• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

相似文献

1
Draft genome sequence of a marine coccolithophore NIES-4509.海洋颗石藻NIES-4509的基因组序列草图
Microbiol Resour Announc. 2025 Jul 10;14(7):e0135724. doi: 10.1128/mra.01357-24. Epub 2025 Jun 9.
2
Genome Sequence of a Marine Threespine Stickleback () from Rabbit Slough in the Cook Inlet.来自库克湾兔子浅滩的一条海洋三刺鱼()的基因组序列。
bioRxiv. 2025 Feb 8:2025.02.06.636934. doi: 10.1101/2025.02.06.636934.
3
Genome Sequence of a Marine Threespine Stickleback (Gasterosteus aculeatus) from Rabbit Slough in the Cook Inlet.来自库克湾兔子泥沼的一条海洋三刺鱼(Gasterosteus aculeatus)的基因组序列。
G3 (Bethesda). 2025 May 23. doi: 10.1093/g3journal/jkaf114.
4
Decontamination of DNA sequences from a Streptomyces genome for optimal genome mining.对链霉菌基因组中的DNA序列进行净化以实现最佳基因组挖掘。
Braz J Microbiol. 2025 Mar;56(1):79-89. doi: 10.1007/s42770-024-01598-2. Epub 2025 Jan 15.
5
Exploring proteins within the coccolith matrix.探索颗石藻基质中的蛋白质。
Sci Rep. 2024 Dec 30;14(1):31821. doi: 10.1038/s41598-024-83052-9.
6
Can a Liquid Biopsy Detect Circulating Tumor DNA With Low-passage Whole-genome Sequencing in Patients With a Sarcoma? A Pilot Evaluation.液体活检能否通过低深度全基因组测序检测肉瘤患者的循环肿瘤DNA?一项初步评估。
Clin Orthop Relat Res. 2025 Jan 1;483(1):39-48. doi: 10.1097/CORR.0000000000003161. Epub 2024 Jun 21.
7
The first complete assembly for a lungless urodelan with a "miniaturized" genome, the Northern Dusky Salamander (Plethodontidae: Desmognathus fuscus).首个具有“小型化”基因组的无肺有尾目动物的完整基因组组装,即北方暗口螈(无肺螈科:暗色钝口螈)。
G3 (Bethesda). 2025 Jul 7. doi: 10.1093/g3journal/jkaf157.
8
Draft genome sequence and comparative genomic analysis of Halomonas salifodinae strain A2 isolated from the Zapotitlán Salinas Valley, Puebla, Mexico.从墨西哥普埃布拉州萨波蒂特兰萨利纳斯山谷分离出的盐沼盐单胞菌A2菌株的基因组序列草图及比较基因组分析
Extremophiles. 2025 Jul 3;29(2):28. doi: 10.1007/s00792-025-01397-z.
9
Chromosome-scale reference genome of , the species with the smallest reported genome size in Boraginaceae.紫草科中报道的基因组大小最小的物种——[物种名称]的染色体水平参考基因组。 (注:原文中“Chromosome-scale reference genome of ”后面缺少具体物种名称)
Appl Plant Sci. 2025 May 21;13(3):e70008. doi: 10.1002/aps3.70008. eCollection 2025 May-Jun.
10
A chromosome-level genome assembly for the dugong (Dugong dugon).儒艮(Dugong dugon)的染色体水平基因组组装。
J Hered. 2024 Mar 13;115(2):212-220. doi: 10.1093/jhered/esae003.

本文引用的文献

1
Whokaryote: distinguishing eukaryotic and prokaryotic contigs in metagenomes based on gene structure.WhoKaryote:基于基因结构区分宏基因组中的真核生物和原核生物序列。
Microb Genom. 2022 May;8(5). doi: 10.1099/mgen.0.000823.
2
Genome Sequence of a Coccolithphore Contributed to Global Biogeochemical Cycles.贡献于全球生物地球化学循环的颗石藻基因组序列。
Genes (Basel). 2021 Dec 23;13(1):40. doi: 10.3390/genes13010040.
3
RepeatModeler2 for automated genomic discovery of transposable element families.RepeatModeler2 用于自动发现转座元件家族的基因组。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2020 Apr 28;117(17):9451-9457. doi: 10.1073/pnas.1921046117. Epub 2020 Apr 16.
4
Assembly of long, error-prone reads using repeat graphs.使用重复图组装长的、易错的读取。
Nat Biotechnol. 2019 May;37(5):540-546. doi: 10.1038/s41587-019-0072-8. Epub 2019 Apr 1.
5
Purge Haplotigs: allelic contig reassignment for third-gen diploid genome assemblies.清除单倍型:三代二倍体基因组组装的等位基因 contig 重新分配。
BMC Bioinformatics. 2018 Nov 29;19(1):460. doi: 10.1186/s12859-018-2485-7.
6
Stable Nuclear Transformation System for the Coccolithophorid Alga Pleurochrysis carterae.球石藻普氏菱形藻的稳定核转化系统
Sci Rep. 2016 Mar 7;6:22252. doi: 10.1038/srep22252.
7
Pan genome of the phytoplankton Emiliania underpins its global distribution.浮游植物中微微型海链藻的泛基因组决定了其全球分布。
Nature. 2013 Jul 11;499(7457):209-13. doi: 10.1038/nature12221. Epub 2013 Jun 12.

海洋颗石藻NIES-4509的基因组序列草图

Draft genome sequence of a marine coccolithophore NIES-4509.

作者信息

Yoneda Kohei, Suzuki Shigekatsu, Kawachi Masanobu, Endo Hirotoshi, Kato Akihiro, Takeda Tomoya, Maeda Yoshiaki, Suzuki Iwane

机构信息

Institute of Life and Environmental Sciences, University of Tsukuba, Tsukuba, Japan.

Biodiversity Division, Microbial Culture Collection of National Institute for Environmental Studies, Tsukuba, Japan.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2025 Jul 10;14(7):e0135724. doi: 10.1128/mra.01357-24. Epub 2025 Jun 9.

DOI:10.1128/mra.01357-24
PMID:40488498
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12243532/
Abstract

The present study reports the draft genome assembly of a transformable marine coccolithophore NIES-4509. The draft genome consisted of approximately 451.7 Mbp, with 57.9 % G + C content and 9,265 contigs. This assembly is expected to be utilized for understanding the cellular physiology of marine haptophytes.

摘要

本研究报告了可转化海洋颗石藻NIES-4509的基因组草图组装情况。该基因组草图约由451.7兆碱基对组成,G + C含量为57.9%,包含9265个重叠群。预计该组装结果将用于了解海洋定鞭藻的细胞生理学。