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血红蛋白:在脱氧和氧合结构中,位于α1β1和α2β2二聚体之间的埋藏表面。

Haemoglobin: the surface buried between the alpha 1 beta 1 and alpha 2 beta 2 dimers in the deoxy and oxy structures.

作者信息

Lesk A M, Janin J, Wodak S, Chothia C

出版信息

J Mol Biol. 1985 May 25;183(2):267-70. doi: 10.1016/0022-2836(85)90219-0.

Abstract

Using the newly available refined co-ordinates of deoxy and oxyhaemoglobin, we have re-examined and compared the interfaces between the dimers alpha 1 beta 1 and alpha 2 beta 2. The most extensive monomer-monomer contacts are between alpha 1 and beta 2, and, symmetrically, alpha 2 and beta 1. In oxyhaemoglobin these interfaces bury 700 A2 less protein surface than in deoxyhaemoglobin. The alpha 1 alpha 2 interface involves similar salt bridges in both forms, but in oxyhaemoglobin buries 240 A2 more surface than in deoxyhaemoglobin. There is a loosely packed beta 1 beta 2 interface burying 320 A2 of surface in oxyhaemoglobin; there is no beta 1 beta 2 interface in deoxyhaemoglobin. The greater stability of the deoxy form, in the absence of ligands, can be attributed to a combination of hydrophobic, van der Waals' and electrostatic interactions.

摘要

利用新获得的脱氧血红蛋白和氧合血红蛋白的精确坐标,我们重新审视并比较了α1β1和α2β2二聚体之间的界面。最广泛的单体 - 单体接触发生在α1和β2之间,对称地,也发生在α2和β1之间。在氧合血红蛋白中,这些界面埋藏的蛋白质表面积比脱氧血红蛋白少700 Ų。α1α2界面在两种形式中涉及类似的盐桥,但在氧合血红蛋白中比脱氧血红蛋白多埋藏240 Ų的表面积。在氧合血红蛋白中有一个松散堆积的β1β2界面,埋藏320 Ų的表面积;在脱氧血红蛋白中不存在β1β2界面。在没有配体的情况下,脱氧形式具有更高的稳定性,这可归因于疏水、范德华和静电相互作用的综合作用。

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