• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

从土壤中分离出的9种E群分枝杆菌噬菌体。

Nine Cluster E mycobacteriophages isolated from soil.

作者信息

Gaballa Joseph M, Freise Amanda, Reddi Krisanavane, Moberg Parker Jordan

机构信息

Department of Medicine, University of Colorado Anschutz Medical Campus, Aurora, Colorado, USA.

Department of Microbiology, Immunology, and Molecular Genetics, University of California, Los Angeles, Los Angeles, California, USA.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2024 Oct 10;13(10):e0046324. doi: 10.1128/mra.00463-24. Epub 2024 Aug 30.

DOI:10.1128/mra.00463-24
PMID:39212351
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11465865/
Abstract

Mycobacteriophages FireRed, MISSy, MPhalcon, Murica, Sassay, Terminus, Willez, YassJohnny, and Youngblood were isolated from soil using as a host. Genome sequencing and annotation revealed that they belong to Actinobacteriophage Cluster E. Here, we describe the features of their genomes and discuss similarities within these Cluster E phages.

摘要

分枝杆菌噬菌体FireRed、MISSy、MPhalcon、Murica、Sassay、Terminus、Willez、YassJohnny和Youngblood以[具体宿主]为宿主从土壤中分离得到。基因组测序和注释显示它们属于放线菌噬菌体E簇。在此,我们描述了它们基因组的特征,并讨论了这些E簇噬菌体之间的相似性。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/e6ed/11465865/daa06f5d2ac3/mra.00463-24.f001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/e6ed/11465865/daa06f5d2ac3/mra.00463-24.f001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/e6ed/11465865/daa06f5d2ac3/mra.00463-24.f001.jpg

相似文献

1
Nine Cluster E mycobacteriophages isolated from soil.从土壤中分离出的9种E群分枝杆菌噬菌体。
Microbiol Resour Announc. 2024 Oct 10;13(10):e0046324. doi: 10.1128/mra.00463-24. Epub 2024 Aug 30.
2
Characterization of mycobacteria and mycobacteriophages isolated from compost at the São Paulo Zoo Park Foundation in Brazil and creation of the new mycobacteriophage Cluster U.对从巴西圣保罗动物园基金会的堆肥中分离出的分枝杆菌和分枝杆菌噬菌体进行表征,并创建新的分枝杆菌噬菌体U簇。
BMC Microbiol. 2016 Jun 17;16(1):111. doi: 10.1186/s12866-016-0734-3.
3
Complete Genome Sequences of Cluster G Mycobacteriophage Darionha, Cluster A Mycobacteriophage Salz, and Cluster J Mycobacteriophage ThreeRngTarjay.G簇分枝杆菌噬菌体达里翁哈、A簇分枝杆菌噬菌体萨尔茨和J簇分枝杆菌噬菌体ThreeRngTarjay的全基因组序列
Microbiol Resour Announc. 2020 May 14;9(20):e00160-20. doi: 10.1128/MRA.00160-20.
4
Evolutionary interpretations of mycobacteriophage biodiversity and host-range through the analysis of codon usage bias.通过分析密码子使用偏好来阐释分枝杆菌噬菌体多样性和宿主范围的进化。
Microb Genom. 2016 Oct 21;2(10):e000079. doi: 10.1099/mgen.0.000079. eCollection 2016 Oct.
5
Weirdo19ES is a novel singleton mycobacteriophage that selects for glycolipid deficient phage-resistant M. smegmatis mutants.Weirdo19ES 是一种新型单分子噬菌体,可选择缺乏糖脂的抗噬菌体分枝杆菌突变体。
PLoS One. 2020 May 1;15(5):e0231881. doi: 10.1371/journal.pone.0231881. eCollection 2020.
6
Mycobacteriophage CRB2 defines a new subcluster in mycobacteriophage classification.分枝杆菌噬菌体 CRB2 定义了分枝杆菌噬菌体分类中的一个新亚群。
PLoS One. 2019 Feb 27;14(2):e0212365. doi: 10.1371/journal.pone.0212365. eCollection 2019.
7
Phylogenetic relationships and codon usage bias amongst cluster K mycobacteriophages.聚类 K 分枝杆菌噬菌体之间的系统发育关系和密码子使用偏性。
G3 (Bethesda). 2021 Oct 19;11(11). doi: 10.1093/g3journal/jkab291.
8
Complete Genome Sequences of Cluster F1 Mycobacteriophages Akhila and MilanaBonita.F1 簇分枝杆菌噬菌体阿希拉和米拉娜·博尼塔的全基因组序列
Microbiol Resour Announc. 2023 Jan 24;12(1):e0119122. doi: 10.1128/mra.01191-22. Epub 2022 Dec 20.
9
Complete Genome Sequences of Mycobacteriophages Kwksand96 and Cane17.分枝杆菌噬菌体Kwksand96和Cane17的全基因组序列
Microbiol Resour Announc. 2018 Nov 1;7(17). doi: 10.1128/MRA.01182-18. eCollection 2018 Nov.
10
Expanding the diversity of mycobacteriophages: insights into genome architecture and evolution.拓展分枝杆菌噬菌体的多样性:对基因组结构和进化的深入了解。
PLoS One. 2011 Jan 27;6(1):e16329. doi: 10.1371/journal.pone.0016329.

本文引用的文献

1
Mycobacteriophages: From Petri dish to patient.分枝杆菌噬菌体:从培养皿到患者。
PLoS Pathog. 2022 Jul 7;18(7):e1010602. doi: 10.1371/journal.ppat.1010602. eCollection 2022 Jul.
2
tRNAscan-SE: Searching for tRNA Genes in Genomic Sequences.tRNAscan-SE:在基因组序列中搜索tRNA基因。
Methods Mol Biol. 2019;1962:1-14. doi: 10.1007/978-1-4939-9173-0_1.
3
Mycobacteriophages.分枝杆菌噬菌体。
Microbiol Spectr. 2018 Oct;6(5). doi: 10.1128/microbiolspec.GPP3-0026-2018.
4
Sequencing, Assembling, and Finishing Complete Bacteriophage Genomes.完整噬菌体基因组的测序、组装与完成
Methods Mol Biol. 2018;1681:109-125. doi: 10.1007/978-1-4939-7343-9_9.
5
Bacteriophage evolution differs by host, lifestyle and genome.噬菌体的进化因宿主、生活方式和基因组而异。
Nat Microbiol. 2017 Jul 10;2:17112. doi: 10.1038/nmicrobiol.2017.112.
6
PhagesDB: the actinobacteriophage database.噬菌体数据库:放线菌噬菌体数据库。
Bioinformatics. 2017 Mar 1;33(5):784-786. doi: 10.1093/bioinformatics/btw711.
7
CDD: NCBI's conserved domain database.CDD:美国国家生物技术信息中心的保守结构域数据库。
Nucleic Acids Res. 2015 Jan;43(Database issue):D222-6. doi: 10.1093/nar/gku1221. Epub 2014 Nov 20.
8
A broadly implementable research course in phage discovery and genomics for first-year undergraduate students.一门面向本科一年级学生的、可广泛实施的噬菌体发现与基因组学研究课程。
mBio. 2014 Feb 4;5(1):e01051-13. doi: 10.1128/mBio.01051-13.
9
Phamerator: a bioinformatic tool for comparative bacteriophage genomics.Phamerator:一种用于比较噬菌体基因组学的生物信息学工具。
BMC Bioinformatics. 2011 Oct 12;12:395. doi: 10.1186/1471-2105-12-395.
10
Comparative genomic analysis of 60 Mycobacteriophage genomes: genome clustering, gene acquisition, and gene size.60 株分枝杆菌噬菌体基因组的比较基因组分析:基因组聚类、基因获得和基因大小。
J Mol Biol. 2010 Mar 19;397(1):119-43. doi: 10.1016/j.jmb.2010.01.011. Epub 2010 Jan 11.