• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

无芒雀麦(禾本科)的基因组序列。

The genome sequence of barren brome, L. (Poaceae).

作者信息

Christenhusz Maarten J M

机构信息

Royal Botanic Gardens Kew, Richmond, England, UK.

Curtin University, Perth, Western Australia, Australia.

出版信息

Wellcome Open Res. 2024 Nov 20;9:534. doi: 10.12688/wellcomeopenres.22994.1. eCollection 2024.

DOI:10.12688/wellcomeopenres.22994.1
PMID:39386963
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11462126/
Abstract

We present a genome assembly from an individual (the barren brome; Streptophyta; Magnoliopsida; Poales; Poaceae). The genome sequence has a total length of 2,677.90 megabases. Most of the assembly is scaffolded into 7 chromosomal pseudomolecules. The mitochondrial and plastid genome assemblies have lengths of 523.28 kilobases and 136.96 kilobases, respectively. Gene annotation of this assembly on Ensembl identified 29,147 protein-coding genes.

摘要

我们展示了一个个体(燕麦草;链形植物门;木兰纲;禾本目;禾本科)的基因组组装。基因组序列全长2677.90兆碱基。大部分组装序列被构建成7条染色体假分子。线粒体和质体基因组组装长度分别为523.28千碱基和136.96千碱基。在Ensembl上对该组装序列进行的基因注释鉴定出29147个蛋白质编码基因。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fd7a/11579582/4b6deb75dedf/wellcomeopenres-9-25626-g0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fd7a/11579582/fb50824121f2/wellcomeopenres-9-25626-g0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fd7a/11579582/34403a13a556/wellcomeopenres-9-25626-g0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fd7a/11579582/2bc7ef5b375e/wellcomeopenres-9-25626-g0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fd7a/11579582/6981ff51997b/wellcomeopenres-9-25626-g0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fd7a/11579582/4b6deb75dedf/wellcomeopenres-9-25626-g0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fd7a/11579582/fb50824121f2/wellcomeopenres-9-25626-g0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fd7a/11579582/34403a13a556/wellcomeopenres-9-25626-g0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fd7a/11579582/2bc7ef5b375e/wellcomeopenres-9-25626-g0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fd7a/11579582/6981ff51997b/wellcomeopenres-9-25626-g0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fd7a/11579582/4b6deb75dedf/wellcomeopenres-9-25626-g0004.jpg

相似文献

1
The genome sequence of barren brome, L. (Poaceae).无芒雀麦(禾本科)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Nov 20;9:534. doi: 10.12688/wellcomeopenres.22994.1. eCollection 2024.
2
The genome sequence of fat-hen, L.藜(L.)的基因组序列
Wellcome Open Res. 2024 Oct 15;9:508. doi: 10.12688/wellcomeopenres.23015.1. eCollection 2024.
3
The genome sequence of the Black Medic, L.黑麦草的基因组序列,L. (这里的“L.”指代不明,可能需要更多背景信息来准确翻译其完整意思)
Wellcome Open Res. 2024 Nov 4;9:574. doi: 10.12688/wellcomeopenres.23134.2. eCollection 2024.
4
The genome sequence of the common hop, L.啤酒花(蛇麻草)的基因组序列,L. (此处L含义不明,可能是某个特定分类层级或其他指代,仅按原文翻译)
Wellcome Open Res. 2025 Apr 23;10:210. doi: 10.12688/wellcomeopenres.24025.1. eCollection 2025.
5
The genome sequence of wild privet, L.野生女贞(L.)的基因组序列
Wellcome Open Res. 2025 May 16;10:240. doi: 10.12688/wellcomeopenres.24023.1. eCollection 2025.
6
The genome sequence of common reed, (Cav.) Steud. (Poaceae).芦苇(Cav.)Steud.(禾本科)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Oct 11;9:577. doi: 10.12688/wellcomeopenres.23143.1. eCollection 2024.
7
The genome sequence of the Asparagus Beetle, (Linnaeus, 1758).芦笋甲虫(Linnaeus,1758 年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2025 Jan 15;10:18. doi: 10.12688/wellcomeopenres.23460.1. eCollection 2025.
8
The genome sequence of the Pacific oyster, (Thunberg, 1793).太平洋牡蛎(Thunberg,1793年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2025 Feb 3;9:284. doi: 10.12688/wellcomeopenres.22255.1. eCollection 2024.
9
The genome sequence of a soldier beetle, Fallén, 1807.一种步甲(法伦,1807年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Oct 15;9:303. doi: 10.12688/wellcomeopenres.22422.2. eCollection 2024.
10
The genome sequence of the Little Grey, (Panzer, 1804).小灰蝶(潘泽,1804年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Jul 11;8:302. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19646.1. eCollection 2023.

引用本文的文献

1
Optimizing genomic diversity assessments for conservation of Bromus auleticus (Trinius ex Nees) using individual and pooled sequencing.利用个体测序和混合测序优化用于保护奥氏雀麦(Trinius ex Nees的Trinius)的基因组多样性评估。
PLoS One. 2025 Jun 25;20(6):e0325548. doi: 10.1371/journal.pone.0325548. eCollection 2025.

本文引用的文献

1
A DNA barcoding framework for taxonomic verification in the Darwin Tree of Life Project.达尔文生命之树项目中用于分类学验证的DNA条形码框架。
Wellcome Open Res. 2024 Jun 24;9:339. doi: 10.12688/wellcomeopenres.21143.1. eCollection 2024.
2
JBrowse 2: a modular genome browser with views of synteny and structural variation.JBrowse 2:一个具有基因同线性和结构变异视图的模块化基因组浏览器。
Genome Biol. 2023 Apr 17;24(1):74. doi: 10.1186/s13059-023-02914-z.
3
YaHS: yet another Hi-C scaffolding tool.YaHS:另一个 Hi-C 支架工具。
Bioinformatics. 2023 Jan 1;39(1). doi: 10.1093/bioinformatics/btac808.
4
Gfastats: conversion, evaluation and manipulation of genome sequences using assembly graphs.Gfastats:使用组装图转换、评估和操作基因组序列。
Bioinformatics. 2022 Sep 2;38(17):4214-4216. doi: 10.1093/bioinformatics/btac460.
5
BUSCO Update: Novel and Streamlined Workflows along with Broader and Deeper Phylogenetic Coverage for Scoring of Eukaryotic, Prokaryotic, and Viral Genomes.BUSCO 更新:用于真核生物、原核生物和病毒基因组评分的新颖且简化的工作流程以及更广泛和更深的系统发育覆盖范围。
Mol Biol Evol. 2021 Sep 27;38(10):4647-4654. doi: 10.1093/molbev/msab199.
6
Towards complete and error-free genome assemblies of all vertebrate species.致力于完成所有脊椎动物物种的完整且无错误的基因组组装。
Nature. 2021 Apr;592(7856):737-746. doi: 10.1038/s41586-021-03451-0. Epub 2021 Apr 28.
7
Haplotype-resolved de novo assembly using phased assembly graphs with hifiasm.使用带有 hifiasm 的相定装配图进行单体型解析从头组装。
Nat Methods. 2021 Feb;18(2):170-175. doi: 10.1038/s41592-020-01056-5. Epub 2021 Feb 1.
8
Significantly improving the quality of genome assemblies through curation.通过编辑显著提高基因组组装的质量。
Gigascience. 2021 Jan 9;10(1). doi: 10.1093/gigascience/giaa153.
9
The Application of Flow Cytometry for Estimating Genome Size, Ploidy Level Endopolyploidy, and Reproductive Modes in Plants.流式细胞术在植物基因组大小估计、倍性水平、内多倍体和繁殖方式中的应用。
Methods Mol Biol. 2021;2222:325-361. doi: 10.1007/978-1-0716-0997-2_17.
10
Merqury: reference-free quality, completeness, and phasing assessment for genome assemblies.Merqury:基因组组装的无参考质量、完整性和相位评估。
Genome Biol. 2020 Sep 14;21(1):245. doi: 10.1186/s13059-020-02134-9.