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从高砷含量土壤中分离得到的菌株m318的全基因组序列。

Complete genome sequence of strain m318 isolated from rhizosphere of in high-arsenic-content soil.

作者信息

Han Ning, Yang ChongYang, Ho Ying-Ning, Moriuchi Ryota, Chen Che-Chun, Inoue Chihiro, Chien Mei-Fang

机构信息

Graduate School of Environmental Studies (GSES), Tohoku University, Sendai, Japan.

BioResource Research Center, RIKEN, Tsukuba, Japan.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2024 Dec 12;13(12):e0077424. doi: 10.1128/mra.00774-24. Epub 2024 Oct 31.

DOI:10.1128/mra.00774-24
PMID:39480098
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11636283/
Abstract

strain m318 is an arsenite-oxidizing rhizobacterium isolated from the rhizosphere of an arsenic hyperaccumulator plant, beneficial for arsenic phytoremediation. Here, we report the complete genome sequence of this strain, which consists of a circular chromosome assembled using long reads sequenced on Nanopore and polished with Illumina paired-end reads.

摘要

菌株M318是从一种砷超富集植物的根际分离出的一种氧化亚砷的根际细菌，有利于砷的植物修复。在此，我们报告该菌株的完整基因组序列，其由一个环状染色体组成，该染色体是使用在纳米孔上测序的长读段组装而成，并使用Illumina双端读段进行了优化。

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