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从孟加拉国城郊地区采集的番茄样本中分离出的耐抗生素MTR_GR_V146菌株的基因组序列草图

Draft genome sequence of antibiotic-resistant MTR_GR_V146 strain isolated from a tomato () sample collected from a peri-urban area of Bangladesh.

作者信息

Islam Md Saiful, Pramanik Pritom Kumar, Rana Md Liton, Ullah Md Ashek, Neloy Fahim Haque, Ramasamy Srinivasan, Schreinemachers Pepijn, Oliva Ricardo, Rahman Md Tanvir

机构信息

Department of Microbiology and Hygiene, Faculty of Veterinary Science, Bangladesh Agricultural University, Mymensingh, Bangladesh.

Department of Animal Sciences, University of California-Davis, Davis, California, USA.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2024 Apr 11;13(4):e0009924. doi: 10.1128/mra.00099-24. Epub 2024 Feb 27.

Abstract

This study announces the genome sequence of the MTR_GR_V146 strain isolated from a tomato () sample in Bangladesh. This strain has a 4,624,521 bp genome length (coverage: 73.07×), 2 CRISPR arrays, 1 plasmid, 52 predicted antibiotic resistance genes, and 53 virulence factor genes.

摘要

本研究公布了从孟加拉国一份番茄样本中分离出的MTR_GR_V146菌株的基因组序列。该菌株基因组长度为4,624,521碱基对(覆盖度:73.07×),有2个CRISPR阵列、1个质粒、52个预测的抗生素抗性基因和53个毒力因子基因。

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Bioinformatics. 2014 Aug 1;30(15):2114-20. doi: 10.1093/bioinformatics/btu170. Epub 2014 Apr 1.

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