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离子对反相高效液相色谱法分析 KRAS 的鸟嘌呤核苷酸结合状态。

Analysis of the Guanine Nucleotide-Bound State of KRAS by Ion-Pair Reversed-Phase High-Performance Liquid Chromatography.

机构信息

Department of Biochemistry, Meiji Pharmaceutical University, Tokyo, Japan.

出版信息

Methods Mol Biol. 2024;2797:227-236. doi: 10.1007/978-1-0716-3822-4_16.

Abstract

Guanine nucleotides can be quantitatively analyzed by high-performance liquid chromatography (HPLC). Here we describe an ion-pair reversed-phase HPLC (IP-RP-HPLC)-based method, which enables analyzing GDP and GTP bound to small GTPases immunoprecipitated from cells. The activation status of FLAG-KRAS expressed in HEK293T cells can be investigated with the IP-RP-HPLC method. This method also can be adapted to determine the effects of compounds such as the KRAS/G12C inhibitor sotorasib on the activation status of FLAG-KRAS in the cells.

摘要

嘌呤核苷酸可以通过高效液相色谱法(HPLC)进行定量分析。在这里,我们描述了一种基于离子对反相高效液相色谱法(IP-RP-HPLC)的方法,该方法可以分析从小鼠细胞中免疫沉淀的小 GTPase 结合的 GDP 和 GTP。可以使用 IP-RP-HPLC 方法研究表达在 HEK293T 细胞中的 FLAG-KRAS 的激活状态。该方法还可以适用于确定 KRAS/G12C 抑制剂索托拉西布等化合物对细胞中 FLAG-KRAS 激活状态的影响。

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