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比对服务:创建和处理不限长度序列的比对。

ALIGNMENT SERVICE: creation and processing of alignments of sequences of unlimited length.

作者信息

Resenchuk S M, Blinov V M

机构信息

Institute of Molecular Biology, Koltsovo, Novosibirsk region, Russia.

出版信息

Comput Appl Biosci. 1995 Feb;11(1):7-11. doi: 10.1093/bioinformatics/11.1.7.

Abstract

A package for the creation and processing of multiple sequence alignment is described. There is no limit on the lengths of the processed nucleotide or amino acid sequences, and the number of sequences in the alignment is also unlimited. The main groups of functions are: a semiautomatic alignment editor; a wide set of functions for technical processing of alignments; nucleotide alignment mapping and translation; and similarity search functions. A user-friendly interface and a set of generally used file actions provide a special operational subsystem for everyday tasks.

摘要

描述了一个用于创建和处理多序列比对的程序包。对所处理的核苷酸或氨基酸序列的长度没有限制,比对中的序列数量也没有限制。主要功能组包括:半自动比对编辑器;用于比对技术处理的一系列广泛功能;核苷酸比对映射和翻译;以及相似性搜索功能。用户友好的界面和一组常用的文件操作提供了一个用于日常任务的特殊操作子系统。

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