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一种心脏蚶(林奈,1758年)的基因组序列。

The genome sequence of a heart cockle, (Linnaeus, 1758).

作者信息

Li Ruiqi, Li Jingchun, Lemer Sarah, Lopez Jose Victor, Oatley Graeme, Clayton-Lucey Isabelle Ailish, Sinclair Elizabeth, Aunin Eerik, Gettle Noah, Santos Camilla, Paulini Michael, Niu Haoyu, McKenna Victoria, O'Brien Rebecca

机构信息

Ecology & Evolutionary Biology, University of Colorado Boulder, Boulder, Colorado, USA.

Museum of Natural History, University of Colorado Boulder, Boulder, Colorado, USA.

出版信息

Wellcome Open Res. 2024 Mar 7;9:129. doi: 10.12688/wellcomeopenres.21134.1. eCollection 2024.

DOI:10.12688/wellcomeopenres.21134.1
PMID:38989474
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11234083/
Abstract

We present a genome assembly from an individual specimen of (a heart cockle; Mollusca; Bivalvia; Veneroida; Cardiidae). The genome sequence is 1,153.1 megabases in span. Most of the assembly is scaffolded into 19 chromosomal pseudomolecules. The mitochondrial genome has also been assembled and is 22.36 kilobases in length. Gene annotation of this assembly on Ensembl identified 17,262 protein coding genes.

摘要

我们展示了来自(一种心形蛤;软体动物门;双壳纲;帘蛤目;心蛤科)单个样本的基因组组装。基因组序列跨度为1153.1兆碱基。大部分组装序列被构建成19条染色体假分子。线粒体基因组也已组装完成,长度为22.36千碱基。在Ensembl上对该组装进行的基因注释识别出17262个蛋白质编码基因。

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