE, Université de Guyane, Université des Antilles) Kourou French Guiana.

Laboratoire Evolution et Diversité Biologique (EDB UMR5174) CNRS, Université Paul Sabatier Toulouse 3, IRD, Toulouse, France Laboratoire Evolution et Diversité Biologique (EDB UMR5174) CNRS, Université Paul Sabatier Toulouse 3, IRD Toulouse France.

出版信息

Biodivers Data J. 2023 Feb 7;11:e91577. doi: 10.3897/BDJ.11.e91577. eCollection 2023.

DOI:10.3897/BDJ.11.e91577
PMID:38327367
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10848834/
Abstract

This dataset represents a reference library of DNA sequences for ants from French Guiana. A total of 3931 new sequences from the 16S rRNA gene has been generated. The reference library covers 344 species distributed in 57 genera. Overall, 3920 sequences have been assigned at the species level and 11 at the genus level. All these sequences were submitted to DDBJ/EMBL/GenBank databases in the Bioproject: PRJNA779056: 16S French Guiana Ants (Hymenoptera: Formicidae), sequence identifier KFFS00000000.

摘要

该数据集代表了法属圭亚那蚂蚁的DNA序列参考文库。已生成了来自16S rRNA基因的总共3931条新序列。该参考文库涵盖了分布在57个属中的344个物种。总体而言,已在物种水平上鉴定出3920条序列,在属水平上鉴定出11条序列。所有这些序列都已提交至生物项目PRJNA779056:法属圭亚那蚂蚁16S(膜翅目:蚁科)的DDBJ/EMBL/GenBank数据库,序列标识符为KFFS00000000。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/27b4/10848834/3ca3b1995174/bdj-11-e91577-g001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/27b4/10848834/3ca3b1995174/bdj-11-e91577-g001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/27b4/10848834/3ca3b1995174/bdj-11-e91577-g001.jpg

相似文献

1
Ants of French Guiana: 16S rRNA sequence dataset.法属圭亚那的蚂蚁:16S rRNA序列数据集。
Biodivers Data J. 2023 Feb 7;11:e91577. doi: 10.3897/BDJ.11.e91577. eCollection 2023.
2
First checklist of the ants (Hymenoptera: Formicidae) of French Guiana.法属圭亚那蚂蚁(膜翅目:蚁科)的第一份清单。
Zootaxa. 2019 Sep 27;4674(5):zootaxa.4674.5.2. doi: 10.11646/zootaxa.4674.5.2.
3
Development of a reference data set for assigning and species based on next generation sequencing of the 16S-23S rRNA region.基于 16S-23S rRNA 区的下一代测序技术,建立用于种属鉴定的参考数据集。
Antimicrob Resist Infect Control. 2019 Nov 15;8:178. doi: 10.1186/s13756-019-0622-3. eCollection 2019.
4
Development and Validation of a Reference Data Set for Assigning Species Based on Next-Generation Sequencing of the 16S-23S rRNA Region.基于 16S-23S rRNA 区的下一代测序技术的物种分类参考数据集的建立与验证。
Front Cell Infect Microbiol. 2019 Aug 7;9:278. doi: 10.3389/fcimb.2019.00278. eCollection 2019.
5
Phylogenetic relationships and biodiversity in Hylids (Anura: Hylidae) from French Guiana.法属圭亚那雨蛙科(无尾目:雨蛙科)的系统发育关系与生物多样性
C R Biol. 2005 Oct-Nov;328(10-11):1009-24. doi: 10.1016/j.crvi.2005.07.005. Epub 2005 Sep 26.
6
Defining reference sequences for Nocardia species by similarity and clustering analyses of 16S rRNA gene sequence data.通过 16S rRNA 基因序列数据分析的相似性和聚类分析定义诺卡氏菌属的参考序列。
PLoS One. 2011;6(6):e19517. doi: 10.1371/journal.pone.0019517. Epub 2011 Jun 8.
7
A new aberrant Doryctinae genus (Hymenoptera: Braconidae) from French Guiana.来自法属圭亚那的一个新的异常褶翅小蜂亚科属(膜翅目:茧蜂科)。
Zootaxa. 2019 May 14;4604(2):zootaxa.4604.2.10. doi: 10.11646/zootaxa.4604.2.10.
8
Beetles that live with ants (Coleoptera, Carabidae, Pseudomorphini): A remarkable new genus and species from Guyane (French Guiana), Guyanemorpha spectabilis gen. n., sp. n.与蚂蚁共生的甲虫(鞘翅目,步甲科,伪步甲族):来自圭亚那(法属圭亚那)的一个非凡新属及新种,圭亚那蚁形甲,新属,新种
Zookeys. 2013 Dec 3(358):11-23. doi: 10.3897/zookeys.358.6298. eCollection 2013.
9
Identification and characterization of Wolbachia in Solenopsis saevissima fire ants (Hymenoptera: Formicidae) in southeastern Brazil.巴西东南部野蛮收获蚁(膜翅目:蚁科)体内沃尔巴克氏体的鉴定与特征分析
Curr Microbiol. 2009 Mar;58(3):189-94. doi: 10.1007/s00284-008-9301-y. Epub 2008 Nov 1.
10
Development of a custom 16S rRNA gene library for the identification and molecular subtyping of Salmonella enterica.定制 16S rRNA 基因文库用于鉴定和分子分型沙门氏菌。
J Microbiol Methods. 2012 Dec;91(3):448-58. doi: 10.1016/j.mimet.2012.09.018. Epub 2012 Sep 26.

引用本文的文献

1
MANGF: a reference library of DNA barcodes for Mantodea from French Guiana (Insecta, Dictyoptera).MANGF:法属圭亚那螳螂目(昆虫纲,蜚蠊目)DNA条形码参考文库
Biodivers Data J. 2025 Apr 9;13:e149486. doi: 10.3897/BDJ.13.e149486. eCollection 2025.

本文引用的文献

1
First checklist of the ants (Hymenoptera: Formicidae) of French Guiana.法属圭亚那蚂蚁(膜翅目:蚁科)的第一份清单。
Zootaxa. 2019 Sep 27;4674(5):zootaxa.4674.5.2. doi: 10.11646/zootaxa.4674.5.2.
2
New mitochondrial primers for metabarcoding of insects, designed and evaluated using in silico methods.新的昆虫线粒体引物,通过计算机模拟方法设计和评估。
Mol Ecol Resour. 2019 Jan;19(1):90-104. doi: 10.1111/1755-0998.12942. Epub 2018 Oct 16.
3
DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data.DADA2:从Illumina扩增子数据进行高分辨率样本推断。
Nat Methods. 2016 Jul;13(7):581-3. doi: 10.1038/nmeth.3869. Epub 2016 May 23.
4
Testing the potential of a ribosomal 16S marker for DNA metabarcoding of insects.测试核糖体16S标记物用于昆虫DNA宏条形码分析的潜力。
PeerJ. 2016 Apr 19;4:e1966. doi: 10.7717/peerj.1966. eCollection 2016.
5
obitools: a unix-inspired software package for DNA metabarcoding.obitools:一个受Unix启发的用于DNA宏条形码分析的软件包。
Mol Ecol Resour. 2016 Jan;16(1):176-82. doi: 10.1111/1755-0998.12428. Epub 2015 May 26.
6
DNA barcodes for ecology, evolution, and conservation.用于生态学、进化和保护的 DNA 条码。
Trends Ecol Evol. 2015 Jan;30(1):25-35. doi: 10.1016/j.tree.2014.10.008. Epub 2014 Nov 19.
7
DNA metabarcoding and the cytochrome c oxidase subunit I marker: not a perfect match.DNA 宏条形码与细胞色素 c 氧化酶亚基 I 标记:并非完美匹配。
Biol Lett. 2014 Sep;10(9). doi: 10.1098/rsbl.2014.0562.
8
Environmental metabarcodes for insects: in silico PCR reveals potential for taxonomic bias.昆虫的环境代谢条形码:计算机模拟PCR揭示了分类学偏差的可能性。
Mol Ecol Resour. 2014 Nov;14(6):1160-70. doi: 10.1111/1755-0998.12265. Epub 2014 May 14.
9
21 years of shelf life between discovery and description of new species.从新物种被发现到被描述之间有21年的搁置期。
Curr Biol. 2012 Nov 20;22(22):R943-4. doi: 10.1016/j.cub.2012.10.029.
10
Fast, scalable generation of high-quality protein multiple sequence alignments using Clustal Omega.使用 Clustal Omega 快速、可扩展地生成高质量蛋白质多重序列比对。
Mol Syst Biol. 2011 Oct 11;7:539. doi: 10.1038/msb.2011.75.