• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

西弗吉尼亚州桃树和李树溃疡病原体的基因组序列草图

Draft genome sequences for and canker pathogens of and in West Virginia.

作者信息

Petronek Hannah M, Kasson Matt T, Metheny Amy M, Stauder Cameron M, Lovett Brian, Lynch Shannon C, Garnas Jeff R, Kasson Lindsay R, Stajich Jason E

机构信息

School of Natural Resources and the Environment, West Virginia University, Morgantown, West Virginia, USA.

U.S. Department of Agriculture Forest Service, Forest Health Protection, Bend, Oregon, USA.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2025 Jan 16;14(1):e0104224. doi: 10.1128/mra.01042-24. Epub 2024 Nov 27.

DOI:10.1128/mra.01042-24
PMID:39601523
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11737037/
Abstract

The fungal genus contains many phytopathogenic species currently impacting forests and fruit trees worldwide. Despite their importance, a majority of spp. lack sufficient genomic resources to resolve suspected cryptic species. Here, we report draft genomes and assemblies for NRRL 64651 and NRRL 64653.

摘要

该真菌属包含许多目前正在影响全球森林和果树的植物病原物种。尽管它们很重要，但大多数该属物种缺乏足够的基因组资源来解析疑似隐存种。在此，我们报告了NRRL 64651和NRRL 64653的基因组草图和组装结果。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/c9c5/11737037/5addab9d0be5/mra.01042-24.f001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/c9c5/11737037/5addab9d0be5/mra.01042-24.f001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/c9c5/11737037/5addab9d0be5/mra.01042-24.f001.jpg

相似文献

1
Draft genome sequences for and canker pathogens of and in West Virginia.西弗吉尼亚州桃树和李树溃疡病原体的基因组序列草图
Microbiol Resour Announc. 2025 Jan 16;14(1):e0104224. doi: 10.1128/mra.01042-24. Epub 2024 Nov 27.
2
Genome resources for the stem and bark canker pathogens Corinectria fuckeliana, Neonectria hederae and N. punicea.茎溃疡和树皮溃疡病原菌 Corinectria fuckeliana、Neonectria hederae 和 N. punicea 的基因组资源。
Plant Dis. 2019 Mar;103(3):389-391. doi: 10.1094/PDIS-05-18-0904-A. Epub 2019 Jan 9.
3
Characterization of mating type genes in heterothallic species, with emphasis on , and .交配型基因在异型接合物种中的特征分析，重点是 和 。
Mycologia. 2020 Sep-Oct;112(5):880-894. doi: 10.1080/00275514.2020.1797371. Epub 2020 Sep 24.
4
Comparative genome analyses suggest a hemibiotrophic lifestyle and virulence differences for the beech bark disease fungal pathogens Neonectria faginata and Neonectria coccinea.比较基因组分析表明，山毛榉树皮病害真菌病原菌 Neonectria faginata 和 Neonectria coccinea 具有半活体营养生活方式和毒力差异。
G3 (Bethesda). 2021 Apr 15;11(4). doi: 10.1093/g3journal/jkab071.
5
Three new species of Neonectria (Nectriaceae, Hypocreales) with notes on their phylogenetic positions.三种新的 Neocectria 物种（Nectriaceae，Hypocreales）及其系统发育地位的注释。
Mycologia. 2010 Jan-Feb;102(1):142-52. doi: 10.3852/08-224.
6
Delimitation of Neonectria and Cylindrocarpon (Nectriaceae, Hypocreales, Ascomycota) and related genera with Cylindrocarpon-like anamorphs.Neonectria 和 Cylindrocarpon（Nectriaceae，Hypocreales，Ascomycota）及其具有 Cylindrocarpon 类似无性型的相关属的划分。
Stud Mycol. 2011;68:57-78. doi: 10.3114/sim.2011.68.03.
7
Draft Genome Sequence of a European Isolate of the Apple Canker Pathogen Neonectria ditissima.苹果溃疡病菌新壳梭孢欧洲分离株的基因组序列草图
Genome Announc. 2015 Nov 19;3(6):e01243-15. doi: 10.1128/genomeA.01243-15.
8
Comparative Genomics of Fungi in Nectriaceae Reveals Their Environmental Adaptation and Conservation Strategies.肉座菌科真菌的比较基因组学揭示了它们的环境适应性和保护策略。
J Fungi (Basel). 2024 Sep 5;10(9):632. doi: 10.3390/jof10090632.
9
Draft genome sequence of sp. DH2 isolated from Prain in Tibet.从西藏普兰分离出的[物种名称]DH2的基因组序列草图 。 （原文中“sp.”处应有具体物种名称未给出完整）
3 Biotech. 2020 Aug;10(8):346. doi: 10.1007/s13205-020-02345-8. Epub 2020 Jul 21.
10
Genome Resources for the Causal Agent of Nectria Canker of Caneberry.用于蔓越橘疫病病原菌的基因组资源。
Phytopathology. 2020 Apr;110(4):723-725. doi: 10.1094/PHYTO-12-19-0466-A. Epub 2020 Feb 10.

引用本文的文献

1
Draft genome of ARSEF 14590 (Clavicipitaceae), an entomopathogenic fungus with a wealth of biosynthetic and biocontrol potential.ARSEF 14590（麦角菌科）的基因组草图，一种具有丰富生物合成和生物防治潜力的昆虫病原真菌。
Microbiol Resour Announc. 2025 Aug 14;14(8):e0127324. doi: 10.1128/mra.01273-24. Epub 2025 Jul 23.

本文引用的文献

1
Ultrafast one-pass FASTQ data preprocessing, quality control, and deduplication using fastp.使用fastp进行超快速单通道FASTQ数据预处理、质量控制和重复数据删除。
Imeta. 2023 May 8;2(2):e107. doi: 10.1002/imt2.107. eCollection 2023 May.
2
A high-quality draft genome sequence of , causative agent of beech bark disease of .山毛榉树皮病病原体的高质量基因组草图序列。 （你提供的原文不完整，推测应该是这样的表述才完整通顺，比如“A high-quality draft genome sequence of [organism name], causative agent of beech bark disease of [host name].” 这里是根据常见语境补充了部分信息以便能更合理理解句子）
Microbiol Resour Announc. 2024 Feb 15;13(2):e0104823. doi: 10.1128/mra.01048-23. Epub 2024 Jan 24.
3
BUSCO: Assessing Genomic Data Quality and Beyond.
BUSCO：评估基因组数据质量及其他。
Curr Protoc. 2021 Dec;1(12):e323. doi: 10.1002/cpz1.323.
4
tRNAscan-SE 2.0: improved detection and functional classification of transfer RNA genes.tRNAscan-SE 2.0：改进的 tRNA 基因检测和功能分类。
Nucleic Acids Res. 2021 Sep 20;49(16):9077-9096. doi: 10.1093/nar/gkab688.
5
Comparative genome analyses suggest a hemibiotrophic lifestyle and virulence differences for the beech bark disease fungal pathogens Neonectria faginata and Neonectria coccinea.比较基因组分析表明，山毛榉树皮病害真菌病原菌 Neonectria faginata 和 Neonectria coccinea 具有半活体营养生活方式和毒力差异。
G3 (Bethesda). 2021 Apr 15;11(4). doi: 10.1093/g3journal/jkab071.
6
Characterization of mating type genes in heterothallic species, with emphasis on , and .交配型基因在异型接合物种中的特征分析，重点是 和 。
Mycologia. 2020 Sep-Oct;112(5):880-894. doi: 10.1080/00275514.2020.1797371. Epub 2020 Sep 24.
7
Draft genome sequence of sp. DH2 isolated from Prain in Tibet.从西藏普兰分离出的[物种名称]DH2的基因组序列草图 。 （原文中“sp.”处应有具体物种名称未给出完整）
3 Biotech. 2020 Aug;10(8):346. doi: 10.1007/s13205-020-02345-8. Epub 2020 Jul 21.
8
Occurrence and pathogenicity of Corinectria spp. - an emerging canker disease of Abies sibirica in Central Siberia.西伯利亚云杉溃疡病病原菌 Corinectria 属的发生与致病性 - 西伯利亚云杉在中西伯利亚的一种新兴溃疡病。
Sci Rep. 2020 Mar 27;10(1):5597. doi: 10.1038/s41598-020-62566-y.
9
antiSMASH 5.0: updates to the secondary metabolite genome mining pipeline.antiSMASH 5.0：二次代谢产物基因组挖掘管道的更新。
Nucleic Acids Res. 2019 Jul 2;47(W1):W81-W87. doi: 10.1093/nar/gkz310.
10
BUSCO: Assessing Genome Assembly and Annotation Completeness.BUSCO：评估基因组组装和注释的完整性
Methods Mol Biol. 2019;1962:227-245. doi: 10.1007/978-1-4939-9173-0_14.