• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

从土壤中分离出的利用L-葡萄糖的细菌sp.菌株1A1的全基因组序列。

Complete genome sequence of sp. strain 1A1, an ʟ-glucose-utilizing bacterium isolated from soil.

作者信息

Doi Yuki, Hama Akito, Nakamura Akira

机构信息

Institute of Life and Environmental Sciences, University of Tsukuba, Tsukuba, Japan.

Microbiology Research Center for Sustainability (MiCS), University of Tsukuba, Tsukuba, Japan.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2025 Aug 14;14(8):e0021725. doi: 10.1128/mra.00217-25. Epub 2025 Jul 7.

DOI:10.1128/mra.00217-25
PMID:40621944
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12352086/
Abstract

The complete genome sequence of an ʟ-glucose-utilizing bacterium, sp. strain 1A1 isolated from soil, was determined. Strain 1A1 contained a 3.45 Mb circular chromosome with 3,261 protein-coding genes, 9 rRNA, and 52 tRNA genes and 1.77 Mb and 44.5 kb circular plasmids with 1,623 and 51 protein-coding genes, respectively.

摘要

从土壤中分离出的一株利用L-葡萄糖的细菌——sp.菌株1A1的全基因组序列已被测定。菌株1A1含有一条3.45 Mb的环状染色体，带有3261个蛋白质编码基因、9个rRNA和52个tRNA基因，以及分别带有1623个和51个蛋白质编码基因的1.77 Mb和44.5 kb的环状质粒。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6e2e/12352086/6c18284e4449/mra.00217-25.f001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6e2e/12352086/6c18284e4449/mra.00217-25.f001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6e2e/12352086/6c18284e4449/mra.00217-25.f001.jpg

相似文献

1
Complete genome sequence of sp. strain 1A1, an ʟ-glucose-utilizing bacterium isolated from soil.从土壤中分离出的利用L-葡萄糖的细菌sp.菌株1A1的全基因组序列。
Microbiol Resour Announc. 2025 Aug 14;14(8):e0021725. doi: 10.1128/mra.00217-25. Epub 2025 Jul 7.
2
Complete genome sequence of sp. strain LG18, an L-glucose-utilizing bacterium isolated from soil.从土壤中分离出的利用L-葡萄糖的细菌——sp. 菌株LG18的全基因组序列。
Microbiol Resour Announc. 2024 Mar 12;13(3):e0088823. doi: 10.1128/mra.00888-23. Epub 2024 Feb 14.
3
Complete genome sequence of sp. strain C-4077, isolated from the cell surface of a symbiotic dinoflagellate of the bivalve sp.从双壳贝类共生甲藻的细胞表面分离得到的sp.菌株C-4077的全基因组序列
Microbiol Resour Announc. 2025 Sep 11;14(9):e0035825. doi: 10.1128/mra.00358-25. Epub 2025 Aug 11.
4
sp. nov., a facultatively anaerobic bacterium with potential for degrading polypropylene, isolated from Arctic seawater.一株兼性厌氧菌，可降解聚丙烯，从北极海水中分离得到。
Int J Syst Evol Microbiol. 2023 Aug;73(8). doi: 10.1099/ijsem.0.005999.
5
sp. nov., isolated from the rhizosphere of rice and genome mining for the prediction of biosynthetic gene clusters.新种，从水稻根际分离得到，并进行基因组挖掘以预测生物合成基因簇。
Int J Syst Evol Microbiol. 2025 Feb;75(2). doi: 10.1099/ijsem.0.006687.
6
Chryseobacterium tongliaoense sp. nov., an aniline blue-degrading strain isolated from agricultural soil.通辽金黄杆菌新种，一株从农业土壤中分离出的可降解苯胺蓝的菌株。
Antonie Van Leeuwenhoek. 2025 Jul 8;118(8):106. doi: 10.1007/s10482-025-02121-9.
7
Complete genome sequences of two Pantoea stewartii strains ATCC 8199 from maize and PSCN1 from sugarcane.两株 Pantoea stewartii 菌株 ATCC 8199（来自玉米）和 PSCN1（来自甘蔗）的全基因组序列。
BMC Genom Data. 2024 Oct 8;25(1):86. doi: 10.1186/s12863-024-01268-0.
8
sp. nov., isolated from garden soil.sp. nov.，分离自花园土壤。
Int J Syst Evol Microbiol. 2024 Jun;74(6). doi: 10.1099/ijsem.0.006407.
9
Genomic and taxonomic characterization of the Comamonas sp. nov., a bacterium isolated from Brazilian Cerrado soil.从巴西塞拉多土壤中分离出的新鞘氨醇单胞菌（Comamonas sp. nov.）的基因组和分类学特征
Braz J Microbiol. 2025 Mar;56(1):137-154. doi: 10.1007/s42770-024-01566-w. Epub 2024 Nov 22.
10
gen. nov., sp. nov., an anaerobic, obligately syntrophic archaeon, the first isolate of the lineage 'Asgard' archaea, and proposal of the new archaeal phylum phyl. nov. and kingdom regn. nov.属名. 新种名., 一种厌氧、专性共培养古菌，是'Asgard'古菌谱系的第一个分离株，并提出新的古菌门和新的王国。
Int J Syst Evol Microbiol. 2024 Jul;74(7). doi: 10.1099/ijsem.0.006435.

本文引用的文献

1
Complete genome sequence of sp. strain LG18, an L-glucose-utilizing bacterium isolated from soil.从土壤中分离出的利用L-葡萄糖的细菌——sp. 菌株LG18的全基因组序列。
Microbiol Resour Announc. 2024 Mar 12;13(3):e0088823. doi: 10.1128/mra.00888-23. Epub 2024 Feb 14.
2
CheckM2: a rapid, scalable and accurate tool for assessing microbial genome quality using machine learning.CheckM2：一种使用机器学习快速、可扩展且准确评估微生物基因组质量的工具。
Nat Methods. 2023 Aug;20(8):1203-1212. doi: 10.1038/s41592-023-01940-w. Epub 2023 Jul 27.
3
Assembly of long, error-prone reads using repeat graphs.
使用重复图组装长的、易错的读取。
Nat Biotechnol. 2019 May;37(5):540-546. doi: 10.1038/s41587-019-0072-8. Epub 2019 Apr 1.
4
Bandage: interactive visualization of de novo genome assemblies.绷带：从头基因组组装的交互式可视化
Bioinformatics. 2015 Oct 15;31(20):3350-2. doi: 10.1093/bioinformatics/btv383. Epub 2015 Jun 22.
5
Prokka: rapid prokaryotic genome annotation.Prokka：快速的原核生物基因组注释。
Bioinformatics. 2014 Jul 15;30(14):2068-9. doi: 10.1093/bioinformatics/btu153. Epub 2014 Mar 18.
6
An L-glucose catabolic pathway in Paracoccus species 43P.副球菌属 43P 中的 L-葡萄糖分解代谢途径。
J Biol Chem. 2012 Nov 23;287(48):40448-56. doi: 10.1074/jbc.M112.403055. Epub 2012 Oct 4.
7
Shifting the genomic gold standard for the prokaryotic species definition.动摇原核生物种定义的基因组黄金标准。
Proc Natl Acad Sci U S A. 2009 Nov 10;106(45):19126-31. doi: 10.1073/pnas.0906412106. Epub 2009 Oct 23.
8
THE UTILIZATION OF L-GLUCOSE BY MAMMALIAN TISSUES AND BACTERIA.哺乳动物组织和细菌对 L-葡萄糖的利用。
Science. 1940 Aug 2;92(2379):112-3. doi: 10.1126/science.92.2379.112.
9
DNA-DNA hybridization values and their relationship to whole-genome sequence similarities.DNA-DNA杂交值及其与全基因组序列相似性的关系。
Int J Syst Evol Microbiol. 2007 Jan;57(Pt 1):81-91. doi: 10.1099/ijs.0.64483-0.