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使用牛津纳米孔测序技术从哥伦比亚西南部居民中分离出的完整基因组序列。

Complete genome sequence of isolated from residents in southwestern Colombia using Oxford Nanopore sequencing technology.

作者信息

Mejia Lizeth, Benavides-Melo Julie, Argoty Ernesto, Montenegro Liliana, Rivera-Franco Nelson, López-Alvarez Diana, Pazos Álvaro

机构信息

Laboratorio de Técnicas y Análisis Ómicos-TAOLab/CiBioFi, Facultad de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad del Valle, Cali, Valle del Cauca, Colombia.

Departamento de Biología, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Nariño, Pasto, Nariño, Colombia.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2025 Jun 12;14(6):e0008225. doi: 10.1128/mra.00082-25. Epub 2025 May 20.

DOI:10.1128/mra.00082-25
PMID:40391900
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12160440/
Abstract

Genome sequences of strains isolated from patients in Nariño, Colombia, with gastric lesions were assembled using Nanopore sequencing. Plasmids were detected in some strains and were predicted to be mobilizable, with relaxases of the MOBP type. 's virulence genes may explain the link with gastric cancer.

摘要

使用纳米孔测序技术对从哥伦比亚纳里尼奥州患有胃部病变的患者身上分离出的菌株的基因组序列进行了组装。在一些菌株中检测到了质粒，预测这些质粒是可移动的，具有MOBP型松弛酶。该菌株的毒力基因可能解释其与胃癌的关联。

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