• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

紫铜弄蝶(丹尼斯和席费尔米勒,1775年)的基因组序列。

The genome sequence of the Violet Copper, (Denis & Schiffermüller, 1775).

作者信息

Pladevall Clara, Caritg Roger, Cámara Francisco, Carbonell Silvia, Gómez-Garrido Jèssica, Cruz Fernando, Gut Marta, Arroyo Vanesa, Komac Benjamin, Vila Roger, Guigó Roderic, Alioto Tyler S, Niell Manel

机构信息

Andorra Research and Innovation (AR+I), Sant Julià de Lòria, Andorra.

Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG), Barcelona, Spain.

出版信息

F1000Res. 2025 Jan 10;14:60. doi: 10.12688/f1000research.156485.1. eCollection 2025.

DOI:10.12688/f1000research.156485.1
PMID:40534729
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12174908/
Abstract

We present a genome assembly from an individual female (the Violet Copper; Arthropoda; Insecta; Lepidoptera; Lycaenidae). The genome sequence is 547.31 megabases in span. The entirety of the genome sequence was assembled into 25 contiguous chromosomal pseudomolecules with no gaps, including the Z and W sex chromosomes. The mitochondrial genome has also been assembled and is 15.5 kilobases in length. Gene annotation of this assembly identified 20,122 protein coding genes.

摘要

我们展示了一个来自个体雌性(紫铜灰蝶;节肢动物门;昆虫纲;鳞翅目;灰蝶科)的基因组组装结果。基因组序列跨度为547.31兆碱基。整个基因组序列被组装成25个无间隙的连续染色体假分子,包括Z和W性染色体。线粒体基因组也已组装完成,长度为15.5千碱基。该组装结果的基因注释鉴定出20,122个蛋白质编码基因。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fcc9/12174908/73f1f5142aa0/f1000research-14-171804-g0005.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fcc9/12174908/dc94af31b39b/f1000research-14-171804-g0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fcc9/12174908/54912ea12019/f1000research-14-171804-g0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fcc9/12174908/c4a4dd6f7f39/f1000research-14-171804-g0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fcc9/12174908/fff57487c9a0/f1000research-14-171804-g0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fcc9/12174908/404d7c0f2c2c/f1000research-14-171804-g0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fcc9/12174908/73f1f5142aa0/f1000research-14-171804-g0005.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fcc9/12174908/dc94af31b39b/f1000research-14-171804-g0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fcc9/12174908/54912ea12019/f1000research-14-171804-g0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fcc9/12174908/c4a4dd6f7f39/f1000research-14-171804-g0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fcc9/12174908/fff57487c9a0/f1000research-14-171804-g0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fcc9/12174908/404d7c0f2c2c/f1000research-14-171804-g0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/fcc9/12174908/73f1f5142aa0/f1000research-14-171804-g0005.jpg

相似文献

1
The genome sequence of the Violet Copper, (Denis & Schiffermüller, 1775).紫铜弄蝶(丹尼斯和席费尔米勒,1775年)的基因组序列。
F1000Res. 2025 Jan 10;14:60. doi: 10.12688/f1000research.156485.1. eCollection 2025.
2
The genome sequence of the Riband Wave, (Linnaeus, 1758).带纹波鱼的基因组序列,(林奈,1758年)。
Wellcome Open Res. 2023 Jan 31;8:45. doi: 10.12688/wellcomeopenres.18899.1. eCollection 2023.
3
The genome sequence of the Asparagus Beetle, (Linnaeus, 1758).芦笋甲虫(Linnaeus,1758 年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2025 Jan 15;10:18. doi: 10.12688/wellcomeopenres.23460.1. eCollection 2025.
4
The genome sequence of the Small Ranunculus, (Denis & Schiffermüller, 1775).小毛茛(Denis & Schiffermüller,1775年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Feb 23;8:101. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19067.1. eCollection 2023.
5
The genome sequence of the Rose-flounced Tabby, (Denis & Schiffermüller, 1775).玫瑰镶边虎斑猫的基因组序列,(丹尼斯和席费尔米勒,1775年)。
Wellcome Open Res. 2023 Nov 13;8:516. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19923.1. eCollection 2023.
6
The genome sequence of the Brown Argus, (Denis & Schiffermüller, 1775).赭灰蝶(Denis & Schiffermüller,1775年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Aug 10;8:336. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19784.1. eCollection 2023.
7
The genome sequence of the Cloaked Minor, (Denis & Schiffermüller, 1775).隐匿微蛾(Denis & Schiffermüller,1775年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Jun 16;8:251. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19537.1. eCollection 2023.
8
The genome sequence of the Streak, (Denis & Schiffermüller, 1775).条纹蛱蝶(丹尼斯和席费尔米勒,1775年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Sep 3;8:205. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19298.2. eCollection 2023.
9
The genome sequence of the Small Phoenix, (Denis & Schiffermüller, 1775).小凤蝶(丹尼斯和席费尔米勒,1775年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 May 10;8:209. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19207.1. eCollection 2023.
10
The genome sequence of the Olive Crescent, (Denis & Schiffermüller, 1775).橄榄新月纹夜蛾(丹尼斯和席费尔米勒,1775年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Apr 8;9:178. doi: 10.12688/wellcomeopenres.20836.1. eCollection 2024.

本文引用的文献

1
The Catalan initiative for the Earth BioGenome Project: contributing local data to global biodiversity genomics.加泰罗尼亚地球生物基因组计划倡议:为全球生物多样性基因组学贡献本地数据。
NAR Genom Bioinform. 2024 Jul 17;6(3):lqae075. doi: 10.1093/nargab/lqae075. eCollection 2024 Sep.
2
Pairtools: From sequencing data to chromosome contacts.Pairtools:从测序数据到染色体接触。
PLoS Comput Biol. 2024 May 29;20(5):e1012164. doi: 10.1371/journal.pcbi.1012164. eCollection 2024 May.
3
NextDenovo: an efficient error correction and accurate assembly tool for noisy long reads.
NextDenovo:一种用于处理有噪声长读段的高效纠错和精确组装工具。
Genome Biol. 2024 Apr 26;25(1):107. doi: 10.1186/s13059-024-03252-4.
4
ESPRESSO: Robust discovery and quantification of transcript isoforms from error-prone long-read RNA-seq data.ESPRESSO:从易错的长读 RNA-seq 数据中稳健地发现和定量转录本异构体。
Sci Adv. 2023 Jan 20;9(3):eabq5072. doi: 10.1126/sciadv.abq5072.
5
Protein-to-genome alignment with miniprot.用 Miniprot 进行蛋白质到基因组的比对。
Bioinformatics. 2023 Jan 1;39(1). doi: 10.1093/bioinformatics/btad014.
6
Taxonomic discoveries enabled by genomic analysis of butterflies.通过蝴蝶基因组分析实现的分类学发现。
Taxon Rep Int Lepid Surv. 2022 Oct;10(7):1-59. doi: 10.5281/zenodo.7160429. Epub 2022 Oct 7.
7
Large- and small-scale geographic structures affecting genetic patterns across populations of an Alpine butterfly.影响一种高山蝴蝶种群遗传模式的大规模和小规模地理结构。
Ecol Evol. 2021 Sep 28;11(21):14697-14714. doi: 10.1002/ece3.8157. eCollection 2021 Nov.
8
PANNZER-A practical tool for protein function prediction.PANNZER——一种用于蛋白质功能预测的实用工具。
Protein Sci. 2022 Jan;31(1):118-128. doi: 10.1002/pro.4193. Epub 2021 Oct 14.
9
BUSCO Update: Novel and Streamlined Workflows along with Broader and Deeper Phylogenetic Coverage for Scoring of Eukaryotic, Prokaryotic, and Viral Genomes.BUSCO 更新:用于真核生物、原核生物和病毒基因组评分的新颖且简化的工作流程以及更广泛和更深的系统发育覆盖范围。
Mol Biol Evol. 2021 Sep 27;38(10):4647-4654. doi: 10.1093/molbev/msab199.
10
Merqury: reference-free quality, completeness, and phasing assessment for genome assemblies.Merqury:基因组组装的无参考质量、完整性和相位评估。
Genome Biol. 2020 Sep 14;21(1):245. doi: 10.1186/s13059-020-02134-9.