Suppr超能文献

用于动物文化数据库的网络应用程序以及使用Shiny部署比较性状数据库的模板。

A Web App for the Animal Culture Database and a Template for Deploying Comparative Trait Databases With Shiny.

作者信息

Basava Kiran, Román-Palacios Cristian

机构信息

College of Information Science University of Arizona Tucson Arizona USA.

出版信息

Ecol Evol. 2025 Aug 19;15(8):e71913. doi: 10.1002/ece3.71913. eCollection 2025 Aug.

Abstract

There is a large and growing number of trait databases in ecology and evolution. Structured and open-access data repositories are important resources for allowing researchers to explore, visualize, and download such data for analysis. In this paper, we detail the design and structure of a simple Shiny web app intended to deploy trait databases as interactive web platforms. Using the Animal Culture Database (ACDB) as a case study, we highlight the web app's functionality and potential transversal applications for research and deploying other databases. The ACDB is a resource compiling socially transmitted traditions across the animal tree of life. It integrates multiple linked tables with explicit geospatial information, enabling data visualization and analysis of cultural behaviors across diverse taxa. The web app, accessible at https://datadiversitylab.github.io/ACDB/, provides users with an intuitive interface to explore the latest version of the database, including population-level data, behavioral descriptions, and geographic distributions. The code to deploy this web app, and a simplified version to deploy a basic template version, are available on the GitHub repositories https://github.com/datadiversitylab/ACDB and https://github.com/datadiversitylab/generic_shiny_data respectively.

摘要

在生态学和进化领域,存在大量且数量不断增加的性状数据库。结构化且开放获取的数据存储库是重要资源,可让研究人员探索、可视化并下载此类数据以进行分析。在本文中,我们详细介绍了一个简单的Shiny网络应用程序的设计和结构,该应用程序旨在将性状数据库部署为交互式网络平台。以动物文化数据库(ACDB)为例,我们突出了该网络应用程序的功能以及在研究和部署其他数据库方面的潜在横向应用。ACDB是一个汇编动物生命树中社会传播传统的资源。它整合了多个带有明确地理空间信息的链接表,能够对不同分类群的文化行为进行数据可视化和分析。该网络应用程序可通过https://datadiversitylab.github.io/ACDB/访问,为用户提供了一个直观的界面来探索数据库的最新版本,包括种群水平数据、行为描述和地理分布。用于部署此网络应用程序的代码以及用于部署基本模板版本的简化版本,分别可在GitHub存储库https://github.com/datadiversitylab/ACDB和https://github.com/datadiversitylab/generic_shiny_data上获取。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/2720/12365390/0a0ab8ecbc81/ECE3-15-e71913-g001.jpg

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验