• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

Reply to: Inaccurate viral prediction leads to overestimated diversity of the archaeal virome in the human gut.

作者信息

Wang Yongming, Li Ran, Ma Yingfei

机构信息

CAS Key Laboratory of Quantitative Engineering Biology, Shenzhen Institute of Synthetic Biology, Shenzhen Institutes of Advanced Technology, Chinese Academy of Sciences, 518055, Shenzhen, China.

出版信息

Nat Commun. 2024 Jul 17;15(1):5977. doi: 10.1038/s41467-024-49903-9.

DOI:10.1038/s41467-024-49903-9
PMID:39019854
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11255301/
Abstract
摘要
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4d1c/11255301/f125157d2c7c/41467_2024_49903_Fig1_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4d1c/11255301/f125157d2c7c/41467_2024_49903_Fig1_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/4d1c/11255301/f125157d2c7c/41467_2024_49903_Fig1_HTML.jpg

相似文献

1
Reply to: Inaccurate viral prediction leads to overestimated diversity of the archaeal virome in the human gut.回复:病毒预测不准确导致人类肠道古菌病毒组多样性被高估。
Nat Commun. 2024 Jul 17;15(1):5977. doi: 10.1038/s41467-024-49903-9.
2
Inaccurate viral prediction leads to overestimated diversity of the archaeal virome in the human gut.不准确的病毒预测导致人类肠道中古菌病毒组多样性被高估。
Nat Commun. 2024 Jul 17;15(1):5976. doi: 10.1038/s41467-024-49902-w.
3
Metagenomic analysis reveals unexplored diversity of archaeal virome in the human gut.宏基因组分析揭示了人类肠道中未被探索的古菌病毒组多样性。
Nat Commun. 2022 Dec 29;13(1):7978. doi: 10.1038/s41467-022-35735-y.
4
Viruses of archaea: Structural, functional, environmental and evolutionary genomics.古菌病毒:结构、功能、环境与进化基因组学。
Virus Res. 2018 Jan 15;244:181-193. doi: 10.1016/j.virusres.2017.11.025. Epub 2017 Nov 22.
5
New archaeal viruses discovered by metagenomic analysis of viral communities in enrichment cultures.通过对富集培养物中病毒群落的宏基因组分析发现的新型古菌病毒。
Environ Microbiol. 2019 Jun;21(6):2002-2014. doi: 10.1111/1462-2920.14479. Epub 2019 Jan 8.
6
Novel Caudovirales associated with Marine Group I Thaumarchaeota assembled from metagenomes.从宏基因组中组装的与海洋 I 组古菌相关的新型尾病毒。
Environ Microbiol. 2019 Jun;21(6):1980-1988. doi: 10.1111/1462-2920.14462. Epub 2018 Dec 3.
7
The wonderful world of archaeal viruses.古菌病毒的奇妙世界。
Annu Rev Microbiol. 2013;67:565-85. doi: 10.1146/annurev-micro-092412-155633.
8
Viruses of the Archaea: a unifying view.古生菌病毒:一种统一的观点。
Nat Rev Microbiol. 2006 Nov;4(11):837-48. doi: 10.1038/nrmicro1527.
9
The intriguing world of archaeal viruses.古菌病毒的奇妙世界。
PLoS Pathog. 2020 Aug 13;16(8):e1008574. doi: 10.1371/journal.ppat.1008574. eCollection 2020 Aug.
10
Reply to "codon usage frequency of RNA virus genomes from high-temperature acidic-environment metagenomes".对“来自高温酸性环境宏基因组的RNA病毒基因组密码子使用频率”的回复
J Virol. 2013 Feb;87(3):1920-1. doi: 10.1128/JVI.02883-12.

本文引用的文献

1
Identification of mobile genetic elements with geNomad.使用 geNomad 识别移动遗传元件。
Nat Biotechnol. 2024 Aug;42(8):1303-1312. doi: 10.1038/s41587-023-01953-y. Epub 2023 Sep 21.
2
Large-scale phage cultivation for commensal human gut bacteria.大规模培养共生人类肠道细菌的噬菌体。
Cell Host Microbe. 2023 Apr 12;31(4):665-677.e7. doi: 10.1016/j.chom.2023.03.013.
3
Lytic archaeal viruses infect abundant primary producers in Earth's crust.溶原性古菌病毒感染了地壳中丰富的初级生产者。
Nat Commun. 2021 Jul 30;12(1):4642. doi: 10.1038/s41467-021-24803-4.
4
Identifying viruses from metagenomic data using deep learning.利用深度学习从宏基因组数据中识别病毒。
Quant Biol. 2020 Mar;8(1):64-77. doi: 10.1007/s40484-019-0187-4.
5
VirSorter2: a multi-classifier, expert-guided approach to detect diverse DNA and RNA viruses.VirSorter2:一种用于检测多种DNA和RNA病毒的多分类器、专家指导方法。
Microbiome. 2021 Feb 1;9(1):37. doi: 10.1186/s40168-020-00990-y.
6
CheckV assesses the quality and completeness of metagenome-assembled viral genomes.CheckV 评估宏基因组组装病毒基因组的质量和完整性。
Nat Biotechnol. 2021 May;39(5):578-585. doi: 10.1038/s41587-020-00774-7. Epub 2020 Dec 21.
7
A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.人类肠道微生物组 204938 个参考基因组的统一目录。
Nat Biotechnol. 2021 Jan;39(1):105-114. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3. Epub 2020 Jul 20.
8
VIBRANT: automated recovery, annotation and curation of microbial viruses, and evaluation of viral community function from genomic sequences.VIBRANT:从基因组序列中自动恢复、注释和培养微生物病毒,并评估病毒群落功能。
Microbiome. 2020 Jun 10;8(1):90. doi: 10.1186/s40168-020-00867-0.
9
Metaviral SPAdes: assembly of viruses from metagenomic data.Metaviral SPAdes:从宏基因组数据中组装病毒。
Bioinformatics. 2020 Aug 15;36(14):4126-4129. doi: 10.1093/bioinformatics/btaa490.
10
CRISPR analysis suggests that small circular single-stranded DNA smacoviruses infect Archaea instead of humans.CRISPR 分析表明,小型环状单链 DNA smacoviruses 感染古菌而不是人类。
Nat Commun. 2019 Jan 17;10(1):294. doi: 10.1038/s41467-018-08167-w.