• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

比对服务:创建和处理不限长度序列的比对。

ALIGNMENT SERVICE: creation and processing of alignments of sequences of unlimited length.

作者信息

Resenchuk S M, Blinov V M

机构信息

Institute of Molecular Biology, Koltsovo, Novosibirsk region, Russia.

出版信息

Comput Appl Biosci. 1995 Feb;11(1):7-11. doi: 10.1093/bioinformatics/11.1.7.

DOI:10.1093/bioinformatics/11.1.7
PMID:7796277
Abstract

A package for the creation and processing of multiple sequence alignment is described. There is no limit on the lengths of the processed nucleotide or amino acid sequences, and the number of sequences in the alignment is also unlimited. The main groups of functions are: a semiautomatic alignment editor; a wide set of functions for technical processing of alignments; nucleotide alignment mapping and translation; and similarity search functions. A user-friendly interface and a set of generally used file actions provide a special operational subsystem for everyday tasks.

摘要

描述了一个用于创建和处理多序列比对的程序包。对所处理的核苷酸或氨基酸序列的长度没有限制,比对中的序列数量也没有限制。主要功能组包括:半自动比对编辑器;用于比对技术处理的一系列广泛功能;核苷酸比对映射和翻译;以及相似性搜索功能。用户友好的界面和一组常用的文件操作提供了一个用于日常任务的特殊操作子系统。

相似文献

1
ALIGNMENT SERVICE: creation and processing of alignments of sequences of unlimited length.比对服务:创建和处理不限长度序列的比对。
Comput Appl Biosci. 1995 Feb;11(1):7-11. doi: 10.1093/bioinformatics/11.1.7.
2
SeqTools: visual tools for manual analysis of sequence alignments.SeqTools:用于手动分析序列比对的可视化工具。
BMC Res Notes. 2016 Jan 22;9:39. doi: 10.1186/s13104-016-1847-3.
3
COMPAM :visualization of combining pairwise alignments for multiple genomes.COMPAM:多个基因组两两比对结果合并的可视化工具。
Bioinformatics. 2006 Jan 15;22(2):242-4. doi: 10.1093/bioinformatics/bti759. Epub 2005 Nov 3.
4
GenoMiner: a tool for genome-wide search of coding and non-coding conserved sequence tags.基因挖掘器:一种用于全基因组搜索编码和非编码保守序列标签的工具。
Bioinformatics. 2006 Feb 15;22(4):497-9. doi: 10.1093/bioinformatics/bti754. Epub 2005 Nov 2.
5
Miropeats: graphical DNA sequence comparisons.Miropeats:图形化DNA序列比较
Comput Appl Biosci. 1995 Dec;11(6):615-9. doi: 10.1093/bioinformatics/11.6.615.
6
SeqVis: visualization of compositional heterogeneity in large alignments of nucleotides.SeqVis:核苷酸大型比对中组成异质性的可视化
Bioinformatics. 2006 Sep 1;22(17):2162-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btl283. Epub 2006 Jun 9.
7
DNAAlignEditor: DNA alignment editor tool.DNA比对编辑器:DNA比对编辑工具。
BMC Bioinformatics. 2008 Mar 19;9:154. doi: 10.1186/1471-2105-9-154.
8
MacVector: aligning sequences.MacVector:序列比对
Methods Mol Biol. 1994;25:203-14. doi: 10.1385/0-89603-276-0:203.
9
PATMAT: a searching and extraction program for sequence, pattern and block queries and databases.PATMAT:一个用于序列、模式和模块查询及数据库的搜索与提取程序。
Comput Appl Biosci. 1992 Jun;8(3):249-54. doi: 10.1093/bioinformatics/8.3.249.
10
Using CLUSTAL for multiple sequence alignments.使用CLUSTAL进行多序列比对。
Methods Enzymol. 1996;266:383-402. doi: 10.1016/s0076-6879(96)66024-8.

引用本文的文献

1
Multiplex PCR detection and species differentiation of orthopoxviruses pathogenic to humans.对人类致病的正痘病毒的多重PCR检测及种属鉴别
Mol Cell Probes. 2005 Feb;19(1):1-8. doi: 10.1016/j.mcp.2004.07.004.
2
Analysis of the monkeypox virus genome.猴痘病毒基因组分析。
Virology. 2002 Jun 5;297(2):172-94. doi: 10.1006/viro.2002.1446.
3
Human monkeypox and smallpox viruses: genomic comparison.人类猴痘病毒和天花病毒:基因组比较
FEBS Lett. 2001 Nov 30;509(1):66-70. doi: 10.1016/s0014-5793(01)03144-1.
4
Species-specific differences in the structure of orthopoxvirus complement-binding protein.正痘病毒补体结合蛋白结构中的种属特异性差异。
Virus Res. 2001 Dec 4;81(1-2):39-45. doi: 10.1016/s0168-1702(01)00332-x.
5
The complete nucleotide sequence of the Popp (1967) strain of Marburg virus: a comparison with the Musoke (1980) strain.马尔堡病毒的波普(1967年)毒株的完整核苷酸序列:与穆索凯(1980年)毒株的比较。
Arch Virol. 1995;140(9):1589-600. doi: 10.1007/BF01322532.