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藜(L.)的基因组序列

The genome sequence of fat-hen, L.

作者信息

Mian Sahr, Christenhusz Maarten J M

机构信息

Royal Botanic Gardens Kew, Richmond, England, UK.

Curtin University, Perth, Western Australia, Australia.

出版信息

Wellcome Open Res. 2024 Oct 15;9:508. doi: 10.12688/wellcomeopenres.23015.1. eCollection 2024.

DOI:10.12688/wellcomeopenres.23015.1
PMID:39372839
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11452771/
Abstract

We present a genome assembly from an individual (fat-hen; Streptophyta; Magnoliopsida; Caryophyllales; Chenopodiaceae). The genome sequence has a total length of 1,593.80 megabases. Most of the assembly (99.61%) is scaffolded into 27 chromosomal pseudomolecules suggesting the individual is an allohexaploid (2 = 6 = 54). The mitochondrial and plastid genome assemblies have lengths of 312.95 kilobases and 152.06 kilobases, respectively. Gene annotation of this assembly on Ensembl identified 50,077 protein-coding genes.

摘要

我们展示了来自一个个体(藜;链形植物门;双子叶植物纲;石竹目;藜科)的基因组组装结果。基因组序列全长1593.80兆碱基。大部分组装序列(99.61%)被搭建到27条染色体假分子中,表明该个体是异源六倍体(2n = 6x = 54)。线粒体和质体基因组组装长度分别为312.95千碱基和152.06千碱基。在Ensembl上对该组装序列进行的基因注释鉴定出50,077个蛋白质编码基因。

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